Package: python3-bx (0.13.0-2 and others) [debports]

[ Source:  ]

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

• dep: libc6.1 (>= 2.11)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-lzo

  Pythonbindinger for LZO-datakompressionsbiblioteket - Python 3

• dep: python3-numpy

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-pyparsing

  Alternativ til at oprette og køre simple grammatikker - Python 3.x

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download python3-bx

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.13.0-2+b1	861.7 kB	6,922.0 kB	[list of files]