Package: macs (3.0.1-2)

[ Source: macs  ]

analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

Other Packages Related to macs

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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  dep: python3 (<< 3.13)

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	4,425.1 kB	14,386.0 kB	[list of files]
arm64	3,924.4 kB	14,472.0 kB	[list of files]
armel	3,938.0 kB	13,353.0 kB	[list of files]
armhf	4,036.1 kB	10,033.0 kB	[list of files]
i386	4,419.1 kB	15,630.0 kB	[list of files]
ppc64el	4,251.0 kB	17,997.0 kB	[list of files]
s390x	4,265.3 kB	14,839.0 kB	[list of files]