Пакет: murasaki-mpi (1.68.6-8 и другие)
Ссылки для murasaki-mpi
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код murasaki:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
Подобные пакеты:
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.
Другие пакеты, относящиеся к murasaki-mpi
|
|
|
|
-
- dep: libboost-filesystem1.67.0
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
-
- dep: libboost-iostreams1.67.0
- библиотека Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)
- regular expression library for C++
-
- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
-
- dep: libcrypto++6
- General purpose cryptographic library - shared library
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
-
- dep: libopenmpi3
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
Загрузка murasaki-mpi
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
amd64 | 1.68.6-8+b1 | 614,8 Кб | 4 026,0 Кб | [список файлов] |
arm64 | 1.68.6-8+b1 | 548,8 Кб | 3 862,0 Кб | [список файлов] |
armhf | 1.68.6-8+b1 | 417,4 Кб | 2 024,0 Кб | [список файлов] |
i386 | 1.68.6-8+b1 | 625,1 Кб | 3 900,0 Кб | [список файлов] |