Paketti: tabix (1.9-12~deb10u1)

[ Source: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This version of tabix is built from the HTSlib source.

Tagit: Implemented in: C, Role: Program, Tiede: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Muut pakettiin tabix liittyvät paketit

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.15)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Secure Sockets Layer -työkalupakki - jaetut kirjastot

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi tabix

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	284.8 kt	979.0 kt	[tiedostoluettelo]