Paquet : python3-parmed (3.4.3+dfsg-1 et autres)

[ Paquet source : parmed  ]

éditeur de fichier de paramètre et de topologie et simulateur de mécanique moléculaire

ParmEd est un paquet conçu pour créer et manipuler facilement des systèmes moléculaires qui sont complètement décrits par un champ de force classique commun. Les champs de force pris en charge comprennent Amber, CHARMM, AMOEBA et plusieurs autres qui partagent une forme fonctionnelle similaire (par exemple, GROMOS).

ParmEd peut lire et écrire une grande variété de formats de fichier différents, tels que les fichiers de topologie et de coordonnées d’Amber, PSF de CHARMM, fichiers de paramètres, coordonnées et topologie, Tinker, fichiers de paramètres, coordonnées et topologie et plusieurs autres. La structure de données centrale (la classe « Structure ») rend simple, rapide et sécurisée la manipulation d’un système chimique, de sa topologie sous-jacente et des paramètres de champ de force décrivant sa fonction d’énergie potentielle.

ParmEd est composée de deux parties, une IPA documentée qu’il est possible d’incorporer dans des scripts de Python ou des programmes et une paire de programmes graphique et en ligne de commande qui fournissent des moyens de réaliser rapidement des modifications diverses dans des systèmes chimiques pour un prototypage rapide.

L’IPA fournit aussi des liaisons pour la bibliothèque OpenMM, permettant de conduire des investigations dynamiques moléculaires en utilisant ParmEd sur du matériel hautement performant tel que des GPU d’AMD ou de NVidia.

Autres paquets associés à python3-parmed

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [non amd64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

Télécharger python3-parmed

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	3.4.3+dfsg-1+b3	399,8 ko	2 561,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	3.4.3+dfsg-1+b2	398,2 ko	2 577,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	3.4.3+dfsg-1+b2	400,4 ko	2 577,0 ko	[liste des fichiers]