Package: phast (1.4+dfsg-1)

[ Source: phast  ]

Fylogenetisk analyse med rum/tid-modeller

PHAST er en programpakke for sammenlignende og evolutionær genomik. Består af omkring et halvt dusin hovedprogrammer, samt mere end et dusin redskaber til at manipulere sekvenssammenligninger, fylogenetiske træer og genomikannotationer. For hovedparten fokuserer PHAST på to slags programmer: Identifikationen af begyndende funktionelle elementer, inklusive protein-kodede exoner og evolutionært bevarede sekvenser; og statisk fylogenetisk modelopbygning, inklusive estimering af modelparametre, registrering af signaturer for markering og rekonstruktion af arvelige sekvenser.

PHAST understøtter ikke rekonstruktion eller sekvenssammenligning for fylogeni og er kun designet for brug med DNA-sekvenser (se Comparison).

Other Packages Related to phast

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libpcre3

  Ældre Perl 5-kompatibelt regulært udtryksbibliotek - kørselstidsfiler

• dep: libtmglib3

  Testmatrixoprettere for LAPACK - delt version

Download phast

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,270.0 kB	29,066.0 kB	[list of files]