Package: tabix (1.22.1+ds2-1 and others) [debports]

[ Source:  ]

Generisk indeksprogram for TAB-afgrænsede arvemassepositionsfiler

Tabix indekserer filer hvor nogle kolonner indikerer sekvenskoordinater: navn (normalt et kromosom), start og stop. Inddatafilen skal være positionssorteret og komprimeret af bgzip (tilbudt i denne pakke), som har en grænseflade der ligner gzip. Efter indeksering er tabix i stand til hurtigt at hente datalinjer efter kromosomkoordinater. Hurtig dataindhentelse fungerer også over netværk hvis en URI angives som et filnavn.

Denne pakke er bygget fra HTSlib-kilden, og tilbyder værktøjerne for bgzip, htsfile og tabix.

Other Packages Related to tabix

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6.1 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Hurtig, fuld buffer DEFLATE-baseret kompression og dekompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Tilpasset kompression for CRAM og andre

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download tabix

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.22.1+ds2-1+b1	499.2 kB	2,707.0 kB	[list of files]