Paquets logiciels dans « sid », Sous-section science

3depict (0.0.22-1.2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 0.0.19-1+b1 [hppa, sparc64], 0.0.13-1 [sh4])
visualisation et analyse pour des données de point à valeurs uniques
abacas (1.3.1-5)
fermeture d'espaces dans des alignements génomiques depuis des lectures courtes
abinit (8.10.3-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 8.10.2-2 [alpha], 8.8.4-2 [powerpcspe])
paquet pour les calculs de structure électronique
abyss (2.2.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2.2.2-1 [sparc64], 2.1.5-7 [powerpcspe], 2.1.0-1 [hppa])
assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes
acedb-other (4.9.39+dfsg.02-4)
Récupération d'ADN ou de séquences de protéines
acedb-other-belvu (4.9.39+dfsg.02-4 [all], 4.9.39+dfsg.01-5 [arm64])
paquet de transition pour belvu
acedb-other-belvu
paquet virtuel fourni par belvu
acedb-other-dotter (4.9.39+dfsg.02-4 [all], 4.9.39+dfsg.01-5 [arm64])
paquet de transition pour dotter
acedb-other-dotter
paquet virtuel fourni par dotter
aces3 (3.0.8-6+b1 [amd64], 3.0.8-6 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.0.8-5.1+b3 [powerpcspe])
concepts avancés en structure électronique III
aces3-data (3.0.8-6)
concepts avancés en structure électronique III
achilles (2-9)
simulateur de vie artificielle et d'évolution
adapterremoval (2.3.1-1 [alpha, amd64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, sh4, sparc64, x32], 2.2.4-1 [arm64, armel, armhf, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x])
découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes
adapterremoval-examples (2.3.1-1)
découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes – données d'exemple
adms (2.3.6-2)
synthétiseur automatique de modèle de périphérique pour Verilog-AMS
adun-core (0.81-13)
simulateur moléculaire
aegean (0.16.0+dfsg-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 0.15.1+dfsg-1 [hppa], 0.14.1+dfsg2-2 [m68k], 0.14.1+dfsg-1 [alpha])
boîte d’amalgame d’outils d'analyse de génome
aeskulap (0.2.2-beta2+git20190406.ef77f01-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.2.2-beta2+git20180219.8787e95-2 [powerpcspe], 0.2.2b1-13 [m68k, sh4, sparc64])
Afficheur d'images médicales et client réseau DICOM
aevol (5.0+ds-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 5.0-2+b1 [powerpcspe])
modèle numérique de génétique pour lancer des expériences d'évolution in silico
aghermann (1.1.2-2)
gestionnaire d'expérimentation de recherche sur le sommeil
aladin (10.076+dfsg-1)
atlas interactif du ciel pour des images et ensembles de données astronomiques
alfa (1.0-3+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0-3+b1 [powerpcspe])
algorithme d'ajustement de ligne automatisé
algotutor (0.8.6-3)
programme d'observation des étapes intermédiaires d'un algorithme
alien-hunter (1.7-7)
Distribution des motifs d'ordre variable (IVOM) pour identifier l'ADN acquis par transfert horizontal
altree (1.3.1-8 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.3.1-7+b2 [alpha])
programme pour faire de l'association basée sur la phylogénétique et l'analyse de localisation
altree-examples (1.3.1-8)
fichiers d'exemple pour ALTree
amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-1)
alignement multiple de séquences protéiques par appariement
ampliconnoise (1.29-8)
suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454
andi (0.12-4)
estimation efficace de distances d'évolution
anfo (0.98-7+b2 [riscv64], 0.98-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
aligneur/mappeur de lectures courtes à partir de MPG
ants (2.1.0-5+b1 [amd64, i386], 1.9.2+svn680.dfsg-4 [alpha, ppc64, x32], 1.9+svn532-5 [hppa])
outils de normalisation élaborés pour l'analyse d'images du cerveau
aoflagger (2.14.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.13.0-1+b2 [powerpcspe])
découverte des RFI dans les observations radioastronomiques
apbs (1.4-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.4-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
Solveur adaptatif de Poisson Boltzmann
apertium-af-nl (0.2.0~r58256-2)
données Apertium pour les traductions entre l'afrikaans et le néerlandais
apertium-anaphora (0.0.4-1)
Anaphora resolution module
apertium-apy (0.11.5-1 [all], 0.1.0~r61425-1+b1 [ppc64], 0.1.0~r61425-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32])
service APY d'Apertium
apertium-arg (0.1.2~r65494-2)
données simples Apertium pour l'aragonais
apertium-arg-cat (0.1.0~r64925-2)
données Apertium pour les traductions entre l'aragonais et le catalan
apertium-bel (0.1.0~r81357-2)
données d’Apertium pour uniquement le biélorusse
apertium-bel-rus (0.2.0~r81186-2)
données d’Apertium pour les traductions entre le biélorusse et le russe
apertium-br-fr (0.5.0~r61325-3)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le breton et le français
apertium-ca-it (0.1.1~r57554-2)
données Apertium pour les traductions entre le catalan et l'italien
apertium-cat (2.6.0-1)
données simples Apertium pour le catalan
apertium-cat-srd (1.0.0~r82995-2)
données d'Apertium pour les traductions entre le catalan et le sarde
apertium-crh (0.2.0~r83161-2)
données d’Apertium pour uniquement le tatar de Crimée
apertium-crh-tur (0.3.0~r83159-2)
données Apertium pour les traductions entre le tatar de Crimée et le turc
apertium-cy-en (0.1.1~r57554-4)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le gallois et l'anglais
apertium-dan (0.6.0-2)
données linguistiques simples Apertium pour le danois
apertium-dan-nor (1.4.1-1)
Apertium translation data for the Danish-Norwegian pair
apertium-dev (3.6.1-1+b1 [amd64], 3.6.1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.5.2-1 [powerpcspe])
outils et bibliothèque de développement pour Apertium
apertium-en-gl (0.5.2~r57551-2)
données Apertium pour les traductions entre l'anglais et le galicien
apertium-eo-en (1.0.0~r63833-2)
données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et l'anglais
apertium-eo-fr (0.9.0~r57551-2)
données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et le français
apertium-es-ast (1.1.0~r51165-2)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'asturien
apertium-es-it (0.2.0~r78826-2)
paquet factice de transition pour apertium-spa-ita
apertium-eu-en (0.3.1~r56205-2)
données Apertium pour les traductions entre le basque et l'anglais
apertium-eval-translator (1.2.1-2)
Evaluate machine translation output against reference
apertium-fra (1.5.0-1)
données particulières d’Apertium pour le français
apertium-fra-cat (1.7.0-1)
données Apertium pour les traductions entre le français et le catalan
apertium-hbs (0.5.0~r68212-3)
données simples Apertium pour le serbo-croate
apertium-hbs-eng (0.1.0~r57598-2)
données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et l'anglais
apertium-hbs-mkd (0.1.0~r76450-3)
données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le macédonien
apertium-hbs-slv (0.1.0~r59294-2)
données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le slovénien
apertium-hin (0.1.0~r59158-2)
données simples Apertium pour le hindi
apertium-id-ms (0.1.1~r57551-2)
données Apertium pour les traductions entre l'indonésien et le malais
apertium-is-sv (0.1.0~r76450-2)
données Apertium pour les traductions entre l'islandais et le suédois
apertium-isl (0.1.0~r65494-2)
données simples Apertium pour l'islandais
apertium-isl-eng (0.1.0~r66083-2)
données Apertium pour les traductions entre l'islandais et l'anglais
apertium-ita (0.10.0~r82237-2)
données simples Apertium pour l'italien
apertium-kaz (0.1.0~r61338-2)
données simples Apertium pour le kazakh
apertium-kaz-tat (0.2.1~r57554-2)
données Apertium pour les traductions entre le kazakh et le tatar
apertium-lex-tools (0.2.3-1+b1 [amd64], 0.2.3-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.2.1-1 [powerpcspe])
Constraint-based lexical selection module
apertium-mk-bg (0.2.0~r49489-2)
données Apertium pour les traductions entre le macédonien et le bulgare
apertium-mk-en (0.1.1~r57554-2)
données Apertium pour les traductions entre le macédonien et l'anglais
apertium-mlt-ara (0.2.0~r62623-2)
données Apertium pour les traductions entre le maltais et l'arabe
apertium-nno (1.0.0-2)
données linguistiques simples Apertium pour le norvégien Nynorsk
apertium-nno-nob (1.3.0-1)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le norvégien Nynorsk et le norvégien Bokmål
apertium-nob (1.0.0-2)
données linguistiques simples Apertium pour le norvégien Bokmål
apertium-oci (0.1.0-1)
données particulières d’Apertium pour l’occitan
apertium-pol (0.1.1-2)
données particulières d’Apertium pour le polonais
apertium-recursive (0.0.1-1+b1 [amd64], 0.0.1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
Apertium recursive structural transfer module
apertium-rus (0.2.0~r82706-1)
données d’Apertium pour uniquement le russe
apertium-separable (0.3.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.3.2-1 [powerpcspe])
réordonnancement de multimots séparables ou non contigus
apertium-sme-nob (0.6.0~r61921-2)
données Apertium pour les traductions entre le sámi et le bokmål
apertium-spa (1.1.0~r79716-2)
données simples Apertium pour l'espagnol
apertium-spa-arg (0.4.0~r64399-2)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'aragonais
apertium-spa-cat (2.2.0-1)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et le catalan
apertium-spa-ita (0.2.0~r78826-2)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'italien
apertium-srd (1.2.0~r82994-2)
données simples Apertium pour le sarde
apertium-srd-ita (0.9.5~r82237-2)
données Apertium pour les traductions entre le sarde et l'italien
apertium-swe (0.8.0-2)
données linguistiques Apertium pour le suédois uniquement
apertium-swe-dan (0.8.1-1)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le suédois et le danois
apertium-swe-nor (0.3.1-1)
données Apertium pour les traductions entre le suédois et le norvégien
apertium-szl (0.1.0-1)
données particulières d’Apertium pour le silésien
apertium-tat (0.1.0~r60887-2)
données simples Apertium pour le tatar
apertium-tur (0.2.0~r83161-2)
données d’Apertium pour uniquement le turc
apertium-ukr (0.1.0~r82563-2)
données d’Apertium pour uniquement l’ukrainien
apertium-urd (0.1.0~r61311-2)
données simples Apertium pour l’ourdou
apertium-urd-hin (0.1.0~r64379-2)
données Apertium pour les traductions entre l'ourdou et le hindi
aragorn (1.2.38-2+b1 [amd64], 1.2.38-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
détection ARNt et ARNtm dans les séquences de nucléotides
arb (6.0.6-4) [non-free]
phylogenetic sequence analysis suite - main program
arb-common (6.0.6-4) [non-free]
phylogenetic sequence analysis suite - common files
arden (1.0-5 [all], 1.0-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, sparc64, x32], 1.0-1 [arm64])
contrôle de spécificité pour les alignements de lecture utilisant une référence artificielle
ariba (2.14.4+ds-1)
identification de résistance antibiotique par assemblage
art-nextgen-simulation-tools (20160605+dfsg-3)
outils de simulation pour créer des lectures de séquençage synthétiques de nouvelle génération
art-nextgen-simulation-tools-profiles (20160605+dfsg-3)
profils pour les outils de simulation ART
artemis (17.0.1+dfsg-2)
navigateur de génome et outil d'annotation
artfastqgenerator (0.0.20150519-3)
création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence
artfastqgenerator-examples (0.0.20150519-3)
création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence – exemples
asdftool (2.4.2-2)
outil en ligne de commande pour manipuler les fichiers de données scientifiques ASDF
ase (3.18.1-1)
environnement de simulation atomique
ask (1.1.1-3)
kit d'échantillonage pour grands espaces expérimentaux
assemblytics (1.0+ds-2)
détection et analyse de variantes structurelles à partir d’un assemblage de génome
astro-tasks (2.1)
mélange exclusif Debian Astronomy (tâches de tasksel)
astromatic (1.2)
collection logicielle d'infrastructure astronomique
astrometry-data-2mass (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader
astrometry-data-2mass-00 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (2'-2.8')
astrometry-data-2mass-01 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (2.8'-4')
astrometry-data-2mass-02 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (4'-5.6')
astrometry-data-2mass-03 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (5.6'-8')
astrometry-data-2mass-04 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (8'-11')
astrometry-data-2mass-05 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (11'-16')
astrometry-data-2mass-06 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (16'-22')
astrometry-data-2mass-07 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (22'-30')
astrometry-data-2mass-08-19 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (30'-2000')
astrometry-data-tycho2 (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net
astrometry-data-tycho2-07 (2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2-3 [sparc64])
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
astrometry-data-tycho2-07-bigendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
astrometry-data-tycho2-07-littleendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
astrometry-data-tycho2-08 (2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2-3 [sparc64])
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
astrometry-data-tycho2-08-bigendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
astrometry-data-tycho2-08-littleendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
astrometry-data-tycho2-09 (2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2-3 [sparc64])
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
astrometry-data-tycho2-09-bigendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
astrometry-data-tycho2-09-littleendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
astrometry-data-tycho2-10-19 (2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2-3 [sparc64])
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
astrometry-data-tycho2-10-19-bigendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
astrometry-data-tycho2-10-19-littleendian (2-4)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
astrometry.net (0.78+dfsg-3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.78+dfsg-2 [m68k, sh4], 0.78+dfsg-1+b1 [alpha], 0.76+dfsg-3 [powerpcspe])
solveur de plaque photographique astrométrique
astronomical-almanac (5.6-6+b1 [amd64], 5.6-6 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
almanach astronomique - calcul de positions d'étoiles et de planètes
astropy-utils (3.2.3-3)
outils en ligne de commande d'astropy
atac (0~20150903+r2013-6+b1 [amd64], 0~20150903+r2013-6 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
comparaison de génomes d'assemblage en assemblage
atropos (1.1.24+dfsg-1)
Outil de taille de lecture NGS spécifique, sensible et rapide
augustus (3.3.3+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.3.2+dfsg-2 [powerpcspe])
prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
augustus-data (3.3.3+dfsg-2)
fichiers de données pour AUGUSTUS
autodock (4.2.6-6)
Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine
autodock-getdata (4.2.6-6)
instructions pour collecter des données pour getData
autodock-test (4.2.6-6)
fichiers de test pour AutoDock
autodock-vina (1.1.2-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.1.2-5 [x32])
chargement de petites molécules jusqu'aux protéines
autodocktools (1.5.7-4) [non-free]
GUI to help set up, launch and analyze AutoDock dockings
autogrid (4.2.6-6)
Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur
autogrid-test (4.2.6-6)
fichiers de test pour AutoGrid
avce00 (2.0.0-7+b1 [amd64], 2.0.0-7 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
conversion de couverture vectorielle Arcinfo d’ESRI (binaire) au format E00
avogadro (1.2.0-4+b2 [powerpcspe], 1.0.3-10.1 [arm64]) [debports]
système de modélisation et d'imagerie moléculaire
aweather (0.8.1-1.1+b1 [powerpcspe], 0.8.1-1 [arm64]) [debports]
programme évolué de surveillance de la météo
axe-demultiplexer (0.3.3+dfsg-1)
démultiplexeur de lecture de séquence ADN basé sur les arbres préfixes
bagel (1.2.2-1)
paquet de chimie computationnelle
baitfisher (1.2.7+git20180107.e92dbf2+dfsg-1)
paquet logiciel de conception de sondes d'enrichissement hybrides
bali-phy (3.4.1+dfsg-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.4.1+dfsg-1 [alpha])
inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie
ballview (1.5.0+git20180813.37fc53c-3 [alpha, amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4.3~beta1-4 [powerpcspe])
modélisation moléculaire (libre) et outil graphique moléculaire
bamtools (2.5.1+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2.4.0+dfsg-3+b1 [sparc64])
boîte à outils de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
bandage (0.8.1-1+b2 [amd64], 0.8.1-1+b1 [arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.8.1-1 [alpha, armel, armhf, powerpcspe])
navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo
barrnap (0.9+dfsg-1)
prédiction ribosomale rapide d'ARN
bart (0.5.00-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.4.04-2 [powerpcspe], 0.4.02-2 [riscv64])
outils pour l'imagerie par résonance magnétique computationnelle
bart-view (0.1.00-2+b1 [amd64], 0.1.00-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
visualisateur de données multidimensionnelles et de valeur complexe
bbmap (38.73+dfsg-1)
short read aligner and other bioinformatic tools
bbmap-jni (38.73+dfsg-1)
short read aligner and other bioinformatic tools - JNI library
bcbio (1.1.8-1) [contrib]
boîte à outils d’analyse de données de séquençage à haut débit
bcftools (1.9-1)
appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF
beads (1.1.18+dfsg-4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1.1.18+dfsg-3 [alpha, m68k, riscv64, x32], 1.1.18+dfsg-2 [ppc64], 1.1.18+dfsg-1 [hppa])
détection par électrophorèse bidimensionnelle de tâche d’images de gel
beagle (5.1-191120+dfsg-1)
appel de génotype, phasage de génotype et attribution de marqueurs non génotypés
beast-mcmc (1.10.4+dfsg-2)
inférence phylogénétique bayésienne MCMC
beast2-mcmc (2.6.0+dfsg-1)
inférence phylogénétique bayésienne MCMC
bedops (2.4.37+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.4.36+dfsg-1 [riscv64], 2.4.35+dfsg-1 [m68k, powerpcspe], 2.4.26+dfsg-1 [sh4])
opérations génomiques à haute performance
bedtools (2.29.0+dfsg-2 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 2.27.1+dfsg-4 [armel, armhf, mipsel], 2.27.1+dfsg-3 [alpha, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4], 2.26.0+dfsg-5 [ppc64, sparc64, x32], 2.26.0+dfsg-3 [hppa])
suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
bedtools-test (2.29.0+dfsg-2)
données de test pour le paquet bedtools
belvu (4.44.1+dfsg-3)
visualisateur d’alignements de séquences multiples et outil phylogénétique
belvu
paquet virtuel fourni par acedb-other-belvu
berkeley-express (1.5.3+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.5.2+dfsg-1+b2 [alpha, powerpcspe])
quantification de streaming pour le séquençage à taux élevé
bibus (1.5.2+dfsg-1)
base de données bibliographiques
bio-eagle (2.4.1-1)
phasage d'haplotype au sein d'une cohorte génotypée ou grâce à un panel phasé de référence
bio-eagle-examples (2.4.1-1)
exemples pour bio-eagle
bio-rainbow (2.0.4+dfsg-1)
partitionnement et assemblage de séquences courtes pour la bio-informatique
biobambam2 (2.0.147+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, ppc64el], 2.0.137+dfsg-1 [mips64el, riscv64], 2.0.95-1 [armel, armhf, i386])
tools for early stage alignment file processing
biogenesis (0.8-3)
programme de vie artificielle pour simuler l’évolution d’organismes
bioperl (1.7.6-3)
outils en Perl pour la bio-informatique
bioperl-run (1.7.3-1)
scripts d'enveloppe BioPerl
biosig-tools (1.9.3-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.3.0-2.2+b1 [hppa, sparc64], 1.3.0-2.2 [powerpcspe], 1.3.0-2 [sh4])
outils de conversion entre différents formats de données médicales
biosquid (1.9g+cvs20050121-11)
utilitaire d'analyse de séquences biologiques
biosyntax (1.0.0b-1)
coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – métapaquet
biosyntax-common (1.0.0b-1)
coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – fichiers communs
biosyntax-example (1.0.0b-1)
coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – exemple
biosyntax-gedit (1.0.0b-1)
coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon gedit
biosyntax-less (1.0.0b-1)
coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon less
biosyntax-vim (1.0.0b-1)
coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon vim
bist (0.5.2-1.1+b4 [mips64el], 0.5.2-1.1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.5.2-1.1+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32], 0.5.2-1.1+b1 [riscv64])
outil de dessin chimique
bitseq (0.7.5+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.7.5+dfsg-4 [powerpcspe])
inférence bayésienne de transcripts à partir de données de séquençage
bitwise (0.40-1)
Interactive bitwise operation in ncurses
bkchem (0.13.0-6)
éditeur de structures chimiques
blasr (5.3.3+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64], 5.3.3+dfsg-1+b1 [m68k, sh4], 5.3.2+dfsg-1.1 [powerpcspe], 5.3-1+b1 [x32], 0~20150724+git3ca7fe8-1+b2 [hppa, ppc64])
correspondance de lectures de séquençage de molécules simples
blast2 (1:2.9.0-2 [all], 1:2.2.26.20120620-8 [arm64])
paquet factice de transition vers ncbi-blast+-legacy
blimps-utils (3.9+ds-1) [non-free]
blocks database improved searcher
blixem (4.44.1+dfsg-3)
navigateur interactif d’alignements de séquences
bmt (0.6-1)
boîte à outils de mesure de performances d'analyse logicielle
bodr (10-2)
dépôt de données Blue Obelisk
boinc-app-eah-brp (0.20170426+dfsg-10+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 0.20170426+dfsg-10 [hppa], 0.20170426+dfsg-2+b2 [sh4])
extension BOINC pour la recherche de pulsars binaires Einstein@Home
boinc-app-milkyway (0.18d-4) [debports]
Milkyway@home application for the BOINC client
boinc-app-seti (8.00~svn4035-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 8.00~svn3725-3 [powerpcspe])
application SETI@home pour le client BOINC
boinc-app-seti-graphics (8.00~svn4035-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 8.00~svn3725-3 [powerpcspe])
application SETI@home pour le client BOINC − interface graphique
bolt-lmm (2.3.4+dfsg-1)
test efficace d’association de modèles mixtes bayésiens sur tout le génome de grandes cohortes
bolt-lmm-example (2.3.4+dfsg-1)
exemples pour bolt-lmm
boolector (1.5.118.6b56be4.121013-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.5.118.6b56be4.121013-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
solveur SMT pour les vecteurs de bits et les tableaux
bowtie (1.2.3+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.0.1-2 [x32], 1.0.0-6 [hppa, sh4])
aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
bowtie-examples (1.2.3+dfsg-2)
exemples pour bowtie, l'aligneur de lectures courtes ultra rapide et efficace en mémoire
bowtie2 (2.3.5.1-1)
aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
bowtie2-examples (2.3.5.1-1)
exemples pour bowtie2
boxshade (3.3.1-13 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.3.1-12 [powerpcspe])
Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
bppphyview (0.6.1-1+b1 [amd64, x32], 0.6.1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64])
afficheur phylogénétique pour Bio++
bppsuite (2.4.1-1)
suite de programmes Bio++
bppsuite-examples (2.4.1-1)
exemples pour la suite de programmes Bio++
brig (0.95+dfsg-2)
générateur d'images circulaires BLAST
bwa (0.7.17-3 [amd64], 0.7.5a-1 [x32], 0.6.2-1 [alpha, m68k, ppc64, sh4, sparc64], 0.5.9-2 [hppa])
dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
cafeobj (1.5.9-1+b1 [amd64], 1.5.9-1 [arm64, armhf, i386, ppc64el])
langage de spécification et programmation algébrique de nouvelle génération
cafeobj-mode (1.5.9-1)
mode majeur Emacs pour modifier du code source CafeOBJ
caffe-cpu (1.0.0+git20180821.99bd997-4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 1.0.0+git20180821.99bd997-3+b1 [alpha, ppc64], 1.0.0-5 [hppa, m68k], 1.0.0-3+b1 [powerpcspe, sh4, x32])
cadriciel ouvert et rapide d'apprentissage profond –⋅méta-paquet
caffe-tools-cpu (1.0.0+git20180821.99bd997-4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 1.0.0+git20180821.99bd997-3+b1 [alpha, ppc64], 1.0.0-5 [hppa, m68k], 1.0.0-3+b1 [powerpcspe, sh4, x32])
outils pour le cadriciel ouvert et rapide d'apprentissage profond –⋅CPU_ONLY
caftools (2.0.2-2) [non-free]
maintenance of DNA sequence assemblies
cain (1.10+dfsg-3)
simulations de réactions chimiques
cain-examples (1.10+dfsg-3)
exemples pour cain
cain-solvers (1.10+dfsg-3)
solveurs pour cain
calculix-ccx (2.11-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 2.11-1+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64, x32], 2.11-1+b1 [riscv64])
programme d'éléments finis structurels en trois dimensions
calculix-cgx (2.11+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 2.11+dfsg-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
pré et postprocesseur tridimensionnel pour les modèles à éléments finis
camitk-actionstatemachine (4.1.2-3 [amd64, i386], 3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64])
application pour rejouer les flux d'actions pour la bibliothèque CamiTK
camitk-config (4.1.2-3)
boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – configuration
camitk-imp (4.1.2-3 [amd64, i386], 3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64])
banc de test pour la bibliothèque CamiTK
canu (1.9+dfsg-1 [amd64, ppc64el], 1.6+dfsg-1 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes
caret (5.6.4~dfsg.1-3) [debports]
outil d'edition et de reconstruction anatomique assistées par ordinateur
casacore-data-igrf (12-1)
données de champ de référence géomagnétique international pour casacore
casacore-data-jpl-de200 (2007.07.05-1)
éphéméride de développement DE200 du Jet Propulsion Laboratory pour casacore
