Package: python3-freecontact (1.1-10 and others)
Links for python3-freecontact
Debian Resources:
Download Source Package python-freecontact:
- [python-freecontact_1.1-10.dsc]
- [python-freecontact_1.1.orig.tar.gz]
- [python-freecontact_1.1-10.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Laszlo Kajan (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Python 3
FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).
FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.
En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.
Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.
Denne pakke indeholder Python 3-bindingen.
Other Packages Related to python3-freecontact
|
|
|
|
-
- dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [not amd64, arm64]
- Biblioteket Boost.Python Library
-
- dep: libboost-python1.83.0-py313 [not amd64, arm64]
- virtual package provided by libboost-python1.83.0
-
- dep: libboost-python1.83.0-py314 [not amd64, arm64]
- virtual package provided by libboost-python1.83.0
-
- dep: libboost-python1.90.0 (>= 1.90.0) [amd64, arm64]
- Biblioteket Boost.Python Library
-
- dep: libboost-python1.90.0-py313 [amd64, arm64]
- virtual package provided by libboost-python1.90.0
-
- dep: libboost-python1.90.0-py314 [amd64, arm64]
- virtual package provided by libboost-python1.90.0
-
- dep: libc6 (>= 2.32)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libfreecontact0t64 (>= 1.0.21)
- Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: python3 (<< 3.15)
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
- dep: python3 (>= 3.13~)
Download python3-freecontact
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.1-10+b2 | 92.0 kB | 392.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1.1-10+b2 | 86.6 kB | 408.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1.1-10+b1 | 90.8 kB | 535.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1.1-10+b1 | 91.5 kB | 351.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1.1-10+b1 | 90.0 kB | 379.0 kB | [list of files] |