Package: r-bioc-genomicalignments (1.18.1-1) [debports]

[ Source:  ]

Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

Denne BioConductor-pakke tilbyder effektive containere til lagring og manipulering af korte avemassesammenligninger (typisk indhentet ved at sammenligne korte læsninger til en referencearvemasse). Dette inkluderer læsningsoptælling, beregning af dækning, knudepunktdetektering og arbejde med nukleotid indhold for sammenligningerne.

Other Packages Related to r-bioc-genomicalignments

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-3.5

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.8

  Package not available

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.33.4)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.15.12)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.19.11)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.13)

  BioConductor - assay-container

• rec: r-bioc-shortread (>= 1.24.0)

  GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

• rec: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

• sug: r-bioc-bsgenome

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-rtracklayer

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

Download r-bioc-genomicalignments

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	2,048.6 kB	2,867.0 kB	[list of files]