[ trixie ]
[ sid ]
[ Zdroj: bifrost ]
Balík: libbifrost-dev (1.3.1-1)
Odkazy pre libbifrost-dev
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík bifrost:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
static library and header files for libbifrost
Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.
* Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph * No need to build the uncompacted de Bruijn graph * Reads or assembled genomes as input * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary * Graph cleaning: short tip clipping, etc. * Multi-threaded * No parameters to estimate with other tools * Exact or approximate k-mer search of queries
Ostatné balíky súvisiace s balíkom libbifrost-dev
|
|
|
|
-
- dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1)
- library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs
Stiahnuť libbifrost-dev
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
alpha (neoficiálny port) | 637.5 kB | 5,213.0 kB | [zoznam súborov] |
amd64 | 588.8 kB | 3,858.0 kB | [zoznam súborov] |
arm64 | 556.6 kB | 3,837.0 kB | [zoznam súborov] |
ia64 (neoficiálny port) | 727.4 kB | 5,395.0 kB | [zoznam súborov] |
mips64el | 612.3 kB | 4,463.0 kB | [zoznam súborov] |
ppc64 (neoficiálny port) | 603.5 kB | 4,167.0 kB | [zoznam súborov] |
ppc64el | 619.4 kB | 4,138.0 kB | [zoznam súborov] |
riscv64 | 1,790.5 kB | 18,705.0 kB | [zoznam súborov] |
s390x | 610.5 kB | 4,019.0 kB | [zoznam súborov] |
sparc64 (neoficiálny port) | 536.7 kB | 3,889.0 kB | [zoznam súborov] |