casacore-data-jpl-de405 (2007.07.05-1)
éphéméride de développement DE405 du Jet Propulsion Laboratory pour casacore
casacore-data-lines (0+git2016.11.26-2)
table de fréquences de ligne spectrale pour casacore
casacore-data-observatories (0+git2018.12.08-1)
table des coordonnées d'observatoires radio
casacore-data-sources (2-2)
table de coordonnées de sources de référence ICRF2 pour casacore
casacore-data-tai-utc (1.2 [all], 1.0 [hppa, x32])
table de différente entre TAI et UTC pour casacore
casacore-tools (3.0.0-4+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.0.0-4 [powerpcspe])
outils construits avec CASA
cassbeam (1.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1-1 [powerpcspe])
modélisation des antennes Cassegrain
cassiopee (1.0.9-2)
outil d'indexation et de recherche dans les séquences génomiques
cba (0.3.6-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.3.6-4.1 [powerpcspe, sh4])
analyse de rayon continu
cbflib-bin (0.9.5.18+dfsg1-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.9.5.18+dfsg1-1 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
utilitaires de manipulation de fichiers CBF
cbmc (5.10-5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 5.6-1 [alpha, hppa])
vérificateur de modèle borné pour les programmes C et C++
cclib (1.6.2-1)
analyseurs et algorithmes pour la chimie computationnelle
cclib-data (1.1-1) [non-free]
Parsers and algorithms for computational chemistry (data files)
cct (20170919+dfsg-1)
comparaison visuelle de séquences bactériennes, de plasmides, de chloroplastes ou mitochondriales
cct-examples (20170919+dfsg-1)
données d’exemple pour tester le paquet cct
cd-hit (4.8.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 4.6.8-2 [powerpcspe])
suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
cdbfasta (0.99-20100722-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.99-20100722-5 [powerpcspe])
indexation avec Constant DataBase et outils de recherche pour les fichiers multi-FASTA
celestia-glut (1.6.1+dfsg-3.1) [debports]
real-time visual space simulation (GLUT frontend)
centrifuge (1.0.3-3)
système rapide et économe en mémoire de classification de séquences ADN
cernlib (20061220+dfsg3-4.4)
suite d'analyse de données CERNLIB -- méta-packet pour usage général
cernlib-core (20061220+dfsg3-4.4)
suite d'analyse de données CERNLIB — bibliothèques et programmes principaux
cernlib-extras (20061220+dfsg3-4.4)
suite d'analyse de données CERNLIB — programmes supplémentaires
cernlib-montecarlo (20061220+dfsg3-3.1)
bibliothèques Monte Carlo CERNLIB
cg3 (1.3.1-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.1.7-1+b1 [alpha, powerpcspe, x32])
outils pour utiliser la troisième édition de Constraint Grammar (CG-3)
cg3-dev (1.3.1-2)
Metapackage providing both CG-3 CLI dev tools and dev library
cgns-convert (3.3.0-7 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.3.0-6+b2 [alpha], 3.3.0-6+b1 [powerpcspe])
système de notation générale CFD — outils de conversion
cgview (0.0.20100111-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.0.20100111-3 [hppa])
visionneuse de génome circulaire
ch5m3d (1.2.5+dfsg-2)
création et visualisation de dessins en 3D de molécules simples
changeo (0.4.6-1)
boîte à outils d’affectation clonale de répertoire – Python 3
checkit-tiff (0.2.3-2)
vérificateur de conformité pour les images au format TIFF élémentaire
chemical-structures (2.2.dfsg.0-15)
jeu de structures moléculaires dans des formats ouverts
chemps2 (1.8.9-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 1.8.9-1+b1 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64], 1.8.9-1 [x32])
exécutable pour appeler libchemps2-3 depuis la ligne de commande
chemtool (1.6.14-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.6.14-3 [powerpcspe])
programme de dessin de structures chimiques
chimeraslayer (20101212+dfsg1-2)
détecte les simili-chimères dans les ADN amplifiés via réaction en chaîne par polymérase
choreonoid (1.5.0+dfsg-0.1+b1) [debports]
Integrated robotics GUI environment
choreonoid-plugins-base (1.5.0+dfsg-0.1+b1) [debports]
Integrated robotics GUI environment - core plug-ins
chromhmm (1.19+dfsg-1)
découverte et caractérisation d’état de chromatine
chromimpute (1.0.3+dfsg-1)
attribution d’épigénome systématique à grande échelle
circlator (1.5.6-1)
circularisation d'assemblages de génomes
circos (0.69.9+dfsg-1)
outil de dessin pour visualiser des données
circos-tools (0.23-1)
Traceur pour visualisation de données — utilitaires auxiliaires
ckon (0.7.1-3+b7 [sparc64], 0.7.1-3+b6 [ppc64], 0.7.1-3+b5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mipsel, ppc64el, s390x, sh4], 0.7.1-3+b4 [m68k, mips64el, powerpcspe, x32], 0.7.1-3+b2 [riscv64])
outil de compilation automatique pour le logiciel d'analyse de données ROOT
clearcut (1.0.9-4)
reconstruction d'arbre phylogénétique extrêmement efficace
clinica (0.3.0-1) [debports]
Simple medical records manager
clinica-dev (0.3.0-1) [debports]
Simple medical records manager (development files)
clinica-plugins (0.3.0-1) [debports]
Simple medical records manager (plugins)
clonalframe (1.2-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2-9 [powerpcspe])
inférence de microévolution bactérienne en utilisant des données de séquence multilocus
clonalframeml (1.11-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.11-2 [powerpcspe])
inférence efficace de recombinaison de génomes de bactéries entières
clonalorigin (1.0-3)
inférence de recombinaison homologue dans les bactéries grâce à des séquences de génomes entiers
clustalo (1.2.4-2)
programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines
clustalw (2.1+lgpl-6)
alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
clustalx (2.1+lgpl-8+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1+lgpl-8 [alpha, armel, armhf, riscv64], 2.1+lgpl-6 [powerpcspe])
alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
cluster3 (1.57-1) [non-free]
Reimplementation of the Eisen-clustering software
cmor-tables (3.3-1)
tables MIP pour la bibliothèque de réécriture de sortie de modèle de climat
cmtk (3.3.1p1+dfsg-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.3.1p1+dfsg-1 [alpha, powerpcspe])
boîte à outils de morphométrie computationnelle
cnrun (1.1.14-1) [debports]
NeuroML-capable neuronal network simulator
cnvkit (0.9.6-2)
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
cod-tools (2.6+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 2.4+dfsg-1 [powerpcspe], 2.2+dfsg-5 [alpha], 2.2+dfsg-1 [sparc64])
tools for manipulating CIF format files
code-aster-gui (1.13.1-2.1)
interface graphique pour Code_Aster – client
code-aster-run (1.13.1-2.1)
interface graphique pour Code_Aster - serveur
code-saturne (6.0.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 5.3.3+repack-5 [m68k, riscv64], 5.3.3+repack-2 [sparc64], 5.3.2+repack-1 [powerpcspe])
logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD)
code-saturne-bin (6.0.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 5.3.3+repack-5 [m68k, riscv64], 5.3.3+repack-2 [sparc64], 5.3.2+repack-1 [powerpcspe])
logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD) – exécutables
code-saturne-data (6.0.0-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – données
code-saturne-doc (6.0.0-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – documentation
code-saturne-include (6.0.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 5.3.3+repack-5 [m68k, riscv64], 5.3.3+repack-2 [sparc64], 5.3.2+repack-1 [powerpcspe])
logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – fichiers d'inclusion
codonw (1.4.4-4+b1 [amd64], 1.4.4-4 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
analyse de correspondance d'utilisation de codon
coinor-cbc (2.9.9+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.9.9+repack1-1 [powerpcspe])
solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR
coinor-clp (1.16.11+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.16.11+repack1-1 [powerpcspe])
solveur de programmation linéaire COIN-OR
coinor-csdp (6.1.1-1+b3 [hppa], 6.1.1-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 6.1.1-1+b1 [alpha, sh4], 6.1.1-1 [m68k, riscv64, sparc64, x32])
paquet de programmation semi-définie
coinor-libcbc3 (2.9.9+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.9.9+repack1-1 [powerpcspe])
solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR – bibliothèques partagées
coinor-libcgl0 (0.55.0-1.1) [debports]
Cut Generator Library, a library of cutting-plane generators
coinor-libcgl1 (0.59.10+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.59.10+repack1-1 [powerpcspe])
bibliothèque de génération de coupes COIN-OR
coinor-libclp0 (1.12.0-2.1) [debports]
Coin-or linear programming solver
coinor-libclp1 (1.16.11+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.16.11+repack1-1 [powerpcspe])
solveur de programmation linéaire COIN-OR – bibliothèques partagées
coinor-libcoinutils0 (2.6.4-3) [debports]
Coin-or collection of utility classes
coinor-libcoinutils3 (2.9.15-1) [debports]
collection de classes utilitaires de COIN-OR – exécutables et bibliothèques
coinor-libcoinutils3v5 (2.10.14+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.10.14+repack1-1 [powerpcspe])
collection de classes utilitaires de COIN-OR – exécutables et bibliothèques
coinor-libflopc++0 (1.0.6-3.1+b3 [mipsel], 1.0.6-3.1+b2 [alpha, amd64, armel, armhf, i386, ppc64, s390x, sparc64], 1.0.6-3.1+b1 [hppa, m68k, ppc64el, sh4, x32], 1.0.6-3.1 [arm64, mips64el, powerpcspe, riscv64])
formulation de problèmes d’optimisation linéaire en C++
coinor-libosi0 (0.103.0-1) [debports]
COIN-OR Open Solver Interface
coinor-libosi1 (0.106.9-1) [debports]
interface de solveur ouverte COIN-OR
coinor-libosi1v5 (0.107.9+repack1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.107.9+repack1-1 [powerpcspe])
interface de solveur ouverte COIN-OR
coinor-libsymphony0 (5.2.4-1.2) [debports]
COIN-OR solver for mixed-integer linear programs
coinor-libsymphony3 (5.6.16+repack1-1.1)
solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes – bibliothèques partagées
coinor-symphony (5.6.16+repack1-1.1)
solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes
colmap (3.6+dev2+git20191105-1 [amd64, i386, riscv64, s390x], 3.6+dev2-2 [alpha, ppc64, sparc64])
Structure-from-Motion et Multi-View Stereo
comet-ms (2018012-1+b1 [amd64], 2018012-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
moteur de recherche de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)
concavity (0.1+dfsg.1-4)
prédicteur de sites de liaisons de ligands de la protéine à partir de la structure et de la conservation
condor (7.8.2~dfsg.1-1+deb7u1) [debports]
distributed workload management system
connectome-workbench (1.4.1-4 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.3.2-1 [alpha, powerpcspe])
outil de visualisation du cerveau, d'analyse et de découverte
conquest-common (1.4.17d-1) [debports]
ConQuest DICOM Server - common files
conquest-dbase (1.4.17d-1) [debports]
ConQuest DICOM Server - DBaseIII backend
conquest-mysql (1.4.17d-1) [debports]
ConQuest DICOM Server - MySQL backend
conquest-postgres (1.4.17d-1) [debports]
ConQuest DICOM Server - PostgreSQL backend
conquest-sqlite (1.4.17d-1) [debports]
ConQuest DICOM Server - SQLite backend
conservation-code (20110309.0-7)
outil de notation de la conservation des séquences de protéines
cp2k (6.1-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.1-4+b1 [powerpcspe, riscv64], 5.1-3 [hppa])
Ab Initio Molecular Dynamics
cp2k-data (6.1-3)
Ab Initio Molecular Dynamics (data files)
cpl-plugin-amber (4.3.9+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 4.3.8+dfsg-1+b1 [powerpcspe, sh4], 4.3.8+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the AMBER instrument
cpl-plugin-amber-calib (4.3.9+dfsg-2) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for AMBER
cpl-plugin-fors (5.4.3+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 5.3.32+dfsg-1 [m68k, powerpcspe, sh4, x32])
ESO data reduction pipeline for the FORS1/2 instruments
cpl-plugin-fors-calib (5.4.3+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for FORS2
cpl-plugin-giraf (2.16.5+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.16.3+dfsg-1+b1 [powerpcspe, sh4], 2.16.3+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the GIRAFFE instrument
cpl-plugin-giraf-calib (2.16.5+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for GIRAFFE
cpl-plugin-hawki (2.4.6+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.4.3+dfsg-1 [m68k, powerpcspe, sh4, x32])
ESO data reduction pipeline for the HAWK-I instrument
cpl-plugin-hawki-calib (2.4.6+dfsg-1)
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for HAWK-I
cpl-plugin-kmos (2.1.0+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 2.0.2+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the KMOS instrument
cpl-plugin-kmos-calib (2.1.0+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for KMOS
cpl-plugin-muse (2.8.1+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.8+dfsg-1 [alpha], 2.6+dfsg-1 [powerpcspe, sh4], 2.4.2+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the MUSE instrument
cpl-plugin-muse-calib (2.8.1+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for MUSE
cpl-plugin-naco (4.4.8+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 4.4.6+dfsg-1 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, x32])
ESO data reduction pipeline for the NaCo instrument
cpl-plugin-naco-calib (4.4.8+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline NaCo calibration data downloader
cpl-plugin-sinfo (3.1.0+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 3.0.0+dfsg-1 [ppc64])
ESO data reduction pipeline for the SINFONI instrument
cpl-plugin-sinfo-calib (3.1.0+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for SINFONI
cpl-plugin-uves (5.10.4+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 5.9.1+dfsg-1+b1 [powerpcspe, sh4], 5.9.1+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the UVES instrument
cpl-plugin-uves-calib (5.10.4+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for UVES
cpl-plugin-vimos (3.3.0+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.2.3+dfsg-2+b1 [powerpcspe, sh4], 3.2.3+dfsg-2 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the VIMOS instrument
cpl-plugin-vimos-calib (3.3.0+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VIMOS
cpl-plugin-visir (4.3.8+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 4.3.7+dfsg-1+b1 [powerpcspe, sh4], 4.3.7+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the VISIR instrument
cpl-plugin-visir-calib (4.3.8+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VISIR
cpl-plugin-xshoo (3.3.5+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.2.0+dfsg-1+b1 [powerpcspe, sh4], 3.2.0+dfsg-1 [m68k, x32])
ESO data reduction pipeline for the XSHOOTER instrument
cpl-plugin-xshoo-calib (3.3.5+dfsg-2) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for XSHOOTER
cpuinfo (0.0~git20190201.d5e37ad-2)
CPU INFOrmation library (binary utilities)
crac (2.5.2+dfsg-2)
integrated RNA-Seq read analysis
critterding (1.0-beta12.1-1.3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1.0-beta12.1-1.3 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
évolution de la vie artificielle
ctdconverter (2.1-1)
Convert CTD files into Galaxy tool and CWL CommandLineTool files
ctsim (6.0.2-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 6.0.2-2 [powerpcspe, sh4], 5.2.0-4 [x32])
Simulateur de tomographie calculée
ctsim-help (6.0.2-3)
fichier d’aide en ligne pour CTSim
cufflinks (2.2.1+dfsg.1-4) [non-free]
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
cutadapt (2.7-2)
Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads
cwltool (1.0.20190915164430+dfsg-1)
implémentation de la référence du langage Common Workflow
daligner (1.0+git20180524.fd21879-1)
alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide
dans-gdal-scripts (0.24-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 0.24-3 [m68k, powerpcspe, sparc64, x32], 0.24-1+b4 [hppa], 0.24-1+b3 [sh4])
outils de contribution à GDAL du Réseau d’information géographique d’Alaska
darknet (0.0.0+git20180914.61c9d02e-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.0.0+git20180914.61c9d02e-1+b1 [alpha, m68k, ppc64, riscv64, x32])
réseaux neuronaux au code source ouvert en C
dascrubber (1.1-1)
alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
datalad (0.11.8-1)
data files management and distribution platform
datalad-container (0.5.0-1)
DataLad extension for working with containerized environments
dawg (1.2-2)
simulate the evolution of recombinant DNA sequences
dazzdb (1.0+git20190616.034f1ab-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0+git20180908.0bd5e07-1 [powerpcspe])
manage nucleotide sequencing read data
dcl-f77 (7.3.3-1)
GFD-DENNOU Club Library (DCL) - FORTRAN77 version
dcm2niix (1.0.20181125-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.20170624-1 [powerpcspe])
next generation DICOM to NIfTI converter
dcmtk (3.6.4-2.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.6.4-2 [powerpcspe])
utilitaires en ligne de commande de la boîte à outils OFFIS DICOM
(2.1)
logo du mélange exclusif Debian Astronomie
deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3.1 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 0.0+git20170813.e8a621e-3 [m68k, sh4, sparc64], 0.0+git20170813.e8a621e-2 [alpha, hppa], 0.0+20160706-1 [powerpcspe, riscv64, x32])
alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences
deepnano-data (0.0+git20170813.e8a621e-3.1)
alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)
delly (0.8.1-2)
Structural variant discovery by read analysis
dh-r (20190917)
outils d’aide de Debian pour empaqueter les bibliothèques R
dialign (2.2.1-10)
alignement de plusieurs séquences par segments
dialign-tx (1.0.2-12)
alignement séquentiel multiple basé sur les segments
dialign-tx-data (1.0.2-12)
alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données
diamond-aligner (0.9.29+dfsg-1 [amd64], 0.9.23+dfsg-1 [x32], 0.9.22+dfsg-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64])
accelerated BLAST compatible local sequence aligner
dicomnifti (2.33.1-1)
Convertit les fichiers DICOM au format NIfTI
dicompyler (0.4.2.0-2)
plate-forme de recherche en radiothérapie
diet-agent (2.8.0-1) [debports]
DIET grid middleware - agent
dimbl (0.15-2.1)
apprentissage automatique distribué
dindel (1.01-wu1-3+dfsg-1+b2 [alpha], 1.01-wu1-3+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.01-wu1-3+dfsg-1 [x32])
determines indel calls from short-read data
discosnp (2.3.0-2+b1 [hppa, riscv64], 2.3.0-2 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.2.6-2 [m68k, powerpcspe, sh4])
discovering Single Nucleotide Polymorphism from raw set(s) of reads
disulfinder (1.2.11-8)
prédiction de pont disulfure et de leur connectivité
disulfinder-data (1.2.11-8)
fichiers de données pour la prédiction de pont disulfure dans les protéines
dlmodelbox (0.1.3-1)
Swiss Army Knife of Deep Learning Models
dnaclust (3-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3-6+b1 [powerpcspe])
outil de regroupement de millions de séquences courtes d’ADN
doris (5.0.3~beta+dfsg-13) [contrib]
Delft object-oriented radar interferometric software
dotter (4.44.1+dfsg-3)
comparaison détaillée de deux séquences génétiques
dotter
paquet virtuel fourni par acedb-other-dotter
dozzaqueux (3.51-2+b1 [amd64], 3.51-2 [arm64, armel, armhf, i386, mipsel], 3.33-1 [ppc64])
simulateur pour des mélanges chimiques
dozzaqueux-data (3.51-2)
databases for chemical mixtures
dpuser (4.0+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 4.0+dfsg-2 [alpha, armel, armhf], 3.3+p1+dfsg-2+b1 [powerpcspe])
Interactive language for handling numbers, strings, and matrices
drawxtl (5.5-3+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 5.5-3+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32], 5.5-3 [riscv64])
visionneur de structures cristallographiques
drslib (0.3.1.p3-2)
Command-line tools for the Data Reference Syntax library
dsdp (5.8-9.4)
logiciel pour la programmation semi-définie positive
dssp (3.0.0-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 3.0.0-3 [x32])
affectation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D
dwgsim (0.1.12-2)
short sequencing read simulator
dx (1:4.4.4-12)
OpenDX (IBM Visualization Data Explorer) : paquet principal
dxf2gcode (20170925-4)
prepares drawings of parts for automatic machine tools
dxsamples (4.4.0-4)
Programmes d'exemples pour OpenDX Data Explorer
e-mem (1.0.1-2)
Efficient computation of Maximal Exact Matches for very large genomes
e00compr (1.0.1-5+b1 [amd64], 1.0.1-5 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
programme de lecture et écriture de fichiers compressés E00 d’Arcinfo
ea-utils (1.1.2+dfsg-5 [amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.1.2+dfsg-4+b1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32], 1.1.2+dfsg-4 [riscv64])
command-line tools for processing biological sequencing data
easychem (0.6-8+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.6-8 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
trace des molécules et des formules chimiques 2D de haute qualité
ecaccess (4.0.1-1)
clients to access ECMWF facilities
ecflow-client (4.16.0-1+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 4.16.0-1 [armel, armhf, sh4], 4.12.0-1 [powerpcspe], 4.11.1-3+b1 [alpha])
outils client pour des flux de travaux météorologiques
ecflow-server (4.16.0-1+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 4.16.0-1 [armel, armhf, sh4], 4.12.0-1 [powerpcspe], 4.11.1-3+b1 [alpha])
Meteorological workflow controller - server
ecopcr (1.0.1+dfsg-1)
estimate PCR barcode primers quality
edfbrowser (1.70+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.70+dfsg-1 [alpha, armel, armhf, riscv64], 1.65+dfsg-1 [powerpcspe])
visualisateur pour les fichiers de stockage biomédicaux tels que BDF et EDF
edlib-aligner (1.2.4-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.4-2 [alpha], 1.2.4-1 [powerpcspe])
edlib sequence alignment tool using edit distance
edtsurf (0.2009-6)
surfaces de maillage triangulaire pour les structures de protéines
eigensoft (7.2.1+dfsg-1)
reduction of population bias for genetic analyses
elastix (4.9.0-1+b1 [amd64, i386], 4.5-4 [alpha, ppc64, x32], 4.4-2 [hppa])
Boîte à outils pour le recalage rigide et non-rigide d'images
elk-lapw (6.2.8-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 5.4.24-2 [powerpcspe], 4.0.15-2+b3 [riscv64])
All-Electron Density-Functional Electronic Structure Code
elki (0.7.1-10.1)
cadriciel de développement pour des algorithmes d’exploration de données
elki-dev (0.7.1-10.1)
Data mining algorithm development framework - development files
elph (1.0.1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.1-2 [powerpcspe])
DNA/protein sequence motif finder
embassy-domainatrix (0.1.660-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.650-1 [hppa])
commandes supplémentaires EMBOSS pour manipuler un fichier de classification de domaines
embassy-domalign (0.1.660-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.650-1 [hppa])
commandes EMBOSS additionnelles pour l'alignement dans le domaine des protéines
embassy-domsearch (1:0.1.660-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:0.1.650-1 [hppa])
commandes supplémentaires EMBOSS pour la recherche dans les domaines de la protéine
embassy-phylip (3.69.660-3) [non-free]
EMBOSS conversions of the programs in the phylip package
emboss (6.6.0+dfsg-7+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.6.0+dfsg-7 [powerpcspe], 6.6.0+dfsg-1 [hppa])
ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
emboss-data (6.6.0+dfsg-7)
fichiers de données pour le paquet EMBOSS
emboss-explorer (2.2.0-10)
interface web graphique pour EMBOSS
emboss-lib (6.6.0+dfsg-7+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.6.0+dfsg-7 [powerpcspe], 6.6.0+dfsg-1 [hppa])
EMBOSS Libraries
emmax (0~beta.20100307-1+b1 [amd64], 0~beta.20100307-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64])
genetic mapping considering population structure
engauge-digitizer (10.10+ds.1-1+b2 [amd64], 10.10+ds.1-1+b1 [arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 10.10+ds.1-1 [alpha, armel, armhf, riscv64], 10.5+ds.1-1 [powerpcspe])
extraction interactive des valeurs depuis des images bitmap ou des cartes
ent (1.2debian-2+b1 [amd64], 1.2debian-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
programme de test de séquences de nombres pseudo-aléatoires
epigrass (2.5.0+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.4.7-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32])
Outil scientifique pour la simulation et l'analyse de sénarios dans des réseaux épidémiologiques
epsilon-bin (0.9.2+dfsg-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.9.2+dfsg-4 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
bibliothèque pour la compression par ondelettes – outils
ergo (3.8-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.5-1 [sh4], 3.2.1-1 [x32])
Quantum chemistry program for large-scale calculations
ergo-data (3.8-1)
Quantum chemistry program for large-scale calculations - data package
eso-midas (19.02pl1.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 17.02pl1.2-2+b2 [powerpcspe], 15.09pl1.0-2+b1 [m68k], 13.09pl1.4-1 [sh4, sparc64])
ESO-Midas (European Southern Observatory — Munich Image Data Analysis System)
eso-midas-testdata (19.02pl1.1-1)
Test data files for ESO-MIDAS
eso-pipelines (1.3)
ESO VLT Instrument pipeline collection
esorex (3.13.2+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 3.13.1-1 [powerpcspe], 3.12.3-1 [sparc64])
outils d’exécution pour des automatismes de l’Observatoire européen austral
estscan (3.0.3-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 3.0.3-2 [x32])
ORF-independent detector of coding DNA sequences
esys-particle (2.3.5+dfsg1-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 2.3.5+dfsg1-2 [powerpcspe, sh4, sparc64], 2.3.3+dfsg1-1 [hppa])
Software for particle-based numerical modelling. MPI version.
