Package: ssake (4.0-2)

[ Source: ssake  ]

aplicación de genómica para ensamblar millones de secuencias muy cortas de ADN

El ensamblaje de secuencias cortas por búsqueda K-mer y extensión de lectura de 3' («Short Sequence Assembly by K-mer search and 3′ read Extension», SSAKE) es una aplicación de genómica para ensamblaje agresivo de de millones de secuencias cortas de nucleótidos mediante la búsqueda progresiva de 3'-most k-mers perfectos usando un árbol de prefijos de ADN. SSAKE está diseñado para ayudar a nivelar la información de lecturas de secuencias cortas mediante agrupamiento riguroso de las mismas en contingentes que pueden usarse para caracterizar nuevos objetivos de secuenciación.

Tags: Field: Biology, Implemented in: Perl, implemented-in::python, interface::commandline, User Interface: Command Shell, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Analysing

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