Package: python3-pairtools (0.3.0-3.2 and others) [debports]

[ Source:  ]

Ramme til at behandle sekventeringsdata fra et Hi-C-eksperiment

Simpel og hurtig kommandolinjeramme til at behandle sekventeringsdata fra et Hi-C-eksperiment.

Behandl pair-end sekvenssammenligninger og udfør de følgende operationer:

 - Registrer ligationsforbindelser (a.k.a. Hi-C-par) i sammenlignet
   paired-end-sekvenser af Hi-C DNA-molekyler
 - Sorter .pairs-filer til analyse lokalt
 - Registrer, mærk og fjern PCR/optiske dubletter
 - Opret omfattende statistik over Hi-C-datasæt
 - Vælg Hi-C-par givet fleksibelt definerede kriterier
 - Gendan .sam-sammenligninger fra Hi-C-par

Other Packages Related to python3-pairtools

• dep: cython3

  C-udvidelser for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.16)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.11)

  dep: python3 (>= 3.10~)

• dep: python3-click

  Oprettelsessæt for kommandolinjegrænsefladen - Python 3.x

• dep: python3-nose

  Package not available

• dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

Download python3-pairtools

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
x32 (unofficial port)	0.3.0-3.2+b1	121.6 kB	405.0 kB	[list of files]