Paquet : autodock-vina (1.2.5-2 et autres)

[ Paquet source : autodock-vina  ]

chargement de petites molécules jusqu'aux protéines

AutoDock Vina est un programme pour la découverte de médicaments, le chargement de molécules et l'affichage virtuel des bibliothèques de composés. Il offre des capacités multicœurs, de bonnes performances, une précision améliorée et est facile d'utilisation.

Le même institut développe également autodock, qui est très utilisé.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina : improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

Autres paquets associés à autodock-vina

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [non x32]

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  bibliothèque d'options de programmes pour C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [non x32]

  bibliothèque d'options de programmes pour C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  bibliothèque de système d'exploitation (par ex. gestion des diagnostics)

• dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  multitâche portable pour C++

• dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0) [non x32]

  multitâche portable pour C++

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• sug: autodock

  Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

• sug: autogrid

  Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur

Télécharger autodock-vina

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.2.5-2+b1	237,5 ko	728,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.2.5-2	261,0 ko	672,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.2.5-2	231,7 ko	660,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.2.5-2	239,1 ko	638,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.2.5-2	231,5 ko	474,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.2.5-2	247,2 ko	638,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.2.5-2	270,3 ko	698,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.2.5-2	290,5 ko	1 237,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.2.5-2	232,1 ko	666,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.2.5-2	231,3 ko	753,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.2.5-2	262,2 ko	916,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.2.5-2	265,9 ko	852,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.2.5-2	257,0 ko	576,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.2.5-2	255,1 ko	680,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.2.5-2	265,7 ko	659,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.2.5-2	217,1 ko	2 140,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.2.5-2	258,1 ko	634,0 ko	[liste des fichiers]