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Paket: tabix (1.9-12~deb10u1)

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Ähnliche Pakete:

Allgemeiner Indexierer für tabulator-getrennte Genom-Positions-Dateien

Tabix indexiert Dateien, wobei Spalten zur Definition der Sequenzkoordinaten genutzt werden: Name (für gewöhnlich ein Chromosom), Beginn und Ende. Die Eingabedatei muss positionssortiert und mittels bgzip (welches eine gzip ähnliche Schnittstelle besitzt und von diesem Paket bereitgestellt wird) komprimiert sein. Nach der Indexierung ist tabix imstande zügig Datenzeilen anhand von Chromosomenkoordinten abzufragen. Schnelle Datenabfragung ist ebenfalls über ein Netzwerk möglich, wenn eine URI als Dateiname angegeben ist.

Diese Version von tabix wurde aus den HTSlib-Quellen erstellt.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm, Wissenschaft: science::calculation, use::calculating, Unterstützt Formate: HTML, Hypertext Markup Language (Hypertext-Auszeichnungssprache), Arbeitet mit: Text

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