Package: python3-bx (0.13.0-2 and others)

[ Source: python-bx  ]

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

• dep: libc6 (>= 2.11) [armhf, i386, s390x]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.32) [ppc64el]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-lzo

  Pythonbindinger for LZO-datakompressionsbiblioteket - Python 3

• dep: python3-numpy

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  Package not available

• dep: python3-pyparsing

  Alternativ til at oprette og køre simple grammatikker - Python 3.x

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download python3-bx

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.13.0-2+b1	919.6 kB	5,618.0 kB	[list of files]
arm64	0.13.0-2+b1	823.4 kB	6,422.0 kB	[list of files]
armhf	0.13.0-2+b1	847.8 kB	5,242.0 kB	[list of files]
i386	0.13.0-2+b1	846.2 kB	5,718.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.13.0-2+b1	885.0 kB	7,638.0 kB	[list of files]
riscv64	0.13.0-2+b1	925.7 kB	4,694.0 kB	[list of files]
s390x	0.13.0-2+b1	930.1 kB	5,636.0 kB	[list of files]