Package: r-bioc-rgsepd (1.22.0-1)

[ Source: r-bioc-rgsepd  ]

GNU R - gensætberigelse/projektionsvisninger

R/GSEPD er en bioinformatics-pakke for R til at hjælpe med at utvetydige transkriptomprøver (en matrix af RNA-Seq-tal ved transskriptions-id'er) ved at automatisere differentielt udtryk (med DESeq2), derefter gensætberigelse (med GOSeq), og til sidst en N-dimensionel projektion for at kvantificere, på hvilke måder hver prøve er som hver behandlingsgruppe.

Other Packages Related to r-bioc-rgsepd

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biomart

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• dep: r-bioc-deseq2

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• dep: r-bioc-go.db

  Annotationskort der beskriver hele genontologien

• dep: r-bioc-goseq (>= 1.28)

  GNU r-genontologianalyseprogram for RNA-seq og andre længdeforstyrrede data

• dep: r-bioc-org.hs.eg.db

  Genom-bred annotation for mennesker

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor - assay-container

• dep: r-cran-gplots

  GNU R-pakke med værktøjer for plot af data af Greg Warnes m.fl.

• dep: r-cran-hash

  GNU R full feature implementation of hash/associated arrays/dictionaries

• sug: r-bioc-biocgenerics

  Generiske funktioner for Bioconductor

• sug: r-cran-boot

  GNU R-pakke for bootstrapping-funktioner fra Davison og Hinkley

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-xtable

  Gennemtvinger omdannelse af GNU R-data til tabeller i LaTex og HTML

Download r-bioc-rgsepd

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	1,329.2 kB	1,438.0 kB	[list of files]