Paquet : freebayes (1.3.7-1 et autres)

[ Paquet source : freebayes  ]

détection bayésienne de polymorphismes basée sur les haplotypes et génotypage

FreeBayes est un détecteur de variant génétique bayésien conçu pour détecter des petits polymorphismes, plus spécialement les polymorphismes d'un seul nucléotide (SNP), les indels (insertions et suppressions), les polymorphismes de nucléotides multiples (MNP) et les évènements complexes (évènements d’insertion et de substitution composites), plus petits que la longueur d’un alignement de séquençage de lecture courte.

Autres paquets associés à freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.5)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64	1.3.7-1+b1	1 459,7 ko	3 736,0 ko	[liste des fichiers]