Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-14 and others)

[ Source: tree-puzzle  ]

Paralelizovaná rekonstrukce fylogenetických stromů na základě maximální věrohodnosti

TREE-PUZZLE (nové jméno PUZZLE) je interaktivní konzolový program, který obsahuje rychlý algoritmus prohledávání stromu, quartet puzzling, který umožňuje analýzu rozsáhlých datových množin a automatické přiřazení jednotlivých odhadů. TREE-PUZZLE také vypočítá pravděpodobnost maximální vzdálenosti stejně jako délku větví uživatelem určených stromů. Délku větví je možno spočítat také podle časových předpokladů. Kromě toho, TREE-PUZZLE nabízí novou metodu, pravděpodobnostní mapování, sloužící k vyšetření hypotézy interní větve bez nutnosti vypočítání celého stromu a také k vizualizaci fylogenetického obsahu a sekvenčního uspořádání.

Toto je paralelizovaná verze tree-puzzle.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.38) [not i386]

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [i386]

• dep: libmpich12 [armhf, i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.9) [not armhf, i386]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Package not available

Download tree-ppuzzle

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	5.3~rc16+dfsg-14	183.5 kB	436.0 kB	[list of files]
arm64	5.3~rc16+dfsg-14+b1	165.3 kB	429.0 kB	[list of files]
armhf	5.3~rc16+dfsg-14	167.7 kB	363.0 kB	[list of files]
i386	5.3~rc16+dfsg-14	197.8 kB	543.0 kB	[list of files]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-14	196.1 kB	556.0 kB	[list of files]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-14	183.3 kB	372.0 kB	[list of files]
s390x	5.3~rc16+dfsg-14	196.9 kB	491.0 kB	[list of files]