Package: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3 and others)

[ Source: pbsim  ]

simulatore per letture di sequenziamento PacBio

I sequenziatori di DNA PacBio producono due tipi di letture caratteristiche: CCS (corte e con basso tasso d'errore) e CLR (lunghe e con alto tasso d'errore), che possono essere entrambe utili per l'assemblaggio de novo di genomi. PBSIM simula tali letture PacBio da una sequenza di riferimento usando una simulazione basata su modello o su campionamento. Le letture simulate sono utili, ad esempio, quando si sviluppano o valutano assemblatori di sequenza pensati per dati PacBio.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Role: Program, Purpose: use::simulating, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to pbsim

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.9 kB	100.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.1 kB	120.0 kB	[list of files]
armel	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.5 kB	91.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23.9 kB	83.0 kB	[list of files]
i386	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25.8 kB	99.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25.4 kB	122.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	27.1 kB	120.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	25.0 kB	89.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23.6 kB	92.0 kB	[list of files]