all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  forky  ] [  sid  ]
[ Source: gmap  ]

Package: gmap (2025-07-31+ds-1 and others)

Links for gmap

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package gmap:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger

Denne pakke indeholder programmerne GMAP og GSNAP samt redskaber til at håndtere genomdatabaser i GMAP/GSNAP-formatet. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) er et værktøj til at sammenligne EST-, mRNA- og cDNA-sekvenser. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) er et værktøj til at sammenligne single-end og paired-end transkriptom-læsninger. Begge værktøjer kan bruge en database med

 * kendte splice-sider og identify novel splice-sider
 * kendte single-nucleotide polymorphisms (SNPs)
GSNAP kan sammenligne bisulfit-behandlet DNA.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to gmap

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download gmap

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 2025-07-31+ds-1 35,600.9 kB269,708.0 kB [list of files]
arm64 2025-07-31+ds-1+b1 6,970.4 kB61,224.0 kB [list of files]
armhf 2025-07-31+ds-1 4,889.4 kB44,881.0 kB [list of files]
i386 2025-07-31+ds-1 5,133.3 kB46,585.0 kB [list of files]
ppc64el 2025-07-31+ds-1 7,144.1 kB63,848.0 kB [list of files]
riscv64 2025-07-31+ds-1 6,331.5 kB59,216.0 kB [list of files]