Paket: fastlink (4.1P-fix100+dfsg-5)

[ Källkod: fastlink  ]

faster version of pedigree programs of Linkage

Genetic linkage analysis is a statistical technique used to map genes and find the approximate location of disease genes. There was a standard software package for genetic linkage called LINKAGE. FASTLINK is a significantly modified and improved version of the main programs of LINKAGE that runs much faster sequentially, can run in parallel, allows the user to recover gracefully from a computer crash, and provides abundant new documentation. FASTLINK has been used in over 1000 published genetic linkage studies.

This package contains the following programs:

 ilink:    GEMINI optimization procedure to find a locally
           optimal value of the theta vector of recombination
           fractions
 linkmap:  calculates location scores of one locus against a
           fixed map of other loci
 lodscore: compares likelihoods at locally optimal theta
 mlink:    calculates lod scores and risk with two of more loci
 unknown:  identify possible genotypes for unknowns

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Behöver ett märke till, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med fastlink

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: fastlink-doc

  Some papers about fastlink

Hämta fastlink

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	234,0 kbyte	1.035,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	250,3 kbyte	859,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	235,0 kbyte	1.035,0 kbyte	[filförteckning]
armel	238,8 kbyte	922,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	226,2 kbyte	662,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	223,4 kbyte	795,0 kbyte	[filförteckning]
i386	248,1 kbyte	902,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	287,9 kbyte	1.614,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	228,6 kbyte	822,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	237,9 kbyte	1.067,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	253,3 kbyte	1.227,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	253,7 kbyte	1.099,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	267,5 kbyte	795,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	281,7 kbyte	1.083,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	265,1 kbyte	1.034,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	229,6 kbyte	5.264,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	245,4 kbyte	806,0 kbyte	[filförteckning]