Paquet : unifrac-tools (1.4-3 et autres)

[ Paquet source : unifrac-tools  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Autres paquets associés à unifrac-tools

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée de la bibliothèque⋅C

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

  bibliothèque de l'algorithme de compression Fast LZ –⋅exécutable

• dep: libssu0

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libsz2 (>= 1.1.3)

  bibliothèque de codage entropique adaptatif — SZIP

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger unifrac-tools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64	1.4-3+b2	1 743,7 ko	7 082,0 ko	[liste des fichiers]