Package: python3-parmed (4.3.0+dfsg-2 and others)

[ Source: parmed  ]

Filredigeringsprogram med parametre og topologi samt molekylær mekanisk simulator

ParmEd er en pakke designet til at facilitere oprettelse og nem manipulering af molekylære systemer, der er fuldt beskrevet af et fælles klassisk kraftfelt. Understøttede kraftfelter inkluderer Amber, CHARMM, AMOEBA og flere andre, der deler en lignende funktionel form (f.eks., GROMOS).

ParmEd kan læse og skrive til en bred vifte af forskellige filformater, såsom Ambers topologi- og koordinatfiler, CHARMM PSF, parametre, topologi og koordinatfiler, Tinker-parametre samt mange andre. Den udtryksfulde centrale datastruktur (klassen »Structure«) gør det nemt hurtigt og sikkeret at manipulere et kemisk system, dets underliggende topologi og fremtvinge feltparametre beskrivende dets potentielle energifunktion.

Der er to dele af ParmEd - en dokumenteret API man kan indarbejde i sine Pythonskripter og programmer, og et GUI/CLI-par for programmer der tilbyder en måde hurtigt at udføre diverse ændringer til kemiske systemer for hurtig prototyper.

API'en tilbyder også bindinger til OpenMM-biblioteket, der tillader at udføre fulde molekylære dynamiske undersøgelser via ParmEd på højtydende udstyr, såsom AMD- og NVidia-GPU'er.

Other Packages Related to python3-parmed

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

Download python3-parmed

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	4.3.0+dfsg-2+b1	18,247.1 kB	35,267.0 kB	[list of files]
arm64	4.3.0+dfsg-2+b1	18,244.7 kB	35,275.0 kB	[list of files]
ppc64el	4.3.0+dfsg-2+b1	18,246.3 kB	35,275.0 kB	[list of files]