Paket: libbio-db-hts-perl (3.01-4 und andere)

[ Quellcode: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

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  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nicht amd64, arm64, ppc64el]

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• dep: perl (>= 5.36.0-4)

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• dep: perlapi-5.36.0

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• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

libbio-db-hts-perl herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	3.01-4+b1	153,2 kB	444,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	3.01-4+b1	147,7 kB	487,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	3.01-4+b1	149,8 kB	487,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	3.01-4+b1	149,0 kB	487,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	3.01-4+b1	154,5 kB	459,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	3.01-4+b1	143,2 kB	560,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	3.01-4+b1	143,4 kB	558,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	3.01-4+b1	150,9 kB	552,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	3.01-4+b1	150,3 kB	457,0 kB	[Liste der Dateien]