Paquet : python3-parmed (4.3.1+dfsg-1)

[ Paquet source : parmed  ]

éditeur de fichier de paramètre et de topologie et simulateur de mécanique moléculaire

ParmEd est un paquet conçu pour créer et manipuler facilement des systèmes moléculaires qui sont complètement décrits par un champ de force classique commun. Les champs de force pris en charge comprennent Amber, CHARMM, AMOEBA et plusieurs autres qui partagent une forme fonctionnelle similaire (par exemple, GROMOS).

ParmEd peut lire et écrire une grande variété de formats de fichier différents, tels que les fichiers de topologie et de coordonnées d’Amber, PSF de CHARMM, fichiers de paramètres, coordonnées et topologie, Tinker, fichiers de paramètres, coordonnées et topologie et plusieurs autres. La structure de données centrale (la classe « Structure ») rend simple, rapide et sécurisée la manipulation d’un système chimique, de sa topologie sous-jacente et des paramètres de champ de force décrivant sa fonction d’énergie potentielle.

ParmEd est composée de deux parties, une IPA documentée qu’il est possible d’incorporer dans des scripts de Python ou des programmes et une paire de programmes graphique et en ligne de commande qui fournissent des moyens de réaliser rapidement des modifications diverses dans des systèmes chimiques pour un prototypage rapide.

L’IPA fournit aussi des liaisons pour la bibliothèque OpenMM, permettant de conduire des investigations dynamiques moléculaires en utilisant ParmEd sur du matériel hautement performant tel que des GPU d’AMD ou de NVidia.

Autres paquets associés à python3-parmed

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

Télécharger python3-parmed

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	18 247,1 ko	35 266,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	18 244,4 ko	35 274,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	18 246,3 ko	35 274,0 ko	[liste des fichiers]