etsf-io (1.0.4-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.0.4-2+b1 [sh4])
Binary tools to check, merge and read ETSF files
examl (3.0.21-2)
Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference
exonerate (2.4.0-4)
outil générique pour la comparaison de deux séquences
expeyes (4.5.7+dfsg-1)
infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
expeyes-clib (4.5.7+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.5.6+dfsg-2 [alpha, hppa], 4.5.6+dfsg-1 [m68k, riscv64], 4.4.4+dfsg-4 [sparc64], 4.4.3+dfsg-2 [powerpcspe])
infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
eye (19.0928.2249~ds-1)
semantic web reasoning engine
eyes17 (4.5.7+dfsg-1)
infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
falcon (1.8.8-1 [alpha, amd64, arm64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.8.6-1.1 [x32], 1.8.6-1 [sh4], 1.8.4-1 [m68k])
diploid-aware genome assembly of single-molecule sequencing reads
fast5 (0.6.5-4)
utilities for manipulating Oxford Nanopore Fast5 files
fasta3 (36.3.8g-1) [non-free]
tools for searching collections of biological sequences
fasta3-doc (36.3.8g-1) [non-free]
user guide for FASTA tools
fastahack (1.0.0+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-6 [powerpcspe])
utility for indexing and sequence extraction from FASTA files
fastaq (3.17.0-2)
outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
fastdnaml (1.2.2-14)
outil pour la construction d'arbres phylogénétiques de séquences d'ADN
fastlink (4.1P-fix100+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 4.1P-fix100+dfsg-1 [x32])
version plus rapide des programmes de généalogie génétique Linkage
fastml (3.11-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.1-4 [powerpcspe])
maximum likelihood ancestral amino-acid sequence reconstruction
fastp (0.20.0+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.19.6+dfsg-1 [powerpcspe])
Ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
fastqc (0.11.8+dfsg-2)
contrôle qualité pour les données de séquences à haut débit
fastqtl (2.184+dfsg-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.184+dfsg-6+b1 [powerpcspe])
mappage de LCQ (locus de caractères quantitatifs) dans cis pour les phénotypes moléculaires
fasttree (2.1.11-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1.10-2 [powerpcspe])
arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
fastx-toolkit (0.0.14-6)
outils de prétraitement des lectures de nucléotides courts aux formats FASTQ/A
fcc (2.8-1+b4 [mips64el], 2.8-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 2.8-1+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64], 2.8-1+b1 [riscv64])
Script to compile C/C++ programs and link to Fortran libraries
feedgnuplot (1.52-1)
frontal pour Gnuplot orienté tuyauterie (pipe)
ffindex (0.9.9.9-3)
index/base de données simple pour d'énormes quantités de petits fichiers
figtree (1.4.4-4)
visionneuse d'arbres phylogénétiques sous forme graphique
filo (1.1+2011123001.1) [debports]
opérations sur les fichiers et les flux
filo
paquet virtuel fourni par bedtools
fitgcp (0.0.20150429-3 [amd64, arm64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 0.0.20150429-2 [powerpcspe], 0.0.20150429-1 [x32], 0.0.20130418-1+b1 [alpha], 0.0.20130418-1 [sparc64])
fitting genome coverage distributions with mixture models
fitscut (1.4.4-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4.4-4+b4 [powerpcspe])
Extract cutouts from FITS image format files
fitsh (0.9.2-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.9.2-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
Software package for astronomical image processing
fitspng (1.4-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4-1 [powerpcspe])
FITS to PNG converter
fitsverify (4.20-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 4.19-1+b1 [powerpcspe])
FITS File Format-Verification Tool
fityk (1.3.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.3.1-3 [powerpcspe, sh4])
ajustement de courbes et analyse de données non linéaires d’usage général
flexbar (1:3.5.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:3.4.0-2 [powerpcspe])
code-barres flexible et suppression de l'adaptation pour les plateformes de séquençage
flextra (5.0-13 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.0-12 [powerpcspe, sh4])
Trajectory model for tracing air transport phenomena
fml-asm (0.1-5+b1 [amd64], 0.1-5 [x32])
tool for assembling Illumina short reads in small regions
foma (1:0.9.18+r243-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:0.9.18+r243-6 [powerpcspe])
Tools for constructing various finite-state automata
foma-bin (1:0.9.18+r243-6)
Transitional package for foma
form (4.2.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 4.2.1-1 [powerpcspe])
système de manipulation symbolique
fractalnow (0.8.2-4+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.8.2-4 [alpha, armel, armhf], 0.8.2-3 [powerpcspe])
générateur rapide et avancé de fractales
(1.4.77-1.2)
Free42 est une réimplémentation du calculateur HP-42S
freebayes (1.3.1-1)
Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping
freecad (0.18.4+dfsg1-1 [all], 0.16.6712+dfsg1-3 [alpha, m68k, riscv64, x32], 0.16.6712+dfsg1-1+b1 [powerpcspe, sh4, sparc64], 0.16+dfsg2-3 [hppa])
programme extensible et au code source ouvert de CFAO
freecad-common (0.18.4+dfsg1-1)
Extensible Open Source CAx program - common files
freecad-python2 (0.18.3+dfsg1-1) [debports]
Extensible Open Source CAx program - Python 2 binaries
freecad-python3 (0.18.4+dfsg1-1+b1 [arm64], 0.18.4+dfsg1-1 [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.18.3+dfsg1-1 [ppc64])
programme extensible et au code source ouvert de CFAO – binaires en Python 3
freecad-runtime (0.18.4+dfsg1-1)
Extensible Open Source CAx program - runtime files
freecontact (1.0.21-7+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.0.21-7 [x32], 1.0.21-6+b1 [hppa])
fast protein contact predictor
freediams (0.9.4-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.9.4-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
assistant de prescription et gestionnaire d'interactions médicamenteuses
freemedforms-common-resources (0.9.4-2)
données communes pour les applications du projet FreeMedForms
freemedforms-emr (0.9.4-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.9.4-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
gestionnaire de dossiers patients
freemedforms-emr-resources (0.9.4-2)
données pour FreeMedForms EMR
freemedforms-freedata (0.9.4-2)
données libres du projet FreeMedForms
freemedforms-libs (0.9.4-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.9.4-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
bibliothèques communes du projet FreeMedForms
freemedforms-project (0.9.4-2)
ensemble d’applications médicales pour les professionnels de la santé
freemedforms-theme (0.9.4-2)
thème pour le projet FreeMedForms
frog (0.15-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.15-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
tagger and parser for natural languages (runtime)
frogdata (0.16-1)
Data files for Frog
fsa (1.15.9+dfsg-4)
Fast Statistical Alignment of protein, RNA or DNA sequences
fsl (5.0.8-6) [non-free]
transitional dummy package
fsl
paquet virtuel fourni par fsl-5.0-core
fsl-5.0-core (5.0.8-6) [non-free]
analysis tools for FMRI, MRI and DTI brain imaging
fsl-core (5.0.8-6) [non-free]
metapackage for the latest version of FSL
fslview (4.0.1-4) [debports]
Visualiseur de données (f)MRI et DTI
fsm-lite (1.0-3)
frequency-based string mining (lite)
ftools-fv (5.5+dfsg-2)
Tool for viewing and editing FITS format files
ftools-pow (5.5+dfsg-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 5.5+dfsg-1+b2 [powerpcspe])
Curve plotting and image display interface tool
funtools (1.4.7-4)
Minimal buy-in FITS utility package
fw4spl (17.2.0-2)
frameWork pour Software Production Line
fw4spl
paquet virtuel fourni par libsight
fxt-tools (0.3.9-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.3.8-2 [powerpcspe])
Multithreaded tracing library
g3data (1:1.5.3-2.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1:1.5.3-2.1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
Extrait les données depuis des graphiques numérisés
gabedit (2.5.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.4.8-3+b1 [powerpcspe])
interface utilisateur graphique pour paquets Ab Initio
galileo (0.5.1-6)
utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit avec le service web de Fitbit
galileo-daemon (0.5.1-6)
utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit – démon
gamgi (0.17.3-2)
interface graphique de modélisation atomique générale (GAMGI)
gamgi-data (0.17.3-2)
General Atomistic Modelling Graphic Interface (data)
garli (2.1-3+b1 [amd64], 2.1-3 [arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood
garli-examples (2.1-3)
phylogenetic analysis of molecular sequence data (examples)
garli-mpi (2.1-3+b1 [amd64], 2.1-3 [arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)
garlic (1.6-3+b1 [amd64], 1.6-3 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
logiciel de visualisation de biomolécules
gasic (0.0.r19-5 [amd64], 0.0.r18-1 [arm64, m68k, sh4, sparc64])
genome abundance similarity correction
gatb-core (1.4.1+git20191130.664696c+dfsg-1 [amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.4.1+git20190813.a73b6dd+dfsg-1 [alpha, hppa, mips64el, riscv64])
Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph
gatb-core-testdata (1.4.1+git20191130.664696c+dfsg-1)
Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph (test data)
gausssum (3.0.2-2)
analyse et affichage de sorties Gaussian, GAMESS…
gazebo7 (7.8.1+dfsg-4+b1 [m68k, sh4], 7.5.0+dfsg-1 [hppa]) [debports]
simulateur de robots au source ouvert – exécutables
gazebo7-plugin-base (7.8.1+dfsg-4+b1 [m68k, sh4], 7.5.0+dfsg-1 [hppa]) [debports]
simulateur de robots au source ouvert – greffons de base
gazebo9 (9.6.0-2+b1)
simulateur de robots au source ouvert – exécutables
gazebo9-common (9.6.0-2)
simulateur de robots au source ouvert – fichiers communs
gazebo9-plugin-base (9.6.0-2+b1)
simulateur de robots au source ouvert – greffons de base
gbrowse (2.56+dfsg-5)
navigateur de génome générique GMOD
gbrowse-calign (2.56+dfsg-5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4, sparc64, x32], 2.56+dfsg-4+b1 [alpha, hppa, powerpcspe, s390x])
outil auxiliaire CAlign
gbrowse-data (2.56+dfsg-5)
données d’échantillon pour utiliser GBrowse
gbutils (5.7.1-1)
utilities for command line econometrics
gchempaint (0.14.17-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.14.17-1.1 [powerpcspe], 0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [alpha, x32])
éditeur 2D de structures chimiques pour le bureau GNOME2
gcrystal (0.14.17-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.14.17-1.1 [powerpcspe], 0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [alpha, x32])
visualiseur léger de structures cristallines
gcu-bin (0.14.17-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.14.17-1.1 [powerpcspe], 0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [alpha, x32])
outils GNOME pour la chimie – applications auxiliaires
gcu-plugin (0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [alpha, x32], 0.14.9-1 [arm64]) [debports]
GNOME chemistry utils (browser plugin)
gcx (1.3-1.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1.3-1.1+b1 [ppc64], 1.3-1.1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
application en Gtk+ de traitement d’images astronomiques et de photométrie
gdal-bin (2.4.3+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.4.3+dfsg-1 [m68k], 2.4.2+dfsg-2 [alpha], 2.3.3+dfsg-1 [powerpcspe], 2.2.4+dfsg-1+b1 [sh4], 2.2.3+dfsg-2+b1 [hppa])
Bibliothèque d'abstraction de données géospatiales - outils
gdal-data (2.4.3+dfsg-1)
Geospatial Data Abstraction Library - Data files
gdis (0.90-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.90-5 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
visualisateur de modèle de molécule et de cristal
gdis-data (0.90-5)
visualisateur de modèle de molécule et de cristal — fichiers de données
gdl-astrolib (2019.10.30+dfsg-1)
Low-level astronomy software for GDL
gdl-coyote (2019.08.19-1)
GDL library from D. Fannings IDL courses
gdl-mpfit (1.85+2017.01.03-4)
Robust non-linear least squares curve fitting for GDL
gdpc (2.2.5-9)
Visualisateur de simulations de dynamique moléculaire
gdpc-examples (2.2.5-9)
fichiers d’exemples pour le programme gdpc
geant321 (1:3.21.14.dfsg-11)
outil de description et de simulation de détecteur de particules
geant321-data (1:3.21.14.dfsg-11)
données pour le simulateur de détecteur GEANT 3.21
gelemental (2.0.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.0-12 [powerpcspe])
visionneuse de tableau périodique des éléments
gemma (0.98.1+dfsg-1)
Genome-wide Efficient Mixed Model Association
gemma-doc (0.98.1+dfsg-1)
Example folder for GEMMA
genometester (4.0+git20180508.a9c14a6+dfsg-1)
toolkit for performing set operations on k-mer lists
genometools (1.5.10+ds-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 1.5.8+ds-4 [sh4])
boîte à outils polyvalente d'analyse du génome
genometools-common (1.5.10+ds-4)
shared data files for GenomeTools
gentle (1.9+cvs20100605+dfsg1-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.9+cvs20100605+dfsg1-7 [powerpcspe, sh4])
ensemble de logiciels pour planifier le clonage génétique
geographiclib-tools (1.50-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.49-4 [powerpcspe])
bibliothèque C++ pour résoudre des problèmes géodésiques –⋅outils
geotiff-bin (1.5.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4.3-1 [powerpcspe])
bibliothèque GeoTIFF (geografic enabled TIFF) – outils
gerris (20131206+dfsg-18+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 20131206+dfsg-18+b1 [m68k, riscv64, sh4])
solveur hydrodynamique Gerris
gerris-mpi (20131206+dfsg-4) [debports]
solveur hydrodynamique Gerris
getdata (0.2-3)
management of external databases
gff2aplot (2.0-11)
tracés d'alignements par paires pour les séquences génomiques avec PostScript
gff2ps (0.98l-2)
Produit des graphiques PostScript à partir de fichiers GFF
gffread (0.11.6-1)
GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction
gfsview (20121130+dfsg-6)
visualisateur graphique de fichiers de simulation avec Gerris
gfsview-batch (20121130+dfsg-6)
batch-version of viewer for Gerris simulation files
ghkl (5.0.0.2456-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 5.0.0.2456-1 [alpha], 5.0.0.2449-2 [powerpcspe], 5.0.0.2173-2+b1 [sh4, sparc64], 5.0.0.2173-2 [hppa])
application de contrôle de calculs de diffractomètre
ghmm (0.9~rc3-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.9~rc3-1 [powerpcspe])
General Hidden-Markov-Model library - tools
giella-core (0.1.1~r129227+svn121148-2)
GTCORE files for building Giellatekno language packages
giella-sme (0.0.20150917~r121176-3)
Giellatekno single language data for North Saami
giella-sme-dev (0.0.20150917~r121176-3)
Giellatekno single language data for North Saami (dev extras)
giira (0.0.20140625-2 [amd64], 0.0.20140210-1+b1 [alpha], 0.0.20140210-1 [arm64])
RNA-Seq driven gene finding incorporating ambiguous reads
ginga (3.0.0-1)
Astronomical image viewer
ginkgocadx (3.8.8-2 [amd64, i386], 3.7.0.1465.37+dfsg-1 [alpha, hppa], 3.6.0.1228.33+dfsg-1 [ppc64])
logiciel d’imagerie médicale et visualisateur DICOM complet
glam2 (1064-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1064-7 [powerpcspe])
motifs de protéines lacunaires de séquences non alignées
gliese (3.0.95-2) [non-free]
stellar data set from the Third Catalogue of Nearby Stars
glueviz (0.15.5+dfsg-1)
Linked data visualization
gmap (2019-05-12-1) [non-free]
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
gmt (6.0.0+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.4.5+dfsg-2 [alpha], 5.4.5+dfsg-1 [powerpcspe], 5.4.3+dfsg-1 [hppa], 4.5.11-1 [sh4])
outils de cartographie générique
gmt-common (6.0.0+dfsg-1)
Generic Mapping Tools - Architecture-independent files
gmt-dcw (1.1.4-2)
Digital Chart of the World (DCW) for GMT
gmt-gshhg (2.3.7-4)
Global Self-consistent Hierarchical High-resolution Geography (GSHHG)
gmt-gshhg-full (2.3.7-4)
Full resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
gmt-gshhg-high (2.3.7-4)
High resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
gmt-gshhg-low (2.3.7-4)
Low resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
gnuastro (0.10-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.10-1 [alpha], 0.8-1 [powerpcspe])
GNU Astronomy Utilities programs
gpaw (19.8.1-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 19.8.1-1 [alpha, hppa, x32], 1.4.0-2 [sparc64], 1.3.0-1 [m68k, sh4], 0.11.0.13004-3+b1 [powerpcspe])
DFT and beyond within the projector-augmented wave method
gpaw-data (0.9.20000-2)
gpaw datasets/setups
gperiodic (3.0.3-1)
Table périodique des éléments
gpiv (0.6.1-2.3) [debports]
GUI program for Particle Image Velocimetry
gpiv-mpi (0.6.1-2.3) [debports]
programme pour la vélocimétrie par imagerie de particules - version MPI
gpivtools (0.6.0-3.1) [debports]
command line programs for Particle Image Velocimetry
gpivtools-mpi (0.6.0-3.1) [debports]
command line programs for Particle Image Velocimetry - MPI version
gpx (2.5.2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.2-3 [powerpcspe])
post-traitement de conversion gcode vers x3g
gpx2shp (0.71.0-7 [powerpcspe], 0.71.0-1 [arm64]) [debports]
Convertit les fichiers GPS ou GPX en fichiers de formes ESRI
gr-fcdproplus (3.8~20190817-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 3.7.25.4b6464b-5+b3 [sparc64], 3.7.25.4b6464b-5+b2 [powerpcspe])
Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio
grabix (0.1.7-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.7-1 [powerpcspe])
wee tool for random access into BGZF files
graphlan (1.1.3-2)
circular representations of taxonomic and phylogenetic trees
grass (7.8.1-1)
système de gestion et d’analyse de ressources géographiques – SIG GRASS
grass-core (7.8.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 7.8.0-2 [alpha], 7.4.2-1 [powerpcspe], 7.4.1-3 [sh4], 7.4.0-1+b1 [hppa])
composants centraux du SIG GRASS
grass-gui (7.8.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 7.8.0-2 [alpha], 7.4.2-1 [powerpcspe], 7.4.1-3 [sh4], 7.4.0-1+b1 [hppa])
interfaces utilisateur graphiques pour le SIG GRASS
gravit (0.5.1+dfsg-3)
simulateur de gravité à couper le souffle
gravit-data (0.5.1+dfsg-3)
fichiers de données pour Gravit
gri (2.12.26-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.12.26-1+b1 [powerpcspe, sh4])
langage pour l'illustration scientifique
grinder (0.5.4-5)
simulateur polyvalent de lecture de séquençage global et d'amplicon omiques
gromacs (2019.4-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2019.4-1 [sparc64], 2019.1-1 [powerpcspe], 2018.4-1 [alpha], 2018.3-1 [hppa])
Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation
gromacs-data (2019.4-1)
GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
gromacs-mpich (2019.4-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2019.4-1 [sparc64], 2019.1-1 [powerpcspe], 2018.4-1 [alpha], 2018.3-1 [hppa])
simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec MPICH
gromacs-openmpi (2019.4-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2019.4-1 [sparc64], 2019.1-1 [powerpcspe], 2018.4-1 [alpha], 2018.3-1 [hppa])
simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec OpenMPI
gubbins (2.3.4-1)
phylogenetic analysis of genome sequences
gvb (1.4-1)
visual simulator of 1 and 2-dimensional vibrations
gwama (2.2.2+dfsg-2)
Genome-Wide Association Meta Analysis
gwyddion (2.55-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.52-1 [alpha, powerpcspe])
outil d'analyse et de visualisation de données SPM (« Scanning Probe Microscopy »)
gwyddion-common (2.55-2)
fichiers indépendants de l’architecture pour Gwyddion, outil d’analyse SPM
gwyddion-plugins (2.52-1 [alpha, powerpcspe], 2.38-2 [arm64]) [debports]
greffons pour l’outil d’analyse SPM de Gwyddion
gyoto (1.4.3-1 [all], 1.0.2-2 [m68k], 1.0.2-1 [sh4], 0.2.3-1 [arm64])
