Пакет: fastlink (4.1P-fix100+dfsg-5)

[ Источник: fastlink  ]

faster version of pedigree programs of Linkage

Genetic linkage analysis is a statistical technique used to map genes and find the approximate location of disease genes. There was a standard software package for genetic linkage called LINKAGE. FASTLINK is a significantly modified and improved version of the main programs of LINKAGE that runs much faster sequentially, can run in parallel, allows the user to recover gracefully from a computer crash, and provides abundant new documentation. FASTLINK has been used in over 1000 published genetic linkage studies.

This package contains the following programs:

 ilink:    GEMINI optimization procedure to find a locally
           optimal value of the theta vector of recombination
           fractions
 linkmap:  calculates location scores of one locus against a
           fixed map of other loci
 lodscore: compares likelihoods at locally optimal theta
 mlink:    calculates lod scores and risk with two of more loci
 unknown:  identify possible genotypes for unknowns

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, use::comparing, Поддерживаемые форматы: Требуется дополнительный тег, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к fastlink

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: fastlink-doc

  Some papers about fastlink

Загрузка fastlink

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	234,0 Кб	1 035,0 Кб	[список файлов]
amd64	250,3 Кб	859,0 Кб	[список файлов]
arm64	235,0 Кб	1 035,0 Кб	[список файлов]
armel	238,8 Кб	922,0 Кб	[список файлов]
armhf	226,2 Кб	662,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	223,4 Кб	795,0 Кб	[список файлов]
i386	248,1 Кб	902,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	287,9 Кб	1 614,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	228,6 Кб	822,0 Кб	[список файлов]
mips64el	237,9 Кб	1 067,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	253,3 Кб	1 227,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	253,7 Кб	1 099,0 Кб	[список файлов]
riscv64	267,5 Кб	795,0 Кб	[список файлов]
s390x	281,7 Кб	1 083,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	265,1 Кб	1 034,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	229,6 Кб	5 264,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	245,4 Кб	806,0 Кб	[список файлов]