Package: lumpy-sv (0.3.1+dfsg-7 and others)

[ Source: lumpy-sv  ]

Generel sandsynlighedsramme for strukturel variantregistrering

LUMPY, en lille SV-registreringsramme, der naturligt integrerer flere SV-signaler på tværs af flere prøver. LUMPY har forbedret sensitivitet, specielt når SV-signalet er reduceret til enten data med lav dækning eller lav intra-prøve variant allel frekvens.

Other Packages Related to lumpy-sv

• dep: bamkit

  Værktøjer for fælles BAM-filmanipulationer

• dep: libbamtools2.5.3 (>= 2.5.3+dfsg)

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, ppc64el]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+git20171107.9a20658)

  Tilbyd funktionalitet for zlib C-bibliotek i en C++-iostrøm

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-numpy

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: samblaster

  Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: sambamba

  Værktøjer for arbejde med SAM/BAM-data

Download lumpy-sv

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.3.1+dfsg-7+b2	199.5 kB	673.0 kB	[list of files]
arm64	0.3.1+dfsg-7+b3	166.8 kB	677.0 kB	[list of files]
armhf	0.3.1+dfsg-7+b3	160.4 kB	483.0 kB	[list of files]
i386	0.3.1+dfsg-7+b2	217.3 kB	719.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.3.1+dfsg-7+b2	192.1 kB	805.0 kB	[list of files]
riscv64	0.3.1+dfsg-7+b4	189.2 kB	517.0 kB	[list of files]