General relativistic geodesic integration and ray-tracing
gyoto-bin (1.4.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.4.3-1 [riscv64, sparc64], 1.3.6-1 [alpha], 1.3.1-1 [powerpcspe], 1.2.0-4+b5 [x32], 1.2.0-4+b1 [hppa])
General relativistic ray-tracing command-line interface
h5utils (1.13.1-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.13.1-3 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
outils de visualisation de fichiers HDF5
harminv (1.4.1-2+b1 [amd64], 1.4.1-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
extraction of complex frequencies and amplitudes from time series
harvest-tools (1.3-4)
archiving and postprocessing for reference-compressed genomic multi-alignments
hdf-compass (0.7~b8-2)
visualisateur pour les formats HDF5 et apparentés
hdf5-helpers (1.10.4+repack-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.10.4+repack-6 [ppc64], 1.10.0-patch1+docs-4+b2 [powerpcspe], 1.10.0-patch1+docs-4+b1 [riscv64])
HDF5 (Hierarchical Data Format 5) – assistants
hdf5-tools (1.10.4+repack-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.10.4+repack-6 [ppc64], 1.10.0-patch1+docs-4+b2 [powerpcspe], 1.10.0-patch1+docs-4+b1 [riscv64])
Format de données hiérarchique 5 (HDF5) - outils d'exécution
herisvm (0.8.2-1)
machine learning tools for classification algorithms
herwig++ (2.6.0-1.1+b2 [amd64, m68k, mipsel, x32], 2.6.0-1.1+b1 [powerpcspe], 2.6.0-1.1 [armel, armhf])
Multi-purpose event generator for high energy physics
herwig++-data (2.6.0-1.1)
Herwig++ Data
herwig++-dev (2.6.0-1.1+b2 [amd64, m68k, mipsel, x32], 2.6.0-1.1+b1 [powerpcspe], 2.6.0-1.1 [armel, armhf])
Herwig++ development files
hfst (3.15.1-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.15.0-1 [powerpcspe])
Helsinki Finite-State Transducer Technology
hfst-ospell (0.5.0-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.5.0-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
Spell checker library and tool based on HFST
hhsuite (3.2.0-2)
sensitive protein sequence searching based on HMM-HMM alignment
hhsuite-data (3.2.0-2)
sensitive protein sequence searching based on HMM-HMM alignment (data)
hidrd (0.2.0-12 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, sh4, x32], 0.2.0-11 [armel, armhf, ppc64el, s390x])
tools for parsing and generating HID report descriptors
hilive (2.0a-2 [amd64, arm64, armhf, mips64el, s390x, x32], 2.0a-1 [armel], 1.1-3 [alpha, hppa, m68k, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4, sparc64], 1.1-2 [powerpcspe])
realtime alignment of Illumina reads
hinge (0.5.0-5 [amd64, arm64, ppc64el], 0.5.0-4 [m68k, mips64el, riscv64], 0.5.0-2 [alpha, hppa, ppc64, sparc64])
long read genome assembler based on hinging
hisat2 (2.1.0-2)
graph-based alignment of short nucleotide reads to many genomes
hmmer (3.3+dfsg2-1 [amd64, i386, ppc64, x32], 3.1b2-1 [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64], 3.1b1-3 [arm64])
Prépare des modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
hmmer2 (2.3.2+dfsg-6)
Prépare des modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
hmmer2-pvm (2.3.2+dfsg-6)
Programmes HMMER avec support PVM (machine virtuelle parallèle)
hodie (1.5.0-1+b1 [amd64], 1.5.0-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
affichage de la date en latin
horae (071~svn537-2.1) [contrib]
interactive graphical processing and analysis of EXAFS data
hpcc (1.5.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.5.0-1 [sh4])
mesureur de performance HPC Challenge
htcondor (8.6.8~dfsg.1-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 8.4.2~dfsg.1-1 [hppa], 8.2.3~dfsg.1-5 [alpha])
distributed workload management system
hyphy-common (2.3.14+dfsg-2)
test statistique en utilisant des phylogénies – fichiers communs
hyphy-mpi (2.3.14+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.3.14+dfsg-1 [powerpcspe])
Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
hyphy-pt (2.3.14+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.3.14+dfsg-1 [powerpcspe])
Hypothesis testing using Phylogenies (pthreads version)
idba (1.1.3-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.1.3-3 [hppa])
iterative De Bruijn Graph short read assemblers
ifeffit (2:1.2.11d-10.2+b5) [contrib]
Interactive XAFS analysis program
ifrit (4.1.2-5+b2 [powerpcspe], 3.4.2-1 [arm64]) [debports]
outil puissant pour visualiser des ensembles de données tridimensionnelles
igdiscover (0.11-3)
analyzes antibody repertoires to find new V genes
igor (1.3.0+dfsg-1)
infers V(D)J recombination processes from sequencing data
igv (2.4.17+dfsg-1) [non-free]
Integrative Genomics Viewer
imagej (1.52r-1)
programme de traitement d’image ciblant les images de microscopie
imagevis3d (3.1.0-7+b2 [powerpcspe], 3.1.0-4 [arm64]) [debports]
application de bureau pour le rendu volumique direct de grands volumes de données
imview (1.1.9h-1)
Application de visualisation et d'analyse d'images
indelible (1.03-4)
powerful and flexible simulator of biological evolution
indigo-utils (1.2.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.1.12-2 [powerpcspe])
Organic Chemistry Toolkit Utilities
infernal (1.1.3-2 [amd64, x32], 1.1.2-2 [i386], 1.0.2-2 [alpha, m68k, ppc64, sh4, sparc64], 1.0.2-1 [hppa])
inférence d’alignements structurels secondaires d’ARN
inhomog (0.1.9.2-1)
kinematical backreaction and average scale factor evolution
inkscape-survex-export (1.0-1)
Inkscape plugin to digitise printed surveys
ipig (0.0.r5-3)
integrating PSMs into genome browser visualisations
iqtree (1.6.12+dfsg-1)
efficient phylogenetic software by maximum likelihood
iraf (2.16.1+2018.11.01-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, x32], 2.16.1+2018.11.01-2+b2 [alpha])
Image Reduction and Analysis Facility
iraf-dev (2.16.1+2018.11.01-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, x32], 2.16.1+2018.11.01-2+b2 [alpha])
Image Reduction and Analysis Facility (development files)
iraf-fitsutil (2018.07.06-4)
FITS utilities for IRAF
iraf-mscred (5.05+2018.07.09-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, x32], 5.05+2018.07.09-1+b1 [alpha, riscv64])
CCD mosaic reduction package for IRAF
iraf-noao (2.16.1+2018.11.01-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, x32], 2.16.1+2018.11.01-2+b2 [alpha])
IRAF NOAO data reduction package
iraf-noao-dev (2.16.1+2018.11.01-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, x32], 2.16.1+2018.11.01-2+b2 [alpha])
IRAF NOAO data reduction package (development files)
iraf-rvsao (2.8.3-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, x32], 2.8.3-1+b1 [alpha, riscv64])
IRAF package to obtain radial velocities from spectra
iraf-sptable (1.0~pre20180612-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, x32], 1.0~pre20180612-1+b1 [alpha, riscv64])
IRAF package for Tabular Spectra
iraf-wcstools (3.9.5-3)
Handle the WCS of a FITS image (IRAF package)
irstlm (6.00.05-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 6.00.05-2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
boîte à outils de modélisation de langage IRST
ismrmrd-schema (1.4.0-1)
schema for ISMRMRD
ismrmrd-tools (1.4.0-1+b1 [riscv64], 1.4.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.3.3-1 [hppa], 1.3.2-2 [sparc64])
command-line tools for ISMRMRD
itksnap (3.6.0-3 [amd64, i386], 2.2.0-1.1 [alpha, hppa, ppc64, x32])
segmentation semi-automatique de structures pour les images en 3D
iva (1.0.9+ds-6+b1 [amd64], 1.0.9+ds-6 [arm64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 1.0.8+ds-1 [x32])
assemblage itératif de séquences virales
jaligner (1.0+dfsg-6)
algorithme de Smith-Waterman avec l'amélioration de Gotoh
jalview (2.7.dfsg-5)
éditeur d'alignement multiple
jblas (1.2.4-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.2.4-1 [hppa], 1.2.3-6 [alpha, sh4])
bibliothèque rapide d'algèbre linéaire pour Java
jellyfish (2.3.0-3 [amd64], 2.3.0-2+b1 [riscv64])
count k-mers in DNA sequences
jellyfish-examples (2.3.0-3 [amd64], 2.3.0-2+b1 [riscv64])
count k-mers in DNA sequences (examples for testing)
jellyfish1 (1.1.11-4+b1 [amd64], 1.1.11-4 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32])
count k-mers in DNA sequences
jemboss (6.6.0+dfsg-7)
interface graphique pour EMBOSS
jmodeltest (2.1.10+dfsg-7)
HPC selection of models of nucleotide substitution
jmol (14.6.4+2016.11.05+dfsg1-4)
visualisateur moléculaire
jsamp (1.3.7-1)
Java Simple Application Messaging Protocol tool for VO
jube (2.2.2-1)
JUBE Benchmarking Environment
julia (1.3.0+dfsg-1 [amd64, i386], 1.2.0+dfsg-1+b1 [ppc64el], 1.1.1+dfsg-1 [arm64], 1.0.4+dfsg-1 [armhf])
langage de programmation haute-performance pour le calcul technique
julia-common (1.3.0+dfsg-1)
langage de programmation haute-performance pour le calcul technique –⋅fichiers communs
jupyter-notebook (6.0.0-1)
notebook interactif de Jupyter
kalign (1:2.03+20110620-5)
Alignement séquentiel multiple global et progressif
kallisto (0.46.1+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.46.0+dfsg-1 [alpha])
near-optimal RNA-Seq quantification
kallisto-examples (0.46.1+dfsg-1)
near-optimal RNA-Seq quantification (example data)
kalzium (4:19.08.1-1+b1 [amd64, arm64, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 4:19.08.1-1 [alpha, armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64], 4:17.08.3-1+b1 [powerpcspe])
outil de table périodique et de chimie
kalzium-data (4:19.08.1-1)
fichiers de données pour Kalzium
kaptive (0.6.0-1)
obtain information about K and O types for Klebsiella genome assemblies
kaptive-data (0.6.0-1)
reference data for kaptive for Klebsiella genome assemblies
kaptive-example (0.6.0-1)
example data for kaptive for Klebsiella genome assemblies
khmer (2.1.2+dfsg-6+b1 [amd64, arm64], 2.0+dfsg-5 [sparc64])
comptage k-mer, filtrage et parcours de graphe de séquences d’ADN en mémoire vive
khmer-common (2.1.2+dfsg-6)
common files for the khmer project tools
kineticstools (0.6.1+git20180425.27a1878-2)
detection of DNA modifications
kineticstools-data (0.6.1+git20180425.27a1878-2)
detection of DNA modifications -- data files
king-probe (2.16.160404+git20180613.a09b012-1)
Evaluate and visualize protein interatomic packing
kissplice (2.4.0-p1-5 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 2.3.1-1 [sparc64, x32], 2.2.1-1 [alpha, m68k], 2.1.0-1 [hppa, ppc64, sh4])
détection de diverses sortes de polymorphismes dans les données du séquençage de l'ARN
klustakwik (2.0.1-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 2.0.1-1+b1 [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64], 2.0.1-1 [powerpcspe, riscv64])
classement automatique des échantillons (pics) dans des regroupements
kma (1.2.16-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1.7-1 [powerpcspe])
mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases
kmc (2.3+dfsg-7+b1 [amd64], 2.3+dfsg-7 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
décompte de k-mers dans des séquences de génome
kmer (0~20150903+r2013-6)
suite of tools for DNA sequence analysis
kmer-examples (0~20150903+r2013-6)
sample data for kmer suite of tools for DNA sequence analysis
kmerresistance (2.2.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.0+git20180205.26467e9-2 [powerpcspe])
correlates mapped genes with the predicted species of WGS samples
konclude (0.6.2~dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.6.2~dfsg-5 [powerpcspe])
raisonneur de logique descriptive basé sur les tableaux pour le web sémantique
kraken (1.1.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.10.5~beta-4 [m68k, powerpcspe, sh4])
assigning taxonomic labels to short DNA sequences
kraken2 (2.0.8~beta-1)
taxonomic classification system using exact k-mer matches
kst (2.0.8-3+b4 [amd64, arm64, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 2.0.8-3+b3 [armel, armhf], 2.0.8-3+b2 [alpha, m68k, ppc64, riscv64, sparc64], 2.0.8-3+b1 [sh4, x32], 2.0.8-2 [powerpcspe])
outil scientifique de tracé de données
kstars (5:3.3.8-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 5:3.0.0-1+b1 [alpha, hppa, riscv64], 5:2.9.7-1 [sh4], 5:2.9.6-1 [powerpcspe], 4:16.08.3-2 [sparc64])
planétarium de bureau, planification d’observations et contrôle de télescope
kstars-data (5:3.3.8-1)
fichiers de données pour le planétarium KStars
kstars-data-extra-tycho2 (1.1r1-9.1) [non-free]
Tycho-2 star catalog for KStars
kxterm (20061220+dfsg3-4.4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 2006.dfsg.2-2 [m68k])
Suite d'analyse de données CERNLIB - émulateur de terminal KUIP
lagan (2.0-5+b1 [amd64], 2.0-5 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.0-3 [powerpcspe])
highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
lamarc (2.1.10.1+dfsg-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.1.10.1+dfsg-2 [powerpcspe, sh4])
analyse de vraisemblance avec l’algorythme de Metropolis en utilisant la théorie de la coalescence
lambda-align (1.0.3-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.3-3 [powerpcspe])
Local Aligner for Massive Biological DatA
lambda-align2 (2.0.0-6 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.0.0-5 [alpha], 2.0.0-3 [powerpcspe])
Local Aligner for Massive Biological DatA - v2
lammps (0~20181211.gitad1b1897d+dfsg1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0~20181211.gitad1b1897d+dfsg1-1 [ppc64], 0~20180822.gitb47e49223+dfsg1-2 [m68k], 0~20180510.gitaa1d815fe-4 [hppa, sparc64], 0~20161109.git9806da6-7 [powerpcspe], 0~20151117.gite3c4db7-3 [sh4])
Molecular Dynamics Simulator
last-align (1021-2 [amd64, i386, x32], 984-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 963-2 [powerpcspe])
comparaison de séquences biologiques à l'échelle du génome
lbt (1.2.2-6)
Convertit des formules LTL en automates Büchi
leaff (0~20150903+r2013-6+b1 [amd64], 0~20150903+r2013-6 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
biological sequence library utilities and applications
lefse (1.0.8-3)
determine features of organisms, clades, taxonomic units, genes
lhapdf-pdfsets-minimal (5.9.1-6)
Minimal PDF Sets of LHAPDF
libadios-bin (1.13.1-19+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.13.1-16 [powerpcspe], 1.13.1-11 [alpha, ppc64], 1.13.1-6 [m68k, sh4, sparc64])
ADIOS système flexible d'entrées-sorties — exécutables
libadios-examples (1.13.1-19 [all], 1.7.0-4 [arm64])
exemples pour le système flexible d'entrées-sorties ADIOS
libball1.5-data (1.5.0+git20180813.37fc53c-3)
bibliothèque d'algorithmes de biochimie –⋅fichiers de données
libbio-tools-phylo-paml-perl (1.7.3-2)
Bioperl interface to the PAML suite
libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl (1.7.4-1)
Bioperl interface to Clustal W
libbio-tools-run-alignment-tcoffee-perl (1.7.4-1)
Bioperl interface to T-Coffee
libcamitk3 (3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64]) [debports]
boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – exécutable
libcassie1 (1.0.1+dfsg-3) [debports]
bibliothèque mettant en œuvre des algorithmes de recherche
libcg3-1 (1.3.1-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.1.7-1+b1 [alpha, powerpcspe, x32])
Runtime for CG-3
libclassad3 (7.8.2~dfsg.1-1+deb7u1) [debports]
Condor classads expression language - runtime library
libclblas-bin (2.6-3) [debports]
OpenCL BLAS library (executables)
libclblas-bin
paquet virtuel fourni par clblas-client
libdynamicedt3d1.6 (1.6.8+dfsg-1) [debports]
Incrementally updatable Euclidean distance transform library
libeccodes-data (2.15.0-1)
GRIB and BUFR enecoding/encoding software library - data
libeckit-utils (1.4.2-3)
C++ toolkit for ECMWF tools and applications - development files
libghemical-data (3.0.0-4.2)
Molecular Modelling Library (data files)
libgnuradio-fcdproplus0 (3.7.11-3) [debports]
Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio
libgnuradio-fcdproplus3.7.11 (3.7.25.4b6464b-5+b3 [sparc64], 3.7.25.4b6464b-5+b2 [powerpcspe]) [debports]
Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio (runtime)
libgtkdatabox-0.9.3-0-glade (1:0.9.3.0+dfsg-3) [debports]
Gtk+ library to display large amounts of numerical data (glade API)
libgtkdatabox-0.9.3-0-libglade (1:0.9.3.0+dfsg-3) [debports]
Gtk+ library to display large amounts of numerical data (glade lib)
libgtkdatabox0-glade (1:0.9.3.1-1+b1 [amd64], 1:0.9.3.1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32])
Gtk+ library to display large amounts of numerical data (glade API)
libgyoto2 (0.2.3-1) [debports]
General relativistic geodesic integration and ray-tracing
libgyoto4 (1.0.2-2 [m68k], 1.0.2-1 [sh4]) [debports]
General relativistic geodesic integration and ray-tracing
libgyoto6 (1.2.0-4+b5 [x32], 1.2.0-4+b1 [hppa]) [debports]
Gyoto framework main library an standard plug-in
libhdf5-jni (1.10.4+repack-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.10.4+repack-6 [ppc64], 1.10.0-patch1+docs-4+b2 [powerpcspe], 1.10.0-patch1+docs-4+b1 [riscv64])
native library used by libhdf5-java
liblas-bin (1.8.1-8+b1 [powerpcspe], 1.8.0-1 [arm64]) [debports]
ASPRS LiDAR data translation toolset
liblemon-utils (1.3.1+dfsg-2)
Library for Efficient Modeling and Optimization in Networks (utilities)
liblinear-tools (2.3.0+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1.0+dfsg-4 [powerpcspe])
Standalone applications for LIBLINEAR
libmstoolkit-tools (82-6)
libraries for manipulating mass spectrometry data - tools
libncarg-bin (6.6.2-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 6.5.0-1 [sparc64], 6.4.0-9 [hppa])
NCAR command-language library - development tools
libncarg-data (6.6.2-1)
NCAR command-language library - Data
libngram-tools (1.3.2-3)
OpenGRM n-gram Language Modeling toolkit
libocas-tools (0.97+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.97+dfsg-5 [powerpcspe])
Standalone applications implementing the OCAS solver
liboctomap1.6 (1.6.8+dfsg-1) [debports]
3D occupancy grid mapping approach library for mapping
liboctovis1.6 (1.6.8+dfsg-1) [debports]
Visualization library for OctoMap
libotb (7.0.0+dfsg-1)
ORFEO Toolbox library metapackage
libotb-apps (7.0.0+dfsg-1)
Plugins for ORFEO Toolbox applications
libpluto-jpl-eph-dev (0.0~git20180228-1.1)
development files to interact with JPL ephemeres data
libpluto-lunar-dev (0.0~git20180825.e34c1d1-1+b1 [amd64], 0.0~git20180825.e34c1d1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
development files for astronomical Lunar library
libpwiz-tools (3.0.18342-2+b1 [amd64], 3.0.18342-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
ProteoWizard command line tools
libqgis-customwidgets (3.4.13+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 3.4.12+dfsg-1 [m68k], 2.18.28+dfsg-2 [alpha, riscv64], 2.18.18+dfsg-3 [hppa], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64], 2.14.18+dfsg-1 [powerpcspe])
composants graphiques personnalisés de QGIS pour QT Designer
libqgis-server2.14.18 (2.14.18+dfsg-1) [debports]
QGIS –⋅bibliothèque serveur partagée
libqtpropertybrowser3 (3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64]) [debports]
Qt Property Browser Library - runtime
libsilo-bin (4.10.2.real-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 4.10.2.real-7 [alpha], 4.10.2.real-5 [powerpcspe], 4.10.2-5 [sparc64], 4.8-13 [sh4])
Utilities to manipulate libsilo files
libsimgrid3.11 (3.11.1-10 [hppa], 3.11.1-6 [arm64]) [debports]
Toolkit for scalable simulation of distributed applications
libssm-bin (1.4.0-1)
macromolecular superposition library - binaries
libvcflib-tools (1.0.0+dfsg-2 [amd64, ppc64el], 1.0.0~rc2+dfsg-4 [x32])
C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
libvdjtools-java (1.2.1+git20190311-1) [non-free]
Java library of vdjtools
libxy-bin (1.3-1.1+b2 [sparc64], 1.3-1.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.3-1.1 [alpha, powerpcspe, riscv64])
xylib - utilities
libyade (2019.01a-3 [amd64, arm64, i386, ppc64el, s390x], 2018.02b-5 [ppc64], 2018.02b-1 [x32], 2018.02a-2 [hppa], 2017.01a-9 [sparc64], 1.00.0-2 [alpha])
plateforme pour la méthode des éléments distincts — bibliothèques
liggghts (3.8.0+repack1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 3.7.0+repack1-1 [powerpcspe, sparc64], 3.5.0+repack1-10 [hppa], 3.5.0+repack1-9 [m68k], 1.5.1-5 [sh4])
Open Source DEM Particle Simulation Software.
