Package: murasaki-mpi (1.68.6-8 and others)

[ Source: murasaki  ]

Afsløringsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer - MPI-udgave

Murasaki er en skalerbar og hurtig, sprog teoribaseret afsløringsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer. Det gør det muligt at lave sammenligninger for hele genomer skalere gennem flere genomer. Understøtter ubegrænset længde gapped-seed-mønstre og unikke TF-IDF-baseret filtrering.

Murasaki er et anker-sammenligningsprogram som er

  * Ekstremt hurtigt (17 CPU-timer for et helt menneske x mus-genom (med
    40 knuder: 52 vægminutter))
  * Skalerbar (Kan arbitrært parallelliseres tværs af flere knuder ved
    hjælp af MPI. Selv en enkelt knude med 16 GB ram kan håndtere mere end
    1GBP sekvens)
  * Ubegrænset længdemønster
  * Gentag tolerant
  * Intelligent støjreduktion

Denne pakke indeholder MPI-aktiverede binære filer til Murasaki. Mens dette vil fremskynde operation på maskiner med flere processorer, så vil det bremse på en enkelt processor.

Other Packages Related to murasaki-mpi

• dep: libboost-filesystem1.67.0

  filsystemhandlinger (flytbare stier, iteration over mappere etc.) i C++

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  Bibliotek for Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)

  Regulært udtryksbibliotek for C++

• dep: libboost-system1.67.0

  bibliotek til operativsystem (eksempelvis diagnostisk understøttelse)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]

• dep: libcrypto++6

  Alment kryptografisk bibliotek - delt bibliotek

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libopenmpi3

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: murasaki-common

  Detektionsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer - fælles filer

Download murasaki-mpi

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.68.6-8+b1	614.8 kB	4,026.0 kB	[list of files]
arm64	1.68.6-8+b1	548.8 kB	3,862.0 kB	[list of files]
armhf	1.68.6-8+b1	417.4 kB	2,024.0 kB	[list of files]
i386	1.68.6-8+b1	625.1 kB	3,900.0 kB	[list of files]