Paketti: python3-pairtools-examples (0.3.0-3.2 ja muut) [debports]

Links for python3-pairtools-examples

Debian-palvelut:

Vikailmoitukset

Imuroi lähdekoodipaketti :

Ei löytynyt

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Muut pakettiin python3-pairtools-examples liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

enh: python3-pairtools

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Imuroi python3-pairtools-examples

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.3.0-3.2+b2	12.1 kt	50.0 kt	[tiedostoluettelo]