limereg (1.4.1-4+b2 [m68k, ppc64], 1.4.1-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.4.1-3+b1 [hppa, sparc64], 1.4.1-3 [powerpcspe, sh4])
application légère de repérage d’image
linguider (4.1.1-1) [debports]
Astronomical autoguiding program for Linux
litl-tools (0.1.9-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.9-4 [powerpcspe])
Lightweight Trace Library - tools
logcentral (2.7-1.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.7-1.1+b1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4])
service de journalisation pour des applications distribuées
logcentral-tools (2.7-1.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.7-1.1+b1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4])
service de journalisation pour des applications distribuées
logol (1.7.9-1)
Pattern matching tool using Logol language
logol-bin (1.7.9-1+b1 [amd64], 1.7.9-1 [alpha, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64], 1.7.5-2 [m68k])
outil d'associations de modèles utilisant le langage Logol
loki (2.4.7.4-8)
analyse de déséquilibre de liaison avec des chaînes de Markov
looptools (2.8-1+b4 [mips64el], 2.8-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 2.8-1+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64], 2.8-1+b1 [riscv64])
Integral Evaluator of One-loop Feynman Diagram
lorene (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
framework for numerical relativity
lorene-codes-src (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
source files of LORENE-based codes
ltrsift (1.0.2-8)
post-traitement et classification de rétrotransposons LTR
lttoolbox-dev (3.5.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.5.0-3 [powerpcspe])
Development tools and library for lttoolbox
lucy (1.20-1+b1 [amd64], 1.20-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
DNA sequence quality and vector trimming tool
lutefisk (1.0.7+dfsg-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.0.7+dfsg-4 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
interprétation de novo d’un spectre de CID de peptide
lxi-tools (1.21-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.21-1 [powerpcspe])
LAN eXtensions for Instrumentation (LXI) software interface
macs (2.2.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1.2.1-1 [powerpcspe])
analyse basée sur modèles de ChIP-Seq venant de séquenceurs de lectures courtes
macsyfinder (1.0.5-3)
detection of macromolecular systems in protein datasets
maffilter (1.3.1+dfsg-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 1.3.1+dfsg-1 [sparc64], 1.1.0-1+dfsg-2+b2 [x32])
process genome alignment in the Multiple Alignment Format
maffilter-examples (1.3.1+dfsg-1)
process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)
mafft (7.453-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 7.407-2 [powerpcspe])
programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
mapdamage (2.1.1+dfsg-1)
tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences
mapsembler2 (2.2.4+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el, s390x], 2.2.3+dfsg-1 [alpha, hppa, ppc64, x32], 2.1.6+dfsg-1 [m68k, sh4, sparc64])
bioinformatics targeted assembly software
maq (0.7.1-8)
correspondance de lectures de séquences d'ADN polymorphique de longueur courte à des séquences de référence
maqview (0.2.5-9)
graphical read alignment viewer for short gene sequences
mash (2.2.2+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1+dfsg-2 [powerpcspe])
fast genome and metagenome distance estimation using MinHash
massxpert (3.4.1-1) [debports]
logiciel de spectrométrie de masse de polymères linéaires
matlab-gdf (0.1.3-3) [contrib]
IO library for the GDF -- Matlab interface
maude (2.7-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 2.7-2+b1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
cadriciel logique de haute performance
mauve-aligner (2.4.0+4736-2)
multiple genome alignment
mayavi2 (4.5.0-1+b1 [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, s390x], 4.5.0-1 [alpha, arm64, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 4.0.0-3+b1 [sh4])
paquet de visualisation scientifique de données 2D ou 3D
mbt (3.4-1+b1 [amd64], 3.4-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
générateur d’étiquetage basé sur la mémoire et étiqueteur
mbtserver (0.12-1)
Server extensions for the MBT tagger
meep (1.12.0-2 [amd64, armel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.7.0-3+b1 [hppa, riscv64], 1.7.0-3 [arm64, armhf, i386, mips64el, mipsel], 1.3-4+b4 [alpha], 1.3-4+b2 [sparc64], 1.3-1 [sh4], 0.10-2+b1 [m68k])
paquet logiciel pour la simulation FDTD
meep-lam4 (1.7.0-3+b1 [amd64, hppa, riscv64], 1.7.0-3 [arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.3-2+b4 [alpha], 1.3-2 [sh4])
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
meep-mpi (0.10-2+b1) [debports]
MIT Electromagnetic Equation Propagation, parallel (mpich) version
meep-mpi-default (1.12.0-2 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 1.7.0-3+b1 [hppa], 1.7.0-3 [armel, mips64el, mipsel, riscv64, sparc64], 1.3-3+b7 [alpha], 1.3-3+b2 [sh4])
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
meep-mpich2 (1.7.0-3+b1 [amd64], 1.7.0-3 [arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.3-4+b4 [alpha], 1.3-2+b1 [sh4])
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
meep-openmpi (1.12.0-3 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 1.7.0-3+b1 [hppa], 1.7.0-3 [armel, mips64el, mipsel, riscv64, sparc64], 1.3-3+b7 [alpha])
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
melting (5.2.0-1 [all], 4.3.1+dfsg-3 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32], 4.3.1+dfsg-1 [arm64])
calcule la température de fusion de duplex d'acide nucléique
merkaartor (0.18.3+ds-3 [powerpcspe], 0.18.1-3 [arm64]) [debports]
éditeur de carte pour OpenStreetMap.org
meryl (0~20150903+r2013-6+b1 [amd64], 0~20150903+r2013-6 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
in- and out-of-core kmer counting and utilities
metaphlan2 (2.9.22-1)
Metagenomic Phylogenetic Analysis
metaphlan2-data (2.6.0+ds-4)
data package for Metagenomic Phylogenetic Analysis
metastudent (2.0.1-7)
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence
metastudent-data (2.0.1-4)
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data files
metastudent-data-2 (1.0.0-4)
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data #2
metview (5.7.3-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 5.7.0-1 [hppa], 5.6.1-3 [m68k], 5.3.0-3 [ppc64, riscv64], 5.3.0-1 [sh4], 5.0.0~beta.1-1+b1 [alpha, powerpcspe], 4.9.1-1 [sparc64])
visualisation des données et environnement d’analyse interactifs
metview-data (5.7.3-1)
Data needed for the Metview data analysis environment
mgltools-bhtree (1.5.7-3) [non-free]
Bhtree library extension module
mgltools-cadd (1.5.7-4) [non-free]
Computer Aided Drug Discovery (CADD) Pipeline
mgltools-cmolkit (1.5.7~rc1+cvs.20140424-2) [non-free]
Python classes to interpret trajectories of Gromacs
mgltools-dejavu (1.5.7-3) [non-free]
visualization of 3D geometry using the OpenGL with Python
mgltools-geomutils (1.5.7-3) [non-free]
Python library for geometric analyses
mgltools-mglutil (1.5.7-4) [non-free]
Molecular Graphics Laboratory utility collection
mgltools-molkit (1.5.7-3) [non-free]
Python classes to read and manipulate molecules
mgltools-networkeditor (1.5.7-4) [non-free]
Python GUI library for the editing of networks
mgltools-opengltk (1.5.7-3) [non-free]
Opengltk Python extension
mgltools-pmv (1.5.7-3) [non-free]
Python-based Molecular Viewer
mgltools-pmv-test (1.5.7-3) [non-free]
Python-based Molecular Viewer (functionality tests)
mgltools-pyautodock (1.5.7-3) [non-free]
Python implementation of autodock
mgltools-pybabel (1.5.7-3) [non-free]
molecular structure file access and interpretation
mgltools-pyglf (1.5.7-3) [non-free]
GLF library Python extension to write text in OpenGL
mgltools-scenario2 (1.5.7-2) [non-free]
Python-based viewer of molecular structures
mgltools-sff (1.5.7-3) [non-free]
Simple Force Field for Python
mgltools-support (1.5.7-3) [non-free]
Update mechanism of MGLTools
mgltools-symserv (1.5.7-2) [non-free]
Symetry server
mgltools-utpackages (1.5.7-3) [non-free]
UT Austin software Python extensions
mgltools-viewerframework (1.5.7-3) [non-free]
ViewerFramework supports building visualization applications
mgltools-vision (1.5.7+dfsg-2) [non-free]
Python-based Visual Programming Environment
mgltools-visionlibraries (1.5.7-2) [non-free]
Extensions for Python-based Visual Programming Environment
mgltools-volume (1.5.7-3) [non-free]
Volume rendering Python package
mgltools-webservices (1.5.7-3) [non-free]
webservices for components of autodocktools
mhap (2.1.3+dfsg-2)
locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
mia-doctools (2.4.6-5)
Helper scripts for run-time document creation
mia-tools (2.4.6-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 2.4.6-4+b1 [alpha], 2.4.6-4 [riscv64], 2.4.6-3 [m68k], 2.4.6-2+b1 [hppa], 2.4.6-2 [sh4], 2.4.6-1 [powerpcspe], 2.4.5-1 [sparc64])
Command line tools for gray scale image processing
mia-viewit (1.0.5-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.0.5-1 [hppa, powerpcspe, sh4, sparc64])
programme de visualisation pour des ensembles de données en 3D créés avec MIA
mialmpick (0.2.14-2)
outils pour le choix de points de repère dans des ensembles de données de volumes en 3D
microbegps (1.0.0-5 [all], 1.0.0-1 [alpha, hppa, ppc64, x32])
explorative taxonomic profiling tool for metagenomic data
microbiomeutil (20101212+dfsg1-2)
utilitaires d'analyse de microbiome
microbiomeutil-data (20101212+dfsg1-2)
Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
microhope (4.5.7+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.5.6+dfsg-2 [alpha, hppa], 4.5.6+dfsg-1 [m68k, riscv64], 4.4.4+dfsg-4 [sparc64], 4.4.3+dfsg-2 [powerpcspe])
cadriciel matériel et logiciel pour apprendre les microcontrôleurs
minc-tools (2.3.00+dfsg-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 2.3.00+dfsg-3 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
Outils pour le format MNI d'imagerie médicale
minia (3.2.1-1+b1 [riscv64], 3.2.1-1 [alpha, amd64, arm64, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.6906-2 [armel, armhf, m68k, mipsel, powerpcspe, sh4])
short-read biological sequence assembler
miniasm (0.3+dfsg-1)
assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées
minimac4 (1.0.2-2)
Fast Imputation Based on State Space Reduction HMM
minimap (0.2-4)
correspondances approximatives de longues séquences biologiques telles que les lectures d’ADN
minimap2 (2.17+dfsg-1)
versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
minisat (1:2.2.1-5+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1:2.2.1-5+b2 [ppc64, sparc64, x32], 1:2.2.1-5+b1 [alpha, hppa, m68k, sh4], 1:2.2.1-5 [powerpcspe, riscv64])
solveur SAT rapide et léger
minisat+ (1.0-4)
solveur de contraintes pseudo booléennes
minisat2 (1:2.2.1-5+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1:2.2.1-5+b2 [ppc64, sparc64, x32], 1:2.2.1-5+b1 [alpha, hppa, m68k, sh4], 1:2.2.1-5 [powerpcspe, riscv64])
paquet de transition pour minisat
minisat2
paquet virtuel fourni par minisat
mipe (1.1-7)
Outil de sauvegarde de données dérivées de PCR
mira-assembler (4.9.6-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 4.9.6-4 [x32])
assembleur de séquences génomiques exprimées utilisant la méthode globale
mira-rfam-12s-rrna (4.9.6-4)
extract of RFAM 12 rRNA database
mirtop (0.4.23-1)
annotate miRNAs with a standard mirna/isomir naming
missfits (2.8.0-2)
Basic maintenance and packaging tasks on FITS files
mitools (2.0.3-2 [amd64, arm64, armel, armhf, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 2.0.3-1 [alpha, i386, riscv64], 2.0.3-0.1 [hppa], 2.0.2-0.3 [sparc64], 1.8.4-1 [sh4])
visualisation, conversion et opérations basiques pour des données d’images médicales
mldemos (0.5.1+git.1.ee5d11f-4+b1 [amd64], 0.5.1+git.1.ee5d11f-4 [alpha, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.5.1+git.1.ee5d11f-1 [powerpcspe, sh4, sparc64])
MLDemos (Machine Learning Demos) avec visualisation
mlpack-bin (3.2.2-1 [amd64, arm64, armhf, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 3.2.1-1 [armel, i386, sparc64], 3.0.4-1 [sh4], 3.0.3-3 [powerpcspe], 3.0.3-2 [alpha], 3.0.2-1 [hppa])
intuitive, fast, scalable C++ machine learning library (binaries)
mlv-smile (1.47-6)
Find statistically significant patterns in sequences
mmass-modules (5.5.0-5 [powerpcspe], 5.5.0-4 [arm64]) [debports]
Mass spectrometry tool for proteomics - extension modules
mmseqs2 (9-d36de+ds-4)
ultra fast and sensitive protein search and clustering
mmseqs2-examples (9-d36de+ds-4)
optional resources for the mmseqs2 package
mobyle-utils (1.5.5+dfsg-6 [powerpcspe], 1.5.3+dfsg-1 [arm64]) [debports]
outils binaires utilisés par Mobyle
mocassin (2.02.73-1+b1)
MOnte CArlo SimulationS of Ionised Nebulae
mocassin-benchmarks (2.02.73-1)
benchmarks for the photoionisation code MOCASSIN
mocassin-data (2.02.73-1)
atomic and optical data for the photoionisation code MOCASSIN
mocassin-examples (2.02.73-1)
Examples for the photoionisation code MOCASSIN
molds (0.3.1-1+b7 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64], 0.3.1-1+b6 [ppc64el], 0.3.1-1+b2 [mips64el, s390x, sparc64])
Semi-empirical electronic structure and molecular dynamics
mona (1.4-17-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4-17-1 [powerpcspe])
démonstration automatique de théorèmes
montage (6.0+dfsg-6+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.0+dfsg-6+b1 [alpha], 6.0+dfsg-6 [powerpcspe])
Toolkit for assembling FITS images into mosaics
montage-gridtools (6.0+dfsg-6+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.0+dfsg-6+b1 [alpha], 6.0+dfsg-6 [powerpcspe])
Create files to run montage on the grid
montecarlo-base (20061220+dfsg3-3.1)
[Physics] Common files for CERNLIB Monte Carlo libraries
montecarlo-data (20061220+dfsg3-3.1)
[Physics] data for CERNLIB Monte Carlo libraries
mopac7-bin (1.15-6+b4 [mips64el], 1.15-6+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.15-6+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32], 1.15-6+b1 [riscv64])
bibliothèque de chimie quantique semi-empirique – fichiers binaires
morse-simulator (1.4-5)
Multi-OpenRobot Simulation Engine
morse-simulator-data (1.4-5)
Multi-OpenRobot Simulation Engine
mothur (1.42.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.41.21-1 [powerpcspe], 1.36.1-1 [x32])
ensemble pour analyse de séquences pour la recherche sur le microbiome
mothur-mpi (1.36.1-1 [x32], 1.33.3+dfsg-2 [arm64]) [debports]
mpi-enabled binary for mothur
mpb (1.9.0-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.7.0-5 [riscv64, sparc64], 1.5-3+b4 [alpha], 1.5-3 [powerpcspe])
Photonic-Bands du MIT
mpb-mpi (1.9.0-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.7.0-5 [riscv64, sparc64], 1.5-3+b4 [alpha], 1.5-3 [powerpcspe])
programme Photonic-Bands du MIT, version parallèle (mpich)
mpb-scm (1.9.0-2)
MIT Photonic-Bands initialisation files
mpgrafic (0.3.18-1)
MPI version of N-body initial conditions grafic package
mpqc (2.3.1-19)
programme de chimie quantique massivement parallèle
mpqc-support (2.3.1-19)
Massively Parallel Quantum Chemistry – outils d’assistance
mpqc3 (0.0~git20170114-4.1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el], 0.0~git20170114-4 [alpha])
Massively Parallel Quantum Chemistry Program
mpqc3-data (0.0~git20170114-4.1)
Massively Parallel Quantum Chemistry Program (data files)
mptp (0.2.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.2.3-1 [powerpcspe, ppc64])
single-locus species delimitation
mrbayes (3.2.6+dfsg-2+b2 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64, sparc64, x32], 3.2.6+dfsg-2 [powerpcspe], 3.2.6+dfsg-1+b3 [alpha], 3.2.6+dfsg-1 [sh4])
Bayesian Inference of Phylogeny
mrbayes-mpi (3.2.6+dfsg-2+b2 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64, sparc64, x32], 3.2.6+dfsg-2 [powerpcspe], 3.2.6+dfsg-1+b3 [alpha], 3.2.6+dfsg-1 [sh4])
Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version
mriconvert (1:2.1.0-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1:2.1.0-2 [powerpcspe, sh4])
utilitaire de conversion de fichier d’image médicale
mricron (0.20140804.1~dfsg.1-3)
conversion, visualisation et analyse d’images de résonance magnétique
mricron-data (0.20140804.1~dfsg.1-3)
data files for MRIcron
mrpt-apps (1:1.5.8-1+b1 [ppc64, x32], 1:1.5.8-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1:1.5.6-1+b2 [alpha, mipsel], 1:1.4.0-7 [hppa, powerpcspe, sparc64], 1:0.9.5svn2563-1 [sh4])
boîte à outils pour la programmation robotique - applications graphiques et console
mrpt-common (1:1.5.8-1)
Mobile Robot Programming Toolkit - Example datasets and files
mrpt-libs (1:0.9.5svn2563-1) [debports]
Mobile Robot Programming Toolkit - All the libraries
mrs (6.0.5+dfsg-7+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 6.0.5+dfsg-7+b2 [powerpcspe, x32])
système de recherche d'information pour les banques de données
mrtrix (0.2.13-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.2.12-2.1 [hppa, powerpcspe], 0.2.12-2+b1 [sparc64], 0.2.11-1 [sh4])
tractographie de la substance blanche par IRM pondérée en diffusion
mrtrix3 (3.0~rc3+git135-g2b8e7d0c2-3+b1 [amd64], 3.0~rc3+git135-g2b8e7d0c2-3 [arm64, i386, x32])
tractographie de la substance blanche par IRM pondérée en diffusion
mseed2sac (2.3+ds1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.2+ds1-4 [powerpcspe])
Convert MiniSEED time series data to SAC
mssstest (3.0-7) [non-free]
Normalisation of disease scores for patients with Multiple Sclerosis
msxpertsuite (5.8.6-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.7.3.1-2 [alpha, hppa], 5.7.3-1 [sh4], 5.3.3-1 [powerpcspe])
suite logicielle de spectrographie de masse – métapaquet
msxpertsuite-massxpert (5.8.6-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.7.3.1-2 [alpha, hppa], 5.7.3-1 [sh4])
suite de logiciels de spectrométrie de masse – massXpert
msxpertsuite-massxpert-data-doc (5.8.6-2)
mass spectrometry software suite - massXpert - data and doc
msxpertsuite-minexpert (5.8.6-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.7.3.1-2 [alpha, hppa], 5.7.3-1 [sh4])
suite logicielle de spectrométrie de masse – mineXpert
msxpertsuite-minexpert-data-doc (5.8.6-2)
mass spectrometry software suite - mineXpert - data and doc
mummer (3.23+dfsg-4)
Alignement de séquence efficace de génomes complets
munipack (0.5.11-2.1)
Astronomical photometry software package
munipack-cli (0.5.11-2.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.5.10-2+b1 [powerpcspe, sh4])
Command line interface of Munipack
munipack-core (0.5.11-2.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.5.10-2+b1 [powerpcspe, sh4])
Core routines of Munipack
munipack-gui (0.5.11-2.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.5.10-2+b1 [powerpcspe, sh4])
interface graphique pour Munipack
murasaki (1.68.6-8+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.68.6-8 [x32])
homology detection tool across multiple large genomes
murasaki-common (1.68.6-8)
homology detection tool across multiple large genomes (common files)
murasaki-mpi (1.68.6-8+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.68.6-8 [x32])
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
muscle (1:3.8.1551-2)
Programme d'alignements multiples de séquences de protéine
music-bin (1.1.16-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 1.0.7-4+b1 [alpha, i386, powerpcspe, riscv64, sparc64], 1.0.7-4 [sh4])
Multi-Simulation Coordinator for MPI -- Utilities
mustang (3.2.3-3)
alignement structurel multiple de protéines
mustang-testdata (3.2.3-3)
multiple structural alignment of proteins, test data
nanook (1.33+dfsg-1)
pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data
nanopolish (0.11.1-1 [amd64, x32], 0.5.0-1+b2 [m68k], 0.5.0-1+b1 [alpha, hppa, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
consensus caller for nanopore sequencing data
nast-ier (20101212+dfsg1-2)
NAST-based DNA alignment tool
nastran (0.1.95-1+b2) [non-free]
NASA Structural Analysis System
nautic (1.5-4)
calcul de la position de l’observateur en navigation astronomique
ncbi-blast+ (2.9.0-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.9.0-2 [alpha, hppa, m68k, mips64el, mipsel, riscv64, sh4, x32], 2.8.1-1 [powerpcspe])
suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
ncbi-blast+-legacy (2.9.0-3)
script d’appel de legacy de BLAST du NCBI
ncbi-cn3d (3.0.20170106+dfsg1-7)
3-dimensional viewer for biological molecules
ncbi-entrez-direct (10.9.20190219+ds-1+b10 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 7.40.20170928+ds-1 [alpha, powerpcspe, ppc64, sparc64], 6.90.20170705+ds-2 [hppa, m68k, sh4, x32])
NCBI Entrez utilities on the command line
ncbi-epcr (2.3.12-1-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.3.12-1-7 [powerpcspe])
outil pour vérifier la présence d'un marqueur dans une séquence d'ADN
ncbi-rrna-data (6.1.20170106+dfsg1-7)
grandes bases de données BLAST d'ARN ribosomique distribuées avec le kit de développement du NCBI
ncbi-seg (0.0.20000620-5)
tool to mask segments of low compositional complexity in amino acid sequences
ncbi-tools-bin (6.1.20170106+dfsg1-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.1.20170106-6 [powerpcspe])
bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires en mode texte
ncbi-tools-x11 (6.1.20170106+dfsg1-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.1.20170106-6 [powerpcspe])
NCBI libraries for biology applications (X-based utilities)
ncl-ncarg (6.6.2-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 6.5.0-1 [sparc64], 6.4.0-9 [hppa])
NCAR Command Language and NCAR graphics
ncl-tools (2.1.21+git20190531.feceb81-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1.21+git20180827.c71b264-2 [powerpcspe])
tools to deal with NEXUS files
nco (4.9.0-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 4.8.1-1 [alpha], 4.7.9-1 [powerpcspe], 4.7.8-1 [hppa, sh4], 4.6.3-1 [x32])
opérateurs en ligne de commandes pour analyser des fichiers netCDF
ncoils (2002-7)
coiled coil secondary structure prediction
ncview (2.1.8+ds-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 2.1.8+ds-3 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
navigateur graphique X11 pour les fichiers au format NetCDF
neat (2.2-1)
Nebular Empirical Analysis Tool
neobio (0.0.20030929-4)
calcul d'alignements de séquences d'acides aminés et de nucléotides
netcdf-bin (1:4.6.2-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1:4.6.2-1 [alpha, powerpcspe, sh4, x32])
Programmes pour lire et écrire des fichiers NetCDF
neurodebian (0.39.0)
neuroscience-oriented distribution - repository configuration
neurodebian-archive-keyring (0.39.0)
neuroscience-oriented distribution - GnuPG archive keys
