Package: fastx-toolkit (0.0.14-6)

[ Source: fastx-toolkit  ]

forbehandlingsværktøjer til læsning af korte FASTQ/A-nukleotider

FASTX-Toolkit er en samling af kommandolinjeværktøjer for forbehandling af korte nukleotidlæsninger i FASTA- og FASTQ-formater, normalt udarbejdet af Next-Generation sekvensmaskiner. Hovedbehandlingen af sådanne FASTA/FASTQ-filer er oversættelse (justering) af sekvenserne til referencegenomer eller andre databaser der bruger specialiserede programmer såsom BWA, Bowtie og mange andre. Det er dog undertiden mere produktivt at forbehandle FASTA/FASTQ-filerne, forud for oversættelse af sekvenserne til genom-manipulering, for at fremstille bedre oversættelsesresultater. FASTX-Toolkit-værktøjer udfører nogle af disse forbehandlingsopgaver.

Tags: Role: Program

Other Packages Related to fastx-toolkit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgd-graph-perl

  Graph Plotting Module for Perl 5

• dep: libgtextutils0v5

  Gordon Text_utils-bibliotek

• dep: libperlio-gzip-perl

  Modul der tilbyder et PerlIO-lag til gzip/gunzip

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download fastx-toolkit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	109.8 kB	615.0 kB	[list of files]
arm64	108.0 kB	553.0 kB	[list of files]
armhf	104.6 kB	468.0 kB	[list of files]
i386	111.7 kB	604.0 kB	[list of files]