Package: r-bioc-rsamtools (2.14.0-1)

[ Source: r-bioc-rsamtools  ]

allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

Questo pacchetto fornisce un'interfaccia alle utilità "samtools", "bcftools" e "tabix" per la manipolazione di SAM (Sequence Alignment / Map), BCF (binary variant call) e file delimitati da tab indicizzati e compressi (tabix).

Other Packages Related to r-bioc-rsamtools

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)

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  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

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• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

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• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

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• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

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• dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)

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• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

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• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-bitops

  pacchetto GNU R che implementa operazioni bit a bit

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-genomicalignments

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• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

  classi e metodi GNU R per grosse moli di dati di sequenziamento short-read

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,667.0 kB	5,744.0 kB	[list of files]
arm64	3,623.2 kB	5,696.0 kB	[list of files]
armel	3,594.5 kB	5,629.0 kB	[list of files]
armhf	3,599.6 kB	5,373.0 kB	[list of files]
i386	3,712.8 kB	5,897.0 kB	[list of files]
mips64el	3,623.9 kB	5,946.0 kB	[list of files]
mipsel	3,638.2 kB	5,876.0 kB	[list of files]
ppc64el	3,711.2 kB	6,144.0 kB	[list of files]
s390x	3,626.6 kB	5,828.0 kB	[list of files]