neurodebian-desktop (0.39.0)
neuroscience-oriented distribution - desktop integration
neurodebian-dev (0.39.0)
neuroscience-oriented distribution - development tools
neurodebian-freeze (0.39.0)
nd_freeze tool to freeze APT sources to use snapshots
neurodebian-popularity-contest (0.39.0)
neuroscience-oriented distribution - popcon integration
neuron (7.6.3-1+b1 [amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, x32], 7.6.3-1 [powerpcspe])
environnement de simulation pour des modèles de calcul de neurones
neuron-dev (7.6.3-1+b1 [amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, x32], 7.6.3-1 [powerpcspe])
Neuron simulation environment - Development files
nexus-tools (4.3.2-svn1921-6)
NeXus scientific data file format - applications
nifti2dicom (0.4.11-1+b4 [amd64, i386], 0.4.9-1 [alpha, hppa], 0.4.6-2 [ppc64], 0.4.6-1 [x32])
convert 3D medical images to DICOM 2D series
nifti2dicom-data (0.4.11-1)
data files for nifti2dicom
njplot (2.4-8)
programme de dessin d’arbre phylogénétique
norsnet (1.0.17-5)
tool to identify unstructured loops in proteins
norsp (1.0.6-4)
predictor of non-regular secondary structure
numdiff (5.9.0-1+b1 [amd64], 5.9.0-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
comparaison de fichiers similaires avec des champs numériques
nutsqlite (2.0.6-1)
Dietary nutrition analysis software
nwchem (6.8.1-5+b1 [amd64, arm64, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 6.8.1-5 [powerpcspe], 6.8+47+gitdf6c956-4 [m68k], 6.1-6 [alpha])
logiciel de calcul de haute performance pour la chimie numérique
nwchem-data (6.8.1-5)
High-performance computational chemistry software (data files)
oar-common (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler common package
oar-node (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler node package
oar-server (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler server package
oar-server-mysql (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler MySQL server backend package
oar-server-pgsql (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler PostgreSQL server backend package
oar-user (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler user package
oar-user-mysql (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler MySQL user backend package
oar-user-pgsql (2.5.8-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.8-1 [powerpcspe])
OAR batch scheduler PostgreSQL user backend package
oar-web-status (2.5.8-2)
OAR batch scheduler visualization tool package
obdgpslogger (0.16-1.3+b1 [powerpcspe], 0.16-1.2 [arm64]) [debports]
ensemble d’outils pour la journalisation de données OBD-II de GPS
objcryst-fox (1.9.6.0-2.1+b2 [ppc64], 1.9.6.0-2.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.9.6.0-2.1 [hppa, mips64el], 1.9.6.0-2 [m68k])
FOX – Free Objects for Xtallography
occt-draw (7.3.3+dfsg1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 7.3.0+dfsg1-5 [powerpcspe])
Open CASCADE Technology command interpreter and graphical test system
oce-draw (0.18.3-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 0.18.2-3 [alpha, powerpcspe, ppc64, sparc64], 0.17.2-2 [hppa])
OpenCASCADE Community Edition CAE platform shared library
octave-bart (0.5.00-1)
liaisons Octave pour BART
octave-biosig (1.9.3-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.3.0-2.2+b1 [hppa, sparc64], 1.3.0-2.2 [powerpcspe], 1.3.0-2 [sh4])
liaisons Octave à la bibliothèque BioSig
octave-gdf (0.1.3-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.1.2-2+b4 [hppa, sparc64], 0.1.2-2+b2 [sh4])
bibliothèque IO pour GDF – interface pour Octave
octave-lhapdf (5.9.1-6+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 5.9.1-6 [alpha, hppa, m68k], 5.9.1-5+b2 [ppc64, sparc64], 5.9.1-5+b1 [x32], 5.9.1-5 [powerpcspe])
Octave Bindings for LHAPDF
octave-psychtoolbox-3 (3.0.15.20190725.dfsg1-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.0.15.20190725.dfsg1-1 [x32], 3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1+b1 [hppa], 3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1 [powerpcspe], 3.0.11.20131017.dfsg1-3 [sh4, sparc64])
toolbox for vision research -- Octave bindings
octomap-tools (1.9.0+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.9.0+dfsg-2 [alpha, armel, armhf], 1.8.1+dfsg-1 [powerpcspe])
Tools for 3D occupancy grid mapping
octovis (1.9.0+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.9.0+dfsg-2 [alpha], 1.8.1+dfsg-1 [powerpcspe])
outil de visualisation pour OctoMap
odil (0.10.0-9)
C++11 library for the DICOM standard (application)
odin (2.0.3-2 [amd64, arm64, armel, armhf, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 2.0.3-1 [alpha, i386, riscv64], 2.0.3-0.1 [hppa], 2.0.2-0.3 [sparc64], 1.8.4-1 [sh4])
développement, simulation et exécution de séquences de résonance magnétique
ogdi-bin (4.1.0+ds-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.2.1+ds-4 [powerpcspe])
bibliothèque OGDI ( interface de magasins de données géographiques libre) – utilitaires
ompl-plannerarena (1.4.2+ds1-4)
Open Motion Planning Library (OMPL) plannerarena
openbabel (2.4.1+dfsg-6 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.4.1+dfsg-5.1 [alpha], 2.4.1+dfsg-3 [powerpcspe, sh4])
boîte à outils de chimie – interface en ligne de commande
openbabel-gui (2.4.1+dfsg-6 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.4.1+dfsg-5.1 [alpha], 2.4.1+dfsg-3 [powerpcspe, sh4])
boite à outils logicielle dans le domaine de la chimie − interface graphique
opencaster (3.2.2+dfsg-1.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 3.2.2+dfsg-1.1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, x32])
MPEG2 transport stream data generator and packet manipulator
openfoam (1906.191111+dfsg1-1 [amd64, arm64, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1906+dfsg1-1 [alpha, sparc64], 4.1+dfsg1-2.2 [powerpcspe])
Open source toolbox for Computational Fluid Dynamics (CFD) - binaries
openfoam-examples (1906.191111+dfsg1-1)
Open source toolbox for Computational Fluid Dynamics (CFD) - examples
openms (2.4.0-real-1)
package for LC/MS data management and analysis
openms-common (2.4.0-real-1)
package for LC/MS data management and analysis - shared data
openmx (3.8.5+dfsg1-1)
paquet de simulations nanométriques
openmx-data (3.8.5+dfsg1-1)
package for nano-scale material simulations (data)
openrocket (15.03.5) [contrib]
Simulateur de microfusée
openturns-examples (1.10-5+b2 [hppa, powerpcspe, ppc64, sparc64], 1.10-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.7-3+b1 [sh4])
examples of OpenTURNS functionalities
openturns-validation (1.10-5)
validation files for OpenTURNS
openuniverse (1.0beta3.1+dfsg-6+b1 [i386], 1.0beta3.1+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
simulateur d'univers 3D
openuniverse-common (1.0beta3.1+dfsg-6)
fichiers de données du simulateur en 3D de l’univers
opj2dat (20080225-2.1) [debports]
convertisseur de fichier projet OriginLab Origin en fichier de données
optgeo (2.25-1+b1 [amd64], 2.25-1 [arm64, armhf, i386], 2.21-1 [ppc64])
simulateur d'optique géométrique
opticalraytracer (9.6-1)
Virtual lens/mirror design workshop
optimir (1.0-2 [all], 1.0-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
Integrating genetic variations in miRNA alignment
origami (1.2.7+really0.7.4-1.1)
command-line management tool for Folding @ Home clients
orthanc (1.5.8+dfsg-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 1.5.2+dfsg-1 [hppa], 1.4.2+dfsg-2+b1 [powerpcspe], 1.3.2+dfsg-2+b1 [alpha, sparc64])
Lightweight, RESTful DICOM server for medical imaging
orthanc-dicomweb (1.0+dfsg-2 [amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.5+dfsg-3 [alpha], 0.5+dfsg-2+b1 [sparc64], 0.5+dfsg-2 [x32])
Plugin to extend Orthanc with support of WADO and DICOMweb
orthanc-imagej (1.2+dfsg-1)
ImageJ plugin to import images from Orthanc
orthanc-mysql (2.0-2+b1 [amd64], 2.0-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
Plugins to use MySQL or MariaDB as a database back-end to Orthanc
orthanc-postgresql (3.2-1+b1 [amd64], 3.2-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
Plugins to use PostgreSQL as a database back-end to Orthanc
orthanc-webviewer (2.5-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 2.5-1 [alpha], 2.4-2+b1 [sparc64], 1.2-1 [hppa])
Web viewer of medical images for Orthanc
orthanc-wsi (0.6-2+b1 [amd64], 0.6-2 [alpha, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.5-2+b2 [hppa])
Whole-slide imaging support for Orthanc (digital pathology)
oscar (1.1.0-testing-3-1)
Open Source CPAP Analysis Reporter (OSCAR)
ossim-core (2.9.1-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 2.9.1-1+b1 [alpha, hppa, sparc64, x32], 2.6.2-1 [powerpcspe])
utilitaires centraux d’OSSIM
otb-bin (7.0.0+dfsg-1)
applications en ligne de commande d’ORFEO Toolbox
otb-bin-qt (7.0.0+dfsg-1)
interface graphique pour les applications d’ORFEO Toolbox
otb-testdriver (7.0.0+dfsg-1)
bibliothèque d’ORFEO Toolbox – OTBTestDriver
otf-trace (1.12.5+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.12.5+dfsg-4 [m68k, powerpcspe, sh4])
Open Trace Format support library - development files
p4vasp (0.3.29+dfsg-1) [debports]
visualization suite for the Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP)
packmol (18.169-2)
Initial configurations for Molecular Dynamics Simulations
paje.app (1.98-1+b7 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1.98-1+b6 [ppc64], 1.98-1+b5 [alpha, x32], 1.98-1+b4 [hppa, m68k, sh4], 1.98-1+b3 [powerpcspe, sparc64], 1.98-1+b1 [riscv64])
outil générique de visualisation (diagramme de GANTT et autres)
pal2nal (14.1-2)
converts proteins to genomic DNA alignment
paleomix (1.2.13.3-1)
pipelines and tools for the processing of ancient and modern HTS data
paml (4.9j+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 4.9h+dfsg-1 [powerpcspe])
PAML – analyse de phylogenèse par maximum de vraisemblance
paraclu (9-2)
Parametric clustering of genomic and transcriptomic features
parafly (0.0.2013.01.21-4 [amd64, arm64, ppc64el, s390x], 0.0.2013.01.21-1 [ppc64, sparc64])
parallel command processing using OpenMP
paraview (5.7.0-2 [amd64, x32], 5.7.0-1 [arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 5.4.1+dfsg4-4 [alpha, armel, armhf, hppa, mipsel], 5.4.1+dfsg4-3.1+b1 [m68k], 5.4.1+dfsg4-3 [powerpcspe], 5.4.1+dfsg3-1 [sparc64], 3.14.1-1 [sh4])
application parallèle de visualisation
parsinsert (1.04-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.04-4 [powerpcspe])
Parsimonious Insertion of unclassified sequences into phylogenetic trees
parsinsert-testdata (1.04-6)
Test data for parsinsert
parsnp (1.2.1+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2+dfsg-5 [powerpcspe])
rapid core genome multi-alignment
patman (1.2.2+dfsg-6)
rapid alignment of short sequences to large databases
paw (1:2.14.04.dfsg.2-9.1+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:2.14.04.dfsg.2-1 [m68k])
Physics Analysis Workstation (Station d'analyse pour la physique) - programme d'analyse graphique
paw++ (1:2.14.04.dfsg.2-9.1+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:2.14.04.dfsg.2-1 [m68k])
Outils d'analyse physique (version améliorée avec Lesstif)
paw-common (1:2.14.04.dfsg.2-9.1)
Physics Analysis Workstation (common files)
paw-demos (1:2.14.04.dfsg.2-9.1)
Exemples et tests pour PAW
pbbamtools (0.23.0+dfsg-1+b1 [alpha, amd64, arm64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 0.19.0+dfsg-4 [powerpcspe])
processing Pacific Biosciences binary alignment/map files
pbbarcode (0.8.0-5 [amd64, arm64, m68k, mips64el, powerpcspe, ppc64el, riscv64, sh4], 0.8.0-4 [x32])
annotate PacBio sequencing reads with barcode information
pbdagcon (0.3+git20161121.0000000+ds-1.1+b2 [riscv64], 0.3+git20161121.0000000+ds-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4], 0.3+git20161121.0000000+ds-1.1 [powerpcspe], 0~20160325+ds-1 [x32])
sequence consensus using directed acyclic graphs
pbgenomicconsensus (2.3.2-5)
Pacific Biosciences variant and consensus caller
pbh5tools (0.8.0+git20170929.58d54ff+dfsg-1)
tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files
pbhoney (15.8.24+dfsg-3)
genomic structural variation discovery
pbjelly (15.8.24+dfsg-3)
genome assembly upgrading tool
pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-1)
simulateur pour les lectures de séquences de PacBio
pdb2pqr (2.1.1+dfsg-5+b1 [amd64], 2.1.1+dfsg-5 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1.1+dfsg-4 [powerpcspe])
Preparation of protein structures for electrostatics calculations
pegasus-wms (4.4.0+dfsg-8)
Scientific workflow management system for HTCondor
perlprimer (1.2.4-1)
Conception graphique d'amorce de PCR
perm (0.4.0-4)
efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
pftools (3+dfsg-3)
build and search protein and DNA generalized profiles
phast (1.5+dfsg-1 [alpha, amd64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, sh4, sparc64, x32], 1.4+dfsg-1 [ppc64, riscv64])
phylogenetic analysis with space/time models
phipack (0.0.20160614-3)
PHI test and other tests of recombination
phybin (0.3-3+b1 [armel], 0.3-3 [amd64, arm64, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32])
binning/clustering newick trees by topology
phylip (1:3.697+dfsg-1)
paquet de programmes pour déduire les phylogénies
phylonium (1.2-1)
Fast and Accurate Estimation of Evolutionary Distances
phyml (3:3.3.20190909-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3:3.3.20180621-2 [powerpcspe])
estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
physamp (1.1.0-1)
sample sequence alignment corresponding to phylogeny
phyutility (2.7.3+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.7.3-1 [hppa])
simple analyses or modifications on both phylogenetic trees and data matrices
phyx (1.0+ds-1)
UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences
picard-tools (2.18.25+dfsg-2)
outils en ligne de commande pour manipuler les fichiers SAM et BAM
picosat (965-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 960-1 [powerpcspe])
solveur SAT avec gestion de démonstrations et « core »
piler (0~20140707-2)
genomic repeat analysis
pilercr (1.06+dfsg-2)
software for finding CRISPR repeats
pilon (1.23+dfsg-1)
automated genome assembly improvement and variant detection tool
pirs (2.0.2+dfsg-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2.0.2+dfsg-6 [x32])
Profile based Illumina pair-end Reads Simulator
pirs-examples (2.0.2+dfsg-8)
profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (example data)
pirs-profiles (2.0.2+dfsg-8)
profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (profile data)
pkg-r-autopkgtest (20190917)
Script for the automatic testing of R packages
pktools (2.6.7.6+ds-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.6.7.6+ds-1 [powerpcspe], 2.6.7.3+ds-2 [sh4], 2.6.7.3+ds-1 [hppa])
utilitaires complémentaires pour GDAL pour un traitement efficace d'images matricielles
placnet (1.03-3)
Plasmid Constellation Network project
planets (0.1.13-20+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.13-19 [powerpcspe])
simulation gravitationnelle de corps planétaires
plasmidseeker (1.0+dfsg-1+b1 [amd64], 1.0+dfsg-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads
plast (2.3.2+dfsg-1 [amd64], 2.3.1+dfsg-4 [x32])
Parallel Local Sequence Alignment Search Tool
plast-example (2.3.2+dfsg-1)
Parallel Local Sequence Alignment Search Tool (example data)
plastimatch (1.8.0+dfsg.1-1+b1 [amd64], 1.8.0+dfsg.1-1 [i386], 1.6.2+dfsg-1 [hppa, sparc64, x32], 1.6.0+dfsg-1 [alpha], 1.5.15+dfsg-1 [ppc64])
reconstruction d’images médicales et recalage
plink (1.07+dfsg-2)
outils d'analyse d'associations sur le génome entier
plink1.9 (1.90~b6.12-191028-1 [amd64, armel, armhf, i386, mipsel], 1.90~b3b-150117-1+b1 [hppa], 1.90~b3b-150117-1 [sh4])
outils d'analyse d'associations sur le génome entier
pluto-jpl-eph (0.0~git20180228-1.1)
command line handling of JPL ephemeres data
pluto-lunar (0.0~git20180825.e34c1d1-1+b1 [amd64], 0.0~git20180825.e34c1d1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
routines for predictions of positions in solar system
pnetcdf-bin (1.12.0-1 [alpha, amd64, arm64, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.11.2-2 [mips64el], 1.9.0-1 [m68k, sh4], 1.8.1-3 [hppa, powerpcspe, x32])
Programs for reading and writing parallel NetCDF files
poa (2.0+20060928-7)
alignement d'ordre partiel pour les alignements multiples de séquences
populations (1.2.33+svn0120106+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.33+svn0120106+dfsg-2 [alpha, armel, armhf, riscv64], 1.2.33+svn0120106+dfsg-1 [powerpcspe])
logiciel de génétique de populations
porechop (0.2.4+dfsg-1+b1 [amd64], 0.2.4+dfsg-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
adapter trimmer for Oxford Nanopore reads
poretools (0.6.0+dfsg-4)
toolkit for nanopore nucleotide sequencing data
poretools-data (0.6.0+dfsg-4)
toolkit for nanopore nucleotide sequencing data -- sample datasets
pp-popularity-contest (1.0.6-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.0.6-4 [x32])
PredictProtein popularity contest
pprepair (0.0~20170614-dd91a21-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 0.0~20170614-dd91a21-3 [m68k, powerpcspe, sparc64, x32], 0.0~20170614-dd91a21-1+b4 [hppa])
outil de réparation de partition planaire
praat (6.1.07-1 [amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sparc64], 6.1.05-2 [alpha], 6.0.56-2 [ppc64], 6.0.49-2 [powerpcspe], 6.0.32-1 [hppa, sh4], 6.0.29-2 [x32])
programme pour l'analyse et la synthèse de la parole
prank (0.0.170427+dfsg-2)
Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
predictnls (1.0.20-5)
prédiction et analyse de signaux de localisation nucléaire de protéines
predictprotein (1.1.09-1)
suite of protein sequence analysis tools
prepair (0.7.1-3+b2 [amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 0.7.1-3+b1 [alpha, m68k, powerpcspe, sparc64], 0.7.1-3 [x32], 0.7.1-1+b4 [hppa])
outil de réparation de polygone
prepair-data (0.7.1-3)
outil de réparation de polygone – données d’exemples
prime-phylo (1.0.11-7+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.0.11-7 [x32])
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
primer3 (2.4.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2.3.7-3 [x32])
outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN
primer3-examples (2.4.0-2)
tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification (examples)
proalign (0.603-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.603-3 [hppa])
logiciel d'alignements de multiples séquences probabilistes
probabel (0.5.0+dfsg-3)
Toolset for Genome-Wide Association Analysis
probabel-examples (0.5.0+dfsg-3)
Example files for ProbABEL
probalign (1.4-8)
multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
probcons (1.12-12)
alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
probcons-extra (1.12-12)
Programmes optionnels pour le paquets probcons
proda (1.0-12)
Alignement multiple de séquences protéiques
prodigal (1:2.6.3-4)
Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
profbval (1.0.22-6)
prédicteur des résidus de protéine flexibles/rigides à partir d'une séquence
profisis (1.0.11-5)
prédiction des sites d'interaction protéine-protéine à partir d'une séquence
profnet-bval (1.0.22-6)
neural network architecture for profbval
profnet-chop (1.0.22-6)
neural network architecture for profchop
profnet-con (1.0.22-6)
neural network architecture for profcon
profnet-isis (1.0.22-6)
neural network architecture for profisis
profnet-md (1.0.22-6)
neural network architecture for metadisorder
profnet-norsnet (1.0.22-6)
neural network architecture for norsnet
profnet-prof (1.0.22-6)
neural network architecture for profacc
profnet-snapfun (1.0.22-6)
neural network architecture for snapfun
profphd (1.0.42-3)
secondary structure and solvent accessibility predictor
profphd-net (1.0.22-6)
neural network architecture for profphd
profphd-utils (1.0.10-5)
profphd helper utilities convert_seq and filter_hssp
proftmb (1.1.12-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 1.1.12-7 [powerpcspe], 1.1.12-6+b1 [x32], 1.1.12-6 [sparc64])
per-residue prediction of bacterial transmembrane beta barrels
progressivemauve (1.2.0+4713+dfsg-4)
multiple genome alignment algorithms
proj-bin (6.2.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 5.2.0-1 [powerpcspe])
bibliothèque de projection cartographique (outils)
proj-rdnap (2008+2018-1) [non-free]
RDNAP grid correction files for PROJ
prokka (1.14.5+dfsg-2)
rapid annotation of prokaryotic genomes
prooftree (0.13-1+b6 [hppa, m68k, sh4, sparc64, x32], 0.13-1+b5 [armel, armhf, ppc64], 0.13-1+b4 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 0.13-1+b2 [powerpcspe, riscv64])
visualisation d’arbre de preuve pour Proof General
proteinortho (6.0.8+dfsg-1 [alpha, amd64, hppa, m68k, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32], 5.16.b+dfsg-1 [powerpcspe])
Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
prottest (3.4.2+dfsg-3)
selection of best-fit models of protein evolution
pscan-chip (1.1-2)
ChIP-based identifcation of TF binding sites
pscan-chip-data (1.1-2)
auxiliary data for PScan-ChIP
pscan-tfbs (1.2.2-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.2-2 [powerpcspe])
search for transcription factor binding sites
psfex (3.17.1+dfsg-5+b2 [alpha], 3.17.1+dfsg-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 3.17.1+dfsg-3+b1 [sparc64])
Point Spread Function model extractor
psi3 (3.4.0-6+b5 [mips64el], 3.4.0-6+b4 [ppc64, sparc64], 3.4.0-6+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mipsel, powerpcspe, ppc64el, s390x, sh4], 3.4.0-6+b1 [riscv64])
suite de programme de chimie quantique
psi4 (1:1.2.1-2+b1 [hppa], 1:1.2.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1:1.2.1-1 [sh4], 1:1.1-6 [ppc64, sparc64])
Quantum Chemical Program Suite
psi4-data (1:1.2.1-2)
Quantum Chemical Program Suite (data files)
psortb (3.0.6+dfsg-1+b2)
bacterial localization prediction tool
psychopy (1.85.3.dfsg-1)
environnement pour créer des stimuli psychologiques en Python
psychtoolbox-3-common (3.0.15.20190725.dfsg1-1)
toolbox for vision research -- arch/interpreter independent part
psychtoolbox-3-lib (3.0.15.20190725.dfsg1-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.0.15.20190725.dfsg1-1 [x32], 3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1+b1 [hppa], 3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1 [powerpcspe], 3.0.11.20131017.dfsg1-3 [sh4, sparc64])
toolbox for vision research -- arch-specific parts
purify (2.0.0-4+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2.0.0-4+b2 [m68k, riscv64, sparc64], 2.0.0-4+b1 [alpha, powerpcspe])
Collection of routines for radio interferometric imaging
pyfai (0.18.0+dfsg1-3 [all], 0.3.5-1 [arm64])
Fast Azimuthal Integration scripts
pyformex-lib (0.8.6-4) [debports]
program to create 3D geometry from Python scripts.
