Package: garlic (1.6-3 and others)

[ Source: garlic  ]

Visualiseringsprogram for biomolekyler

Garlic er skrevet for undersøgelse af membranproteiner. Det kan bruges til at visualisere andre proteiner, samt nogle geometriske objekter. Denne version af Garlic genkender PDB-formatet i version 2.1. Garlic kan også bruges til at analysere proteinsekvenser.

Programmet afhænger kun af X-bibliotekerne, ingen andre biblioteker er krævet.

Inkluderede funktioner:

 - »Slab«-placeringen og tykkelse er synlige i et lille vindue.
 - Atomare bindinger samt atomer opfattes som uafhængige objekter der kan
   tegnes.
 - Farverne for atomer og bindinger afhænger af placering. Fem
   oversættelsesmodeller er tilgængelige (som for slab).
 - Kan vise stereobilleder.
 - Kan vise andre geometriske objekter, såsom membran.
 - Atomar information er tilgængelig for atom som musemarkøren placeres
   over. Ingen klik er krævet, bare flyt musemarkøren over strukturen!
 - Kan indlæse mere end en struktur.
 - Kan tegne Ramachandranplot, helisk hjul, Venn-diagram, gennemsnitlig
   hydrofobicitet og hydrofobisk momentplot.
 - Kommandoprompten er tilgængelig i bunden af hovedvinduet. Den kan
   vise en fejlbesked og en kommandostreng.

Tags: Field: Biology, Chemistry, User Interface: interface::commandline, interface::graphical, X Window System, Role: Program, Scope: scope::utility, uitoolkit::xlib, Purpose: Data Visualization, X Window System: Application

Other Packages Related to garlic

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386, m68k, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.28) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libx11-6

  X11 klientside bibliotek

• sug: garlic-doc

  Visualiseringsprogram for biomolekyler - dokumenter

• sug: openbabel

  Redskaber til kemisk værktøjskasse - kommandolinje

Download garlic

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.6-3	231.8 kB	961.0 kB	[list of files]
amd64	1.6-3+b1	218.3 kB	833.0 kB	[list of files]
arm64	1.6-3+b2	202.8 kB	792.0 kB	[list of files]
armhf	1.6-3	191.2 kB	596.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.6-3	205.2 kB	746.0 kB	[list of files]
i386	1.6-3	212.6 kB	868.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.6-3	263.8 kB	1,400.0 kB	[list of files]
loong64	1.6-3	217.6 kB	855.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.6-3	190.1 kB	740.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.6-3	230.6 kB	984.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.6-3	257.4 kB	1,176.0 kB	[list of files]
riscv64	1.6-3+b1	230.4 kB	708.0 kB	[list of files]
s390x	1.6-3	188.4 kB	788.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.6-3	259.7 kB	756.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.6-3	190.7 kB	787.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.6-3	216.5 kB	800.0 kB	[list of files]