Package: tiddit (3.6.1+dfsg-2 and others)

[ Source: tiddit  ]

Strukturel variant-kald

TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.

TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.

Other Packages Related to tiddit

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, armhf, i386]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-joblib

  tools to provide lightweight pipelining in Python

• dep: python3-numpy

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  Package not available

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

Download tiddit

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3.6.1+dfsg-2+b2	482.6 kB	2,384.0 kB	[list of files]
arm64	3.6.1+dfsg-2+b2	381.9 kB	2,408.0 kB	[list of files]
armhf	3.6.1+dfsg-2+b2	405.4 kB	1,752.0 kB	[list of files]
i386	3.6.1+dfsg-2+b2	420.3 kB	2,384.0 kB	[list of files]
ppc64el	3.6.1+dfsg-2+b2	408.6 kB	2,792.0 kB	[list of files]
riscv64	3.6.1+dfsg-2+b2	430.9 kB	1,680.0 kB	[list of files]