pyfr (1.5.0-3)
flux reconstruction in Python
pymca (5.5.3+dfsg-1 [all], 4.7.4+dfsg-1 [arm64])
applications et boite à outils pour l’analyse de fluorescence de rayons X – scripts
pymca-data (5.5.3+dfsg-1)
fichiers de données indépendantes de l'architecture pour PyMca
pymoctool (0.5.0-4)
Python Multi-Order Coverage maps tool for Virtual Observatory
pymol (2.3.0+dfsg-1 [all], 2.2.0+dfsg-1.1 [powerpcspe, sparc64], 1.7.1.3-1 [arm64])
système de graphismes moléculaires
pymol-data (2.3.0+dfsg-1)
data files for PyMOL
pysatellites (2.6-1)
simulation de lancement de satellites
pythia8-data (8.1.86-1.2)
PYTHIA8 data files
python-cyvcf2 (0.10.8-1) [debports]
VCF parser based on htslib (Python 2)
python-drizzle-testdata (1.13.1-2)
Dithered image combination for Python (Test data)
python-escript (5.2-2 [powerpcspe, x32], 5.2-1 [sparc64], 5.1-6 [alpha, hppa], 4.2.0.1-4 [m68k]) [debports]
Escript/Finley finite elements Python2 system (with OpenMP)
python-escript-doc (5.4-2)
Documentation for Escript/Finley
python-escript-mpi (5.2-2 [powerpcspe, x32], 5.2-1 [sparc64], 5.1-6 [alpha, hppa], 4.2.0.1-4 [m68k]) [debports]
Escript/Finley finite elements Python2 system (OpenMP + MPI)
python-expyriment (0.7.0+git34-g55a4e7e-3.3)
Python library for cognitive and neuroscientific experiments
python-pybigwig (0.3.12-1+b1) [debports]
Python 2 module for quick access to bigBed and bigWig files
python3-airr (1.2.1-2)
Data Representation Standard library for antibody and TCR sequences
python3-alignlib (0.1.1+dfsg-1+b1 [amd64], 0.1.1+dfsg-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
edit and Hamming distances for biological sequences
python3-amp (0.6.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.6-2 [sparc64])
Atomistic Machine-learning Package (python 3)
python3-cyvcf2 (0.11.5-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, riscv64], 0.11.5-1 [alpha, m68k, mips64el, mipsel, sh4, x32], 0.10.8-1 [powerpcspe])
VCF parser based on htslib (Python 3)
python3-dcmstack (0.7-1)
DICOM to NIfTI conversion - python3 package
python3-deeptoolsintervals (0.1.9-1)
handlig GTF-like sequence-associated interal-annotation
python3-escript (5.4-2 [amd64, arm64, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 5.3-1 [armel, i386], 5.2-2 [powerpcspe, x32], 5.2-1 [sparc64], 5.1-6 [alpha, hppa], 4.2.0.1-4 [m68k])
Escript/Finley finite elements Python3 system (with OpenMP)
python3-escript-mpi (5.4-2 [amd64, arm64, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 5.3-1 [armel, i386], 5.2-2 [powerpcspe, x32], 5.2-1 [sparc64], 5.1-6 [alpha, hppa], 4.2.0.1-4 [m68k])
Escript/Finley finite elements Python3 system (OpenMP + MPI)
python3-geneimpacts (0.3.7-2)
wraps command line tools to assess variants in gene sequences
python3-gfapy (1.0.0+dfsg-3)
flexible and extensible software library for handling sequence graphs
python3-gffutils (0.9-2)
Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
python3-jupyter-sphinx (0.1.4-1)
Jupyter Sphinx Extension - Python3
python3-keras (2.2.4-1)
deep learning framework running on Theano or TensorFlow
python3-louvain (0.0+20181013git3fc1f575-1)
community graph analysis implementing Louvain method
python3-noise (1.2.3-2+b1 [amd64], 1.2.3-2 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
Perlin noise for image generation
python3-pomegranate (0.11.1+dfsg2-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 0.11.1+dfsg2-1 [alpha, hppa, m68k, sparc64, x32])
Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
python3-py2bit (0.3.0-2)
access to 2bit files
python3-pybel (0.12.1-1)
Biological Expression Language
python3-pybigwig (0.3.17-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 0.3.17-1 [alpha, m68k, sh4, x32], 0.3.12-1+b1 [powerpcspe])
Python 3 module for quick access to bigBed and bigWig files
python3-pynlpl (1.2.9-1)
PyNLPl is a library for Natural Language Processing (Python 3 version)
python3-qiskit (0.5.6-1)
Quantum Information Science Kit (QISKit) for Python 3
pyzo (4.4.3-1.2)
interactive editor for scientific Python
q2-cutadapt (2019.7.0-1)
QIIME 2 plugin to work with adapters in sequence data
q2-demux (2019.4.1-1)
QIIME 2 plugin for demultiplexing of sequence reads
q2-feature-classifier (2019.4.0-1)
QIIME 2 plugin supporting taxonomic classification
q2-feature-table (2019.4.0+dfsg-1)
QIIME 2 plugin supporting operations on feature tables
q2-quality-filter (2019.4.0-1)
QIIME2 plugin for PHRED-based filtering and trimming
q2-types (2019.7.0-1)
QIIME 2 plugin defining types for microbiome analysis
q2cli (2019.7.0-1)
Click-based command line interface for QIIME 2
q2templates (2019.10.0+dfsg-1)
Design template package for QIIME 2 Plugins
qasm-simulator-cpp (0.5.6-1)
QASM quantum circuit simulator with realistic noise written in C++
qcumber (1.0.14+dfsg-1)
quality control of genomic sequences
qfits-tools (6.2.0-8+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 6.2.0-8+b1 [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64, x32], 6.2.0-8 [powerpcspe, riscv64])
outils pour manipuler des fichiers FITS
qfitsview (4.0+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 4.0+dfsg-2 [alpha, armel, armhf], 3.3+p1+dfsg-2+b1 [powerpcspe])
visualisateur de fichier FITS basé sur DPUSER
qgis (3.4.13+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 3.4.12+dfsg-1 [m68k], 2.18.28+dfsg-2 [alpha, riscv64], 2.18.18+dfsg-3 [hppa], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64], 2.14.18+dfsg-1 [powerpcspe])
système d'information géographique –⋅SIG
qgis-api-doc (3.4.13+dfsg-3)
documentation de l'API de QGIS
qgis-common (3.4.13+dfsg-3)
QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture
qgis-mapserver (2.2.0-1) [debports]
QGIS mapserver
qgis-mapserver
paquet virtuel fourni par qgis-server
qgis-plugin-globe (2.2.0-1) [debports]
OSG globe plugin for QGIS
qgis-plugin-grass (3.4.13+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 3.4.12+dfsg-1 [m68k], 2.18.28+dfsg-2 [alpha, riscv64], 2.18.18+dfsg-3 [hppa], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64], 2.14.18+dfsg-1 [powerpcspe])
greffon GRASS pour QGIS
qgis-plugin-grass-common (3.4.13+dfsg-3)
greffon GRASS pour QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture
qgis-provider-grass (3.4.13+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 3.4.12+dfsg-1 [m68k], 2.18.28+dfsg-2 [alpha, riscv64], 2.18.18+dfsg-3 [hppa], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64], 2.14.18+dfsg-1 [powerpcspe])
fournisseur GRASS pour QGIS
qgis-providers (3.4.13+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 3.4.12+dfsg-1 [m68k], 2.18.28+dfsg-2 [alpha, riscv64], 2.18.18+dfsg-3 [hppa], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64], 2.14.18+dfsg-1 [powerpcspe])
fournisseurs de collections de données pour QGIS
qgis-providers-common (3.4.13+dfsg-3)
fournisseur de collections de données pour QGIS –⋅fichiers indépendants de l'architecture
qgis-server (3.4.13+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 3.4.12+dfsg-1 [m68k], 2.18.28+dfsg-2 [alpha, riscv64], 2.18.18+dfsg-3 [hppa], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64], 2.14.18+dfsg-1 [powerpcspe])
serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC
qgis-sqlanywhere (2.2.0-1) [debports]
QGIS sql anywhere plugin and provider
qiime (2019.7.0-2 [all], 1.9.1+dfsg-1+b2 [ppc64, sparc64], 1.9.1+dfsg-1+b1 [alpha, hppa, x32], 1.9.1+dfsg-1 [m68k, powerpcspe], 1.8.0+dfsg-4 [arm64])
QIIME, Quantitative Insights Into Microbial Ecology
qmapshack (1.14.0-1 [amd64, arm64, armhf, i386, mipsel], 1.11.1-4 [alpha, m68k, ppc64, sh4], 1.11.1-3 [riscv64, x32], 1.11.1-1 [hppa], 1.10.0-1 [powerpcspe], 1.9.0-1 [sparc64])
cartographie GPS (GeoTiff et vectorielle) et gestion d’appareils GPS
qmc (0.94-3.1)
Outil de simplification Quine McClusky
qnifti2dicom (0.4.11-1+b4 [amd64, i386], 0.4.9-1 [alpha, hppa], 0.4.6-2 [ppc64], 0.4.6-1 [x32])
conversion d’images médicales 3D en séries 2D DICOM – interface graphique
qrisk2 (0.1.20150729-4)
calculateur de risque de maladies cardiovasculaires
qthid-fcd-controller (4.1-5+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 4.1-5 [alpha, armel, armhf, riscv64], 4.1-3 [powerpcspe])
Funcube Dongle controller
qtltools (1.2+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1+dfsg-3+b1 [mipsel], 1.1+dfsg-3 [powerpcspe])
Tool set for molecular QTL discovery and analysis
quantum-espresso (6.4.1-1 [amd64, i386], 6.3-4 [alpha, arm64, armhf, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.0-3.1+b1 [hppa])
suite Electronic-Structure et Ab-Initio Molecular Dynamics
quantum-espresso-data (6.4.1-1)
Electronic-Structure and Ab-Initio Molecular Dynamics Suite (Documentation)
quorum (1.1.1-2)
QUality Optimized Reads of genomic sequences
qutemol (0.4.1~cvs20081111-13 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.4.1~cvs20081111-9 [powerpcspe, sh4])
visualisation interactive de macromolécules
r-cran-alakazam (0.3.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.2.11-1 [powerpcspe])
Immunoglobulin Clonal Lineage and Diversity Analysis
r-cran-sdmtools (1.1-221.2-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1-221.1-1 [alpha], 1.1-221-1 [powerpcspe])
Species Distribution Modelling Tools
r-cran-shazam (0.2.1-1)
Immunoglobulin Somatic Hypermutation Analysis
r-cran-tigger (0.4.0-1)
Infers new Immunoglobulin alleles from Rep-Seq Data
raccoon (1.0b-4) [contrib]
preparation of in silico drug screening projects
racon (1.4.10-1)
consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
radiant (2.7.1+dfsg-1)
explore hierarchical metagenomic data with zoomable pie charts
ragout (2.1.1+dfsg-1)
Reference-Assisted Genome Ordering UTility
ragout-examples (2.1.1+dfsg-1)
Reference-Assisted Genome Ordering UTility (example data)
rambo-k (1.21+dfsg-3)
Read Assignment Method Based On K-mers
rampler (1.1.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1.0-1 [powerpcspe])
module for sampling genomic sequences
rapmap (0.15.0+dfsg-1)
rapid sensitive and accurate DNA read mapping via quasi-mapping
rapmap-dev (0.15.0+dfsg-1)
rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping (some headers)
rapmap-example-data (0.15.0+dfsg-1)
example data for rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping
rasmol (2.7.6.0-1)
visualisation de macromolécules biologiques
raster3d (3.0-4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 3.0-3-5 [powerpcspe], 3.0-3-2+b1 [x32])
outils pour la génération d'images de protéines ou d'autres molécules
rate4site (3.0.0-6)
detector of conserved amino-acid sites
rawtran (1.1-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1-1 [powerpcspe])
RAW photo to FITS converter
raxml (8.2.12+dfsg-1)
ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
ray (2.3.1-7 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2.3.1-6 [alpha, powerpcspe, riscv64, sparc64])
de novo genome assemblies of next-gen sequencing data
ray-extra (2.3.1-7)
Scripts and XSL sheets for post-processing for ray
rdkit-data (201903.1-2)
Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)
rdp-classifier (2.10.2-4)
extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s
readseq (1-13)
conversion entre formats de séquences
reapr (1.0.18+dfsg-4)
outil universel pour l’évaluation d’assemblage de génomes
refmac-dictionary (5.41-1)
dictionary for macromolecular refinement and model building
relion-bin (1.4+dfsg-4 [amd64, i386], 1.4+dfsg-3+b1 [alpha, hppa, powerpcspe, ppc64, riscv64, sparc64, x32], 1.4+dfsg-3 [m68k, sh4])
toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
relion-bin+gui (1.4+dfsg-4 [amd64, i386], 1.4+dfsg-3+b1 [alpha, hppa, powerpcspe, ppc64, riscv64, sparc64, x32], 1.4+dfsg-3 [m68k, sh4])
parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
relion-bin+mpi (1.4+dfsg-4 [amd64, i386], 1.4+dfsg-3+b1 [alpha, hppa, powerpcspe, ppc64, riscv64, sparc64, x32], 1.4+dfsg-3 [m68k, sh4])
parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
relion-bin+mpi+gui (1.4+dfsg-4 [amd64, i386], 1.4+dfsg-3+b1 [alpha, hppa, powerpcspe, ppc64, riscv64, sparc64, x32], 1.4+dfsg-3 [m68k, sh4])
parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
repeatmasker-recon (1.08-4)
finds repeat families from biological sequences
reprof (1.0.1-7)
prédicteur de structure secondaire de protéines et d'accessibilité
resfinder (3.2-1)
identify acquired antimicrobial resistance genes
resfinder-db (0.0+git20191001.149209d-1)
ResFinder database is a curated database of acquired resistance genes
resfinder-example (3.2-1)
identify acquired antimicrobial resistance genes (example data)
rivet (1.8.3-3)
Robust Independent Validation of Experiment and Theory
rivet-plugins (1.8.3-3)
Analysis plugins of Rivet
rivet-plugins-data (1.8.3-3)
Data files of Rivet analysis plugins
rivet-plugins-dev (1.8.3-3)
Template generator of Rivet analysis plugin
rna-star (2.7.3a+dfsg-1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 2.5.2a+dfsg-2 [x32], 2.4.2a+dfsg-1+b1 [m68k], 2.4.2a+dfsg-1 [sh4])
aligneur universel et ultra-rapide de RNA-seq
rnahybrid (2.1.2-5)
prédiction rapide et efficace des complexes microARN/cible
roary (3.13.0+dfsg-1)
pipeline de pangénome autonome et très rapide
roguenarok (1.0-3)
versatile and scalable algorithm for rogue taxon identification
rsem (1.3.2+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.26+dfsg-2 [m68k, powerpcspe])
RNA-Seq by Expectation-Maximization
rtax (0.984-6)
Classification of sequence reads of 16S ribosomal RNA gene
ruby-rgfa (1.3.1+dfsg-1)
parse, edit and write GFA format graphs in Ruby
runcircos-gui (0.0+git20180828.97703b9-1+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.0+git20180828.97703b9-1 [alpha, armel, armhf, powerpcspe])
outil graphique pour exécuter circos
sac2mseed (1.12+ds1-3)
Convert SAC waveform data to MiniSEED
saga (7.3.0+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 2.3.1+dfsg-3+b6 [hppa], 2.3.1+dfsg-3+b3 [sparc64], 2.3.1+dfsg-3+b2 [powerpcspe, sh4])
système d’analyses automatisées géoscientifiques
saga-common (7.3.0+dfsg-3)
SAGA GIS architecture independent files
saint (2.5.0+dfsg-3)
Significance Analysis of INTeractome
salmid (0.1.23-1)
rapid Kmer based Salmonella identifier from sequence data
salmon (0.12.0+ds1-1+b1)
wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
salome-kernel (6.5.0-8.1) [debports]
Numerical simulation pre- and post-processor
sambamba (0.6.7-2)
tools for working with SAM/BAM data
samblaster (0.1.24-2)
marks duplicates, extracts discordant/split reads
samtools (1.9-6 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.9-5 [alpha], 1.9-4 [powerpcspe])
traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
samtools-test (1.9-6)
test files for the samtools package
saods9 (8.0.1+repack-2 [all], 7.3.2+repack-1 [arm64])
outil d’affichage d’image pour l’astronomie
sasview (5.0.1-1)
Small Angle Scattering Analysis suite
sat4j (2.3.5-0.3)
bibliothèque de solveurs SAT en Java
savi (1.5.1-3+b1 [amd64], 1.5.1-3 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
représentation de constellations satellitaires
sbmltoolbox (4.1.0-4)
libsbml toolbox for octave and matlab
scamp (2.0.4+dfsg-1+b3 [alpha], 2.0.4+dfsg-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 2.0.4-3 [sparc64])
Compute astrometric and photometric solutions
science-biology (1.11)
paquets Debian Science concernant la biologie
science-chemistry (1.11)
paquets pour la chimie de Debian Science
science-config (1.11)
paquet de configuration pour le projet Debian Science
science-dataacquisition (1.11)
paquets d’acquisition de données de Debian Science
science-dataacquisition-dev (1.11)
Debian Science data acquisition development packages
science-distributedcomputing (1.11)
paquets pour le calcul distribué de Debian Science
science-economics (1.11)
Debian Science Economics packages
science-electronics (1.11)
paquet de transition pour l’électronique de Debian Science
science-electrophysiology (1.11)
paquets de Debian Science pour l'électrophysiologie
science-engineering (1.11)
paquets pour l’ingénierie de Debian Science
science-engineering-dev (1.11)
Debian Science Engineering-dev packages
science-financial (1.11)
Debian Science financial engineering and computational finance
science-geography (1.11)
paquets pour la géographie de Debian Science
science-geometry (1.11)
Debian Science geometry packages
science-highenergy-physics (1.11)
Debian Science High Energy Physics packages
science-highenergy-physics-dev (1.11)
Debian Science High Energy Physics development packages
science-imageanalysis (1.11)
paquets d’analyse d’image de Debian Science
science-linguistics (1.11)
paquets pour la linguistique de Debian Science
science-logic (1.11)
Debian Science Logic packages
science-machine-learning (1.11)
paquets pour l’apprentissage automatique de Debian Science
science-mathematics (1.11)
Paquets Debian pour les Sciences Mathématiques
science-mathematics-dev (1.11)
Debian Science Mathematics-dev packages
science-meteorology (1.11)
paquets pour la météorologie de Debian Science
science-meteorology-dev (1.11)
Debian Science Meteorology-dev packages
science-nanoscale-physics (1.11)
paquets Debian pour les nanosciences
science-nanoscale-physics-dev (1.11)
paquets de développement Debian pour les nanosciences
science-neuroscience-cognitive (1.11)
paquets pour les neurosciences cognitives de Debian Science
science-neuroscience-modeling (1.11)
paquets de Debian Science pour la modélisation de systèmes neuronaux
science-numericalcomputation (1.11)
paquets pour le calcul numérique de Debian Science
science-physics (1.11)
paquet de physique pour Debian Science
science-physics-dev (1.11)
Debian Science Physics-dev packages
science-presentation (1.11)
Debian Science generic tools for presentations
science-psychophysics (1.11)
paquets pour la psychophysique de Debian Science
science-robotics (1.11)
paquets de robotique de Debian
science-robotics-dev (1.11)
Debian Robotics development packages
science-simulations (1.11)
Debian Science Simulation packages
science-statistics (1.11)
paquets pour les statistiques de Debian Science
science-tasks (1.11)
tâches de Debian Science pour tasksel
science-typesetting (1.11)
paquets pour la composition typographique de Debian Science
science-viewing (1.11)
paquets pour la visualisation des données de Debian Science
science-viewing-dev (1.11)
Debian Science development of visualisation applications
scoary (1.6.16-2)
pangenome-wide association studies
scram (0.16.2-1+b2 [amd64, arm64, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.16.2-1+b1 [armel, armhf], 0.16.2-1 [powerpcspe])
Probabilistic Risk Analysis Tool
scram-gui (0.16.2-1+b2 [amd64, arm64, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.16.2-1+b1 [armel, armhf], 0.16.2-1 [powerpcspe])
frontal graphique pour SCRAM
scrm (1.7.3-1)
simulator of evolution of genetic sequences
sctk (2.4.10-20151007-1312Z+dfsg2-3)
speech recognition scoring toolkit
scythe (0.994+git20141017.20d3cff-1)
Bayesian adaptor trimmer for sequencing reads
sdaps (1.9.7-0.2)
scripts for data acquisition with paper-based surveys
sdrangelove (0.0.1.20150707-3+b1 [amd64, arm64, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.0.1.20150707-3 [alpha, hppa, m68k, riscv64], 0.0.1.20150707-2+b4 [sparc64])
radio logicielle d'Osmocom
seaview (1:4.7-1)
interface multiplateforme pour l’alignement de séquences et la phylogénie
seer (1.1.4-2+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 1.1.4-2+b1 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64, x32])
genomic sequence element (kmer) enrichment analysis
segemehl (0.3.4-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.3.4-1 [alpha, powerpcspe])
associations de lectures courtes avec des trous
segyio-bin (1.8.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.8.3-1 [alpha, m68k, powerpcspe, sh4, x32])
SEG-Y read/write library for seismic processing (shell utilities)
seq-gen (1.3.4-2) [non-free]
simulate the evolution of nucleotide or amino acid sequences
seqan-apps (2.4.0+dfsg-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 2.4.0+dfsg-8 [sh4], 2.3.2+dfsg2-4 [hppa, sparc64], 2.3.1+dfsg-4 [powerpcspe])
C++ library for the analysis of biological sequences
seqmagick (0.7.0-1)
imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO
seqprep (1.3.2-3)
stripping adaptors and/or merging paired reads of DNA sequences with overlap
seqprep-data (1.3.2-3)
example data set for seqprep - only used for testing
seqsero (1.0.1+dfsg-1)
Salmonella serotyping from genome sequencing data
seqtk (1.3-1)
Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format
sextractor (2.25.0+ds-2 [all], 2.19.5+dfsg-1 [arm64])
paquet factice de transition pour un changement de nom
sga (0.10.15-4 [amd64, arm64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 0.10.15-2 [powerpcspe, x32], 0.10.14-2 [alpha, hppa, ppc64, sparc64])
de novo genome assembler that uses string graphs
shapeit4 (4.0+dfsg-1)
fast and accurate method for estimation of haplotypes (phasing)
shelxle (1.0.1018-1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.985-1 [alpha], 1.0.952-1 [powerpcspe])
interface graphique pour SHELXL
shogun-cmdline-static (3.2.0-9)
boîte à outils pour apprentissage automatique à large échelle
sibsim4 (0.20-4)
Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN
sickle (1.33+git20150314.f3d6ae3-1)
windowed adaptive trimming tool for FASTQ files using quality
siconos (4.2.0+git20181026.0ee5349+dfsg.2-1)
modeling and simulation of nonsmooth dynamical systems (simulation runner tool)
siconos-mechanics-tools (4.2.0+git20181026.0ee5349+dfsg.2-1)
modeling and simulation of nonsmooth dynamical systems (mechanics tools)
sift (4.0.3b-6) [non-free]
predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect
sigma-align (1.1.3-6)
alignement de multiples séquences d'ADN non codant
sigviewer (0.6.2-2+b1 [amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 0.6.2-2 [alpha, armel, armhf, riscv64], 0.5.1+svn556-5 [hppa, powerpcspe, sparc64], 0.5.1+svn556-1 [sh4])
visionneur graphique pour biosignaux tels que EEG, EMG et ECG
silx (0.11.0+dfsg-2)
Toolbox for X-Ray data analysis - Executables
sim4 (0.0.20121010-5)
Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique
sim4db (0~20150903+r2013-6+b1 [amd64], 0~20150903+r2013-6 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
batch spliced alignment of cDNA sequences to a target genome
simgrid-java (3.24+dfsg-1.1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.24+dfsg-1 [sh4], 3.23+dfsg2-3 [alpha], 3.21+dfsg-4 [powerpcspe], 3.11.1-10 [hppa])
Java bindings for the SimGrid Toolkit
simka (1.5.1-1)
comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
simkamin (1.5.1-1)
approximate comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
siril (0.9.12-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x], 0.9.11-1+b2 [alpha, m68k], 0.9.11-1+b1 [ppc64, x32], 0.9.8.3-1 [hppa], 0.9.7-1+b1 [sparc64], 0.9.7-1 [powerpcspe, sh4])
outil de traitement d'images astronomiques
siril-common (0.9.12-2)
architecture-independent files for siril
skesa (2.3.0-2)
strategic Kmer extension for scrupulous assemblies
skewer (0.2.2-1)
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skycat (3.1.2+starlink1~b+dfsg-5+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.1.2+starlink1~b+dfsg-5+b1 [powerpcspe, sh4])
Image visualization and access to catalogs and data for astronomy
slang-xfig (0.2.0~.117-2)
produce plots and drawings through Xfig's fig2dev in S-Lang
sleepyhead (1.0.0-beta-2+dfsg-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 1.0.0-beta-2+dfsg-6 [sparc64], 1.0.0-beta-2+dfsg-5 [powerpcspe])
logiciel de suivi de sommeil avec un focus sur le traitement de surveillance CPAP
smalr (1.1+dfsg-2)
interrogation of the methylation status of nucleotide sequencing reads
smalt (0.7.6-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.7.6-4 [m68k, sh4])
Sequence Mapping and Alignment Tool
smalt-examples (0.7.6-8)
Sequence Mapping and Alignment Tool (examples)
smithwaterman (0.0+git20160702.2610e25-7)
determine similar regions between two strings or genomic sequences
smrtanalysis (0~20180814)
software suite for single molecule, real-time sequencing
snakemake (5.8.1-1)
pythonic workflow management system
snap (2013-11-29-9)
location of genes from DNA sequence with hidden markov model
snap-aligner (1.0~beta.18+dfsg-3)
Scalable Nucleotide Alignment Program
snaphu (2.0.3-1) [non-free]
Statistical-Cost, Network-Flow Algorithm for 2D Phase Unwrapping
sniffles (1.0.11+ds-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1.0.7+ds-1 [hppa, sparc64])
structural variation caller using third-generation sequencing
snp-sites (2.5.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.4.1-1 [powerpcspe])
code binaire pour le paquet snp-sites
snpomatic (1.0-4)
logiciel de mappage strict et rapide de « lectures courtes »
soapaligner (2.20-3)
aligner of short reads of next generation sequencers
soapdenovo (1.05-5)
short-read assembly method to build de novo draft assembly
soapdenovo2 (241+dfsg-3)
méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire un assemblage brouillon de novo
soapsnp (1.03-3)
resequencing utility that can assemble consensus sequence of genomes
solvate (1.0-2) [non-free]
arranges water molecules around protein structures
solvate-doc (1.0-2) [non-free]
Documentation for solvate
sortmerna (2.1-3)
tool for filtering, mapping and OTU-picking NGS reads
source-extractor (2.25.0+ds-2)
extracteur de sources dans des images astronomiques
spaced (1.2.0-201605+dfsg-1)
alignment-free sequence comparison using spaced words
spades (3.13.1+dfsg-2)
assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
spass (3.7-4)
démonstrateur automatique de théorème pour la logique du premier ordre avec égalité
spatialite-bin (4.3.0-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 4.3.0-2+b2 [powerpcspe])
extension géospatiale pour SQLite – outils
spd (1.3.0-1+b5 [mips64el], 1.3.0-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64el, s390x], 1.3.0-1+b3 [ppc64], 1.3.0-1+b2 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, sh4, sparc64, x32], 1.3.0-1+b1 [riscv64])
