Package: mapdamage (2.2.3+dfsg-2) [debports]

[ Source:  ]

Registrering og kvantificering af skademønstre i ældre DNA-sekvenser

MapDamage er en beregningsramme skrevet i Python og R, der registrerer og kvantificerer DNA-skademønstre blandt ældre DNA-sekventeringslæsnigner oprettet af Next-Generation Sequencing-platforme.

MapDamage er udviklet af Centre for GeoGenetic af Orlandogruppen.

Other Packages Related to mapdamage

• dep: libc6.1 (>= 2.3)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libopenblas-dev

  Optimeret BLAS-bibliotek - lineær algebra (udv., meta)

  or libblas-dev

  Basic Linear Algebra Subroutines 3, statisk bibliotek

  or libatlas-base-dev

  Automatisk Tunet Lineær Algebra Software - generisk statisk

  or libblas.so

  virtual package provided by libatlas-base-dev, libblas-dev, libblis-openmp-dev, libblis-pthread-dev, libblis-serial-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev

• dep: libopenblas-dev

  Optimeret BLAS-bibliotek - lineær algebra (udv., meta)

  or liblapack-dev

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - statisk version

  or libatlas-base-dev

  Automatisk Tunet Lineær Algebra Software - generisk statisk

  or liblapack.so

  virtual package provided by libatlas-base-dev, liblapack-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-gam

  Generalized Additive Models for R

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-inline

  GNU R-pakke til indlejret C, C++, Fortran-funktioner fra R

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R-pakke for Seamless R og C++-integration

• dep: r-cran-rcppgsl

  GNU R package for integration with the GNU GSL

• dep: seqtk

  Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download mapdamage

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	49.0 kB	346.0 kB	[list of files]