Synchrotron image corrections and azimuthal integration
splash (2.9.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.8.0-1+b1 [powerpcspe])
Visualisation tool for Smoothed Particle Hydrodynamics simulation
spoa (3.0.1-1)
SIMD partial order alignment tool
sprai (0.9.9.23+dfsg-2)
single-pass sequencing read accuracy improver
spread-phy (1.0.7+dfsg-2)
analyze and visualize phylogeographic reconstructions
spview (2.0.0~beta2-2)
Spectrum Viewer
squizz (0.99d+dfsg-2)
convertisseur pour les séquences génétiques et les alignements
sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1+b1 [amd64], 2.3.5-2+dfsg-1 [x32])
utilities for the NCBI Sequence Read Archive
sra-toolkit-libs-dev (2.3.5-2+dfsg-1) [debports]
Development files for the NCBI SRA Toolkit's libraries
sra-toolkit-libs0 (2.3.5-2+dfsg-1) [debports]
Libraries for the SRA Toolkit
srst2 (0.2.0-6 [amd64], 0.1.8-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, ppc64, sparc64, x32])
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
ssake (4.0-3)
application de génomique pour assembler des millions de séquences très courtes d’ADN
ssake-examples (4.0-3)
example data for SSAKE, a genomic assembler of short reads
sspace (2.1.1+dfsg-4)
scaffolding pre-assembled contigs after extension
ssw-align (1.1-4)
Smith-Waterman aligner based on libssw
stacks (2.41+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.2+dfsg-1 [powerpcspe])
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
staden (2.0.0+b11-4)
DNA sequence assembly (Gap4/Gap5), editing and analysis tools
staden-common (2.0.0+b11-4)
Architecture independent files for Staden
staden-io-lib-examples (1.14.11-6)
programs for manipulating DNA sequencing files (usage examples)
staden-io-lib-utils (1.14.11-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.14.9-4 [x32])
programs for manipulating DNA sequencing files
stardata-common (0.8+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.8 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
cadriciel commun de gestion des paquets pour l’astronomie
starplot (0.95.5-8.3)
Un afficheur de carte stellaire en perspective 3D
starpu-contrib-examples (1.3.2+dfsg-2+b1) [contrib]
Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs
starpu-examples (1.3.2+dfsg-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.3.2+dfsg-4 [alpha, hppa, riscv64, sparc64], 1.2.6+dfsg-7 [powerpcspe])
Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs
stellarium (0.19.2-1+b1 [amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 0.19.2-1 [alpha, armel, armhf, hppa, riscv64, sparc64], 0.18.1-1 [powerpcspe])
générateur de ciel photo-réaliste en temps réel
stellarium-data (0.19.2-1)
Stellarium data files
step (4:19.08.1-1+b1 [amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 4:19.08.1-1 [alpha, armel, armhf, hppa, riscv64, sh4, sparc64], 4:17.08.3-1 [powerpcspe])
simulateur interactif pour la physique de KDE
stiff (2.4.0-3)
convert scientific FITS images to the TIFF format
stilts (3.2-1)
Starlink Tables Infrastructure Library Tool Set
stimfit (0.16.0-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.15.8-1+b1 [alpha, mipsel], 0.15.8-1 [m68k, powerpcspe, sh4])
Programme pour visualiser et analyser des données d’électrophysiologie
stringtie (2.0.4+ds-3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.3.6+dfsg-1 [alpha], 1.3.5+dfsg-1 [i386, powerpcspe])
assemble short RNAseq reads to transcripts
subread (2.0.0+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el], 1.4.6-p2+dfsg-2 [x32])
toolkit for processing next-gen sequencing data
subread-data (2.0.0+dfsg-1)
data files for subread package
suitename (0.3.070628-2)
categorize each suite in an RNA backbone
sumaclust (1.0.31-2)
fast and exact clustering of genomic sequences
sumatra (1.0.31-2)
fast and exact comparison and clustering of sequences
sumo (1.3.1-5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.1.0+dfsg1-1+b1 [alpha], 0.32.0+dfsg1-2 [powerpcspe], 0.32.0+dfsg1-1+b1 [hppa, sh4])
Simulation of Urban MObility (SUMO)
surankco (0.0.r5+dfsg-2)
Supervised Ranking of Contigs in de novo Assemblies
survex (1.2.42-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.2.36-1+b1 [powerpcspe, sh4])
logiciel de relevé et de cartographie de grotte
survex-aven (1.2.42-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.2.36-1+b1 [powerpcspe, sh4])
visionneur de levé de grotte sophistiqué pour Survex
swarm (2.2.2+dfsg-2)
robust and fast clustering method for amplicon-based studies
swarp (2.38.0+dfsg-4)
Resample and co-add together FITS images
swarp
paquet virtuel fourni par suckless-tools
swe-basic-data (1.80.00.0002-1)
basic data files for the libswe package
swe-standard-data (00004-1)
standard data for the Swiss Ephemeris
sweed (3.2.1+dfsg-1+b1 [amd64], 3.2.1+dfsg-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
assessment of SNPs for their evolutionary advantage
syrthes (4.3.0-dfsg1-3+b1 [riscv64], 4.3.0-dfsg1-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 4.3.0-dfsg1-1 [sh4])
simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide
syrthes-gui (4.3.0-dfsg1-3)
simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – interface graphique
syrthes-tests (4.3.0-dfsg1-3)
cas à tester pour SYRTHES
syrthes-tools (4.3.0-dfsg1-3+b1 [riscv64], 4.3.0-dfsg1-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 4.3.0-dfsg1-1 [sh4])
simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – outils
t-coffee (12.00.7fb08c2-4)
alignement multiple de séquences
t-coffee-examples (12.00.7fb08c2-4)
exemples annotés pour l'utilisation de T-Coffee
tabix (1.9-11)
indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations
tandem-mass (1:201702011-1+b1 [amd64], 1:201702011-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
mass spectrometry software for protein identification
tantan (22-1+b1 [amd64], 22-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences
tcd-utils (20061127-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 20061127-2+b1 [ppc64], 20061127-2 [alpha, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
convertisseur de fichiers TCD (Tide Constituent Database)
tcliis (8.0.1+repack-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 8.0.1+repack-2 [powerpcspe])
Tcl IIS protocol package
terraintool (1.13-2)
création de modèles de terrain au format survex à partir de données SRTM ou ASTER
tessa (0.3.1-6.2+b1 [powerpcspe], 0.3.1-6.1 [arm64]) [debports]
Simulation de systèmes optiques 3D avec la méthode FDTD
tessa-mpi (0.3.1-6.2+b1 [powerpcspe], 0.3.1-6.1 [arm64]) [debports]
simulation de systèmes optiques 3D avec la méthode FDTD dans des grappes MPI
thepeg (1.8.0-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.8.0-4 [x32], 1.8.0-3 [powerpcspe])
Toolkit for High Energy Physics Event Generation
thepeg-gui (1.8.0-4)
Java GUI of ThePEG
thepeg-reference (1.8.0-4)
Code reference of ThePEG
therion (5.4.4ds1-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 5.4.4ds1-1+b1 [alpha, riscv64], 5.4.1ds1-2 [hppa, sh4], 5.4.1ds1-1 [powerpcspe, sparc64])
levé de cavité souterraine – logiciel de dessin en 2D et 3D
therion-viewer (5.4.4ds1-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 5.4.4ds1-1+b1 [alpha, riscv64], 5.4.1ds1-2 [hppa, sh4], 5.4.1ds1-1 [powerpcspe, sparc64])
levé de grotte – visualisateur 3D pour les modèles de Therion
theseus (3.3.0-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.3.0-6 [powerpcspe])
superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance
theseus-examples (3.3.0-8)
superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance – exemples
tigr-glimmer (3.02b-2)
Détection de gènes dans des archées et des bactéries
timbl (6.4.13-1+b1 [amd64], 6.4.13-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
apprentissage automatique – Tilburg Memory Based Learner
timblserver (1.12-1+b1 [amd64], 1.12-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
extensions de serveur pour TiMBL
tksao (8.0.1+repack-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 8.0.1+repack-2 [powerpcspe])
Tk widgets for astronomical imaging and data visualization
tm-align (20190708+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 20170708+dfsg-2 [alpha, mipsel, powerpcspe, sh4])
alignement structurel de protéines
tnseq-transit (3.0.1-1 [amd64, ppc64, x32], 2.5.2-1 [alpha, hppa], 2.3.2-1 [m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64])
statistical calculations of essentiality of genes or genomic regions
topcat (4.7-1)
Tool for OPerations on Catalogues And Tables
tophat (2.1.1+dfsg1-2+b1 [alpha, amd64, arm64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 2.1.1+dfsg1-2 [x32])
fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
tophat-recondition (1.4-1)
post-processor for TopHat unmapped reads
topp (2.4.0-real-1+b2 [amd64], 2.4.0-real-1+b1 [arm64, i386, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.4.0-real-1 [alpha, mips64el, mipsel, powerpcspe], 2.0.0-4+b3 [hppa])
ensemble de programmes implémentant The OpenMS Proteomic Pipeline
toppred (1.10-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.10-6 [powerpcspe], 1.10-1 [sh4])
transmembrane topology prediction
toulbar2 (1.0.0+dfsg3-2)
Exact combinatorial optimization for Graphical Models
toulbar2-doc (1.0.0+dfsg3-2)
Exact combinatorial optimization for Graphical Models - documentation
trace2dbest (3.0.1-1)
bulk submission of chromatogram data to dbEST
trace2dbest-doc (3.0.1-1)
Documentation and sample files for trace2dbest
tracetuner (3.0.6~beta+dfsg-2)
interpretation of DNA Sanger sequencing data
transcalc (0.14-6)
calculateur de ligne de transmission RF et micro-ondes
transdecoder (5.0.1-2)
find coding regions within RNA transcript sequences
transrate-tools (1.0.0-2)
assistant pour Transrate
transtermhp (2.09-4+b1 [amd64], 2.09-4 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
trouve les terminateurs de transcription dans les génomes bactériens
travis (190101-1)
analyse et visualisation de trajectoires
tree-ppuzzle (5.2-11)
Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum
tree-puzzle (5.2-11)
reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale
treeview (1.1.6.4+dfsg1-4)
réimplémentation en Java de TreeView de Michael Eisen
treeviewx (0.5.1+git20100823.7e4d0e9-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.5.1+git20100823.7e4d0e9-1 [powerpcspe, sh4])
affiche et imprime les arbres phylogénétiques
triangle-bin (1.6-2) [non-free]
High-quality 2-D mesh generator binary programs
trim-galore (0.6.5-1)
automate quality and adapter trimming for DNA sequencing
trimmomatic (0.39+dfsg-1)
outil flexible de découpage de lecture pour les données Illumina NGS
trinityrnaseq (2.6.6+dfsg-6)
assemblage de novo de séquences d’Arn
trinityrnaseq-examples (2.6.6+dfsg-6)
assemblage de novo de séquences d’Arn – fichiers de test et d’exemple
trnascan-se (2.0.3-1) [non-free]
detection of transfer RNA genes in genomic sequence
trnascan-se-common (2.0.3-1) [non-free]
detection of transfer RNA genes in genomic sequence (common files)
tunnelx (20170928-2)
logiciel pour le levé de caverne
tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-2)
genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms
twms (0.07z-1)
minuscule service de cartographie web
ubertooth (2018.12.R1-2)
2.4 GHz wireless development platform for Bluetooth experimentation
ubertooth-firmware (2018.12.R1-2)
micrologiciels pour Ubertooth
ubertooth-firmware-source (2018.12.R1-2)
code source du micrologiciel d’Ubertooth
uc-echo (1.12-12 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.12-11 [sh4], 1.12-10 [powerpcspe])
algorithme de correction d'erreurs pour les lectures courtes réalisées à partir de NGS
ucto (0.14-2)
analyseur lexical pour Unicode
uctodata (0.8-2)
fichiers de données pour Ucto
ugene (1.31.1+dfsg-1) [non-free]
integrated bioinformatics toolkit
ugene-data (1.31.1+dfsg-1) [non-free]
required data for UGENE - integrated bioinformatics toolkit
uhd-host (3.14.1.1-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.14.1.1-1 [m68k, sh4], 3.14.1.0-2 [alpha, hppa], 3.13.1.0-3 [powerpcspe])
pilote matériel universel pour les produits Ettus Research – applications hôtes
umis (1.0.3-2 [amd64, arm64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 1.0.3-1 [alpha, hppa, powerpcspe, ppc64, sparc64, x32])
tools for processing UMI RNA-tag data
umis-examples (1.0.3-2)
tools for processing UMI RNA-tag data (examples)
unanimity (3.3.0+dfsg-2.1)
generate and process accurate consensus nucleotide sequences
unicycler (0.4.8+dfsg-2)
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
unicycler-data (0.4.8+dfsg-2)
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
units-filter (3.9-1+b1 [amd64], 3.9-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
analyseur d'expressions concernant des valeurs physiques
urg-utils (0.8.18-2) [debports]
utilities for Hokuyo URG/UTM laser range scanners
utopia-documents (3.0.2-1.1 [powerpcspe], 2.4.4-2 [arm64]) [debports]
PDF reader that displays interactive annotations on scientific articles
v-sim (3.7.2-6)
visualisation de structures atomiques
v-sim-common (3.7.2-6)
visualisation de structures atomiques – fichiers de prise en charge
v-sim-plugins (3.7.2-6)
greffons pour V_Sim (paquet de visualisation 3D)
varna (3-93+ds-2)
appliquette de visualisation d’ARN
varscan (2.4.3+dfsg-3) [non-free]
variant detection in next-generation sequencing data
vcftools (0.1.16-1)
ensemble d'outils pour travailler avec les fichiers VCF
vdjtools (1.2.1+git20190311-1) [non-free]
framework for post-analysis of B/T cell repertoires
velvet (1.2.10+dfsg1-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.10+dfsg1-5 [powerpcspe])
assembleur de séquences d'acides nucléiques pour de très courtes lectures
velvet-example (1.2.10+dfsg1-6)
données d’exemples pour l’assembleur génomique Velvet
velvet-long (1.2.10+dfsg1-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.10+dfsg1-5 [powerpcspe])
assembleur de séquences d’acide nucléique pour des très courtes lectures, version longue
velvet-tests (1.2.10+dfsg1-6)
données de test pour l’assembleur de séquences Velvet
velvetoptimiser (2.2.6-2)
optimisation automatique de paramètres pour Velvet, assembleur génomique de type de novo
veusz (3.0.1-1)
application de préparations scientifique 2D et 3D en mode graphique
veusz-helpers (1.21.1-1.3 [m68k], 1.21.1-1.1 [powerpcspe], 1.21.1-1+b1 [sparc64], 1.20.1-3 [arm64]) [debports]
modules d’assistance spécifiques aux architectures pour Veusz
viewmol (2.4.1-25)
interface graphique pour les programmes de calculs de chimie
virulencefinder (2.0.3+git20190809.dde157a-1)
identify virulence genes in total or partial sequenced isolates of bacteria
virulencefinder-examples (2.0.3+git20190809.dde157a-1)
example data for virulencefinder
visp-images-data (3.2.0-1)
bibliothèque pour asservissement visuel – ensembles de données de référence
vistrails (3.0~git+9dc22bd-2 [all], 2.0.alpha~1-2 [alpha, sh4, sparc64])
boîte à outils de visualisation de flux de travail scientifique
vitables (3.0.0-1)
outil graphique pour éditer ou parcourir des fichiers PyTables et HDF5
vmtk (1.3+dfsg-2.3) [non-free]
the Vascular Modeling Toolkit
voro++ (0.4.6+dfsg1-3)
library for the computation of the Voronoi diagram
voro++-examples (0.4.6+dfsg1-3)
library for the computation of the Voronoi diagram (examples)
voronota (1.19.2352-1)
Voronoi diagram-based tool to find atom contacts
votca-csg (1.5.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.5-3 [powerpcspe, sparc64], 1.4.1-1+b1 [alpha, hppa])
moteur pour grosses granularités de VOTCA
votca-csg-scripts (1.5.1-1)
scripts pour grosses granularités de VOTCA
votca-csg-tutorials (1.5.1-1)
tutoriels pour grosses granularités de VOTCA
vowpal-wabbit (8.6.1.dfsg1-1+b1 [amd64, i386], 8.6.1.dfsg1-1 [x32], 7.3-1.1+b3 [alpha, ppc64], 7.3-1.1+b2 [armel, armhf, hppa, m68k, mipsel, s390x, sh4, sparc64], 7.3-1.1+b1 [arm64, mips64el, ppc64el])
algorithme rapide et extensible d’apprentissage automatique en ligne
voxbo (1.8.5~svn1246-3+b1 [powerpcspe], 1.8.5~svn1246-1.1 [arm64]) [debports]
traitement, analyse statistique et affichage de données d’imagerie cérébrale
vrrender (19.0.0-1)
DICOM viewer
vsearch (2.14.1-2)
outil pour le traitement de séquences métagénomiques
wcslib-tools (6.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 6.2-2 [powerpcspe])
Command line tools utilizing wcslib
wcstools (3.9.5-3)
Handle the WCS of a FITS image
weightwatcher (1.12+dfsg-1)
association de cartes et polygones pour le traitement d’images astronomiques
weka (3.6.14-1)
algorithmes d'apprentissage automatique pour l’exploration de données
wfrog (0.8.2+svn973-1)
logiciel web personnalisable pour stations météo
wham-align (0.1.5-2)
Wisconsin's High-Throughput Alignment Method
wigeon (20101212+dfsg1-2)
réimplémentation de l'utilitaire de détection d'anomalies de l'ADN 16S Pintail
wise (2.4.1-21)
comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines
wsclean (2.8-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.6-1+b3 [powerpcspe])
Fast generic widefield interferometric imager
wxastrocapture (1.8.1+git20140821.796e1a1+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.8.1+git20140821+dfsg-2 [powerpcspe, sh4])
Windows linuX Astronomy Capture
x13as (1.1-B39-1) [non-free]
seasonal adjustment software for modeling time series
xbs (0-10+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0-10 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
modèles 3D et animations de molécules
xcas (1.4.9.69+dfsg1-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64], 1.2.3.57+dfsg1-2+b6 [alpha, powerpcspe], 1.2.3.57+dfsg1-2+b4 [m68k], 1.2.3.57+dfsg1-2 [sh4])
système de calcul formel – calculateur graphique et en console
xcrysden (1.5.60-1+b3 [powerpcspe], 1.5.60-1 [arm64]) [debports]
visualisation de structure cristalline et moléculaire
xdrawchem (1:1.10.2.1-2+b2 [amd64], 1:1.10.2.1-2+b1 [arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:1.10.2.1-2 [alpha, armel, armhf, powerpcspe])
éditeur de structures chimiques et de réactions
xflr5 (6.09.06-2+b1 [powerpcspe], 6.09.06-2 [arm64]) [debports]
outil d'analyse pour les profils aérodynamiques
xfoil (6.99.dfsg+1-1)
programme d’analyse et de conception de profil d'élément aérodynamique subsonique
xmakemol (5.16-9+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 5.16-9 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires
xmakemol-gl (5.16-9+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 5.16-9 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires – OpenGL
xmds (1.6.6-7) [debports]
eXtensible Multi-Dimensional Simulator
xmds2 (3.0.0+dfsg-2)
simulateur extensible multidimensionnel
xpa-tools (2.1.19-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.1.18-4 [powerpcspe])
outils pour une communication ininterrompue entre des programmes Unix
xplot (1.19-9+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1.19-9+b1 [alpha, ppc64], 1.19-9 [m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
simple traceur de données en coordonnées cartésiennes sur un écran
xplot-xplot.org (0.90.7.1-4+b1 [amd64], 0.90.7.1-4 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
Outil rapide pour tracer et visualiser de nombreuses données
xppaut (6.11b+1.dfsg-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 6.11b+1.dfsg-1+b1 [ppc64], 6.11b+1.dfsg-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
résolution de différentes sortes d’équation avec Phase Plane Plus Auto
xtide (2.13.2-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 2.13.2-1+b2 [hppa, m68k, sh4, sparc64], 2.13.2-1+b1 [alpha], 2.13.2-1 [powerpcspe, riscv64])
prévisions des courants et marées
xtide-coastline (20020202-1)
données de littoral pour xtide
xtide-data (20100529-1)
données d’harmoniques pour xtide
xtide-data-nonfree (20100529-1) [non-free]
Harmonics data for xtide (Canada, Netherlands, Germany and UK)
xyscan (4.30-2+b3 [amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.30-2+b2 [alpha, armel, armhf, hppa, riscv64, sparc64], 4.30-2 [powerpcspe])
pilleur de données pour les scientifiques
yade (2019.01a-3 [amd64, arm64, i386, ppc64el, s390x], 2018.02b-5 [ppc64], 2018.02b-1 [x32], 2018.02a-2 [hppa], 2017.01a-9 [sparc64], 1.00.0-2 [alpha])
plateforme pour la modélisation d'élément discret
yagv (0.4~20130422.r5bd15ed+dfsg-4)
encore un autre visionneur de G-code
yaha (0.1.83-1+b1 [amd64], 0.1.83-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
find split-read mappings on single-end queries
yale (5.0.95-2) [non-free]
stellar data set from the Yale Bright Star Catalog
yorick (2.2.04+dfsg1-10)
langage interprété et graphiques scientifiques
yorick-av (0.0.5-1+b1)
production de vidéos dans divers formats depuis Yorick
yorick-cubeview (2.2-2)
afficheur de données 3D FITS spécialisé en imagerie spectrale
yorick-curses (0.1-6+b3 [mipsel, ppc64], 0.1-6+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1-6+b1 [powerpcspe, riscv64])
Interface avec la bibliothèque (n)curses pour le langage Yorick
yorick-data (2.2.04+dfsg1-10)
bibliothèque interprétée pour le langage Yorick
yorick-dev (2.2.04+dfsg1-10)
fichiers de développement pour le langage interprété Yorick
yorick-full (2.2.04+dfsg1+full+b1 [amd64], 2.2.04+dfsg1+full [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
installation complète de l'interprèteur Yorick et ses greffons
yorick-gl (1.1+cvs20070922+dfsg-6.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.1+cvs20070922+dfsg-6.1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
gestion graphique OpenGL 3D pour le langage Yorick
yorick-gy (0.0.5-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.0.5-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
introspection GObject et interfaces Gtk pour Yorick
yorick-gyoto (1.4.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.4.3-1 [riscv64, sparc64], 1.3.6-1 [alpha], 1.3.1-1 [powerpcspe], 1.2.0-4+b5 [x32], 1.2.0-4+b1 [hppa], 1.0.2-2 [m68k], 1.0.2-1 [sh4])
General relativistic geodesic integration for the Yorick language
yorick-hdf5 (0.8.0-8+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.8.0-8 [m68k, powerpcspe, ppc64, sh4, sparc64])
Interface avec le format de fichiers HDF5 pour le langage Yorick
yorick-imutil (0.5.7-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.5.7-3 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
routines de manipulations d'images rapides pour le langage Yorick
yorick-mira (1.1.0+git20170124.3bd1c3~dfsg1-2)
reconstruction d'image d'interferométrie optique avec Yorick
yorick-ml4 (0.6.0-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.6.0-3 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
prise en charge du format de fichier Matlab pour le langage Yorick
yorick-mpeg (0.1-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 0.1-3 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
gestion de la sortie MPEG pour le langage Yorick
yorick-mpy-common (2.2.04+dfsg1-10)
Message Passing Yorick - fichiers communs
yorick-mpy-mpich2 (2.2.04+dfsg1-10)
Message Passing Yorick - basé sur MPICH2
yorick-mpy-openmpi (2.2.04+dfsg1-10)
Message Passing Yorick - basé sur OpenMPI
yorick-optimpack (1.3.2+dfsg+1.4.0-1)
optimization of large scale problems for the Yorick language
yorick-soy (1.4.0-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.4.0-3 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
opérations sur les matrices creuses pour le langage Yorick
yorick-spydr (0.8.2-3)
analyse simple et affichage d’image FITS
yorick-svipc (0.16-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 0.16-4 [m68k, sh4, x32], 0.16-3 [powerpcspe])
interprocess communication (shared memory...) for Yorick
yorick-yao (5.4.0-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 5.4.0-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
simulation de système d’optique adaptative basé sur Yorick
yorick-yeti (6.4.0-1)
module utilitaire pour le langage Yorick
yorick-yeti-fftw (6.4.0-1)
greffon FFT pour le langage Yorick
yorick-yeti-regex (6.4.0-1)
expressions rationnelles POSIX pour le langage Yorick
yorick-yeti-tiff (6.4.0-1)
lecture du format d’image TIFF pour le langage Yorick
yorick-ygsl (1.2.1-1+b2 [mips64el], 1.2.1-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mipsel, powerpcspe, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.2.1-1 [riscv64, sh4])
greffon pour des fonctions GSL spéciales, pour le langage Yorick
yorick-ynfft (1.0.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x], 1.0.3-1 [alpha, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sh4, sparc64, x32])
transformation de Fourier rapide non uniforme pour Yorick
yorick-yutils (1.5.2-1)
divers utilitaires pour le langage Yorick
yorick-z (1.2.0+cvs20080115-5+b4 [ppc64], 1.2.0+cvs20080115-5+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x], 1.2.0+cvs20080115-5+b1 [hppa, m68k, sh4, sparc64, x32], 1.2.0+cvs20080115-5 [powerpcspe, riscv64])
prise en charge de zlib, jpeg et png par le langage Yorick
z3 (4.8.6-2+b3 [ppc64], 4.8.6-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 4.8.6-2 [alpha], 4.4.1-0.3 [powerpcspe])
justificateur de théorème de Microsoft Research
z88 (13.0.0+dfsg2-6)
programme d'analyse d'éléments finis - exécution
z88-data (13.0.0+dfsg2-6)
programme d'analyse d'éléments finis - données
zalign (0.9.1-4)
alignement parallèle local de séquences biologiques
zegrapher (3.0.2-1+b2 [amd64], 3.0.2-1+b1 [arm64, i386, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 3.0.2-1 [alpha, armel, armhf, hppa, m68k, powerpcspe, riscv64, sparc64])
tracé de courbes planes pour des fonctions et des suites mathématiques
zimpl (3.3.6-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, mipsel, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.3.6-1 [powerpcspe])
langage de modélisation mathématiques pour les problèmes d'optimisation
ztex-bmp (20120314-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mipsel, ppc64], 20120314-2 [m68k, sparc64])
analyseur universel de macro