Package: quorum (1.1.2-2 and others)

[ Source: quorum  ]

QUality Optimized Reads of genomic sequences

QuorUM giver mulighed for at opnå trimmede og fejlkorrigerede læsninger, der resulterer i samlinger med længere contigs og færre fejl. QuorUM giver bedst ydeevne sammenlignet med andre offentliggjorte fejlkorrektorer i flere målinger. QuorUM implementeres effektivt ved at benytte nuværende multi-kerne beregningsarkitekturer, og den er velegnet til store datasæt (1 milliarder baser kontrolleres og korrigeres pr. dag pr. kerne). Tredjepartsassembleren (SOAPdenovo) har signifikant fordel af at bruge QuorUM-fejlkorrigerede læsninger. QuorUM-fejlkorrigerede læsninger resulterer i en faktor på 1,1 til 4 i forbedring i N50-contigstørrelse sammenlignet med de oprindelige læsninger med SOAPdenovo for de undersøgte datasæt.

Other Packages Related to quorum

• dep: libc6 (>= 2.34) [not ia64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not ia64, riscv64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0) [amd64, arm64, ia64]

  Tæl k-mers i DNA-sekvenser - dynamisk bibliotek for jellyfish

  dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.1) [mips64el, ppc64el, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not ia64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

Download quorum

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.1.2-2	114.5 kB	400.0 kB	[list of files]
arm64	1.1.2-2	109.4 kB	556.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.1.1-5	136.1 kB	620.0 kB	[list of files]
mips64el	1.1.2-2+b2	115.7 kB	572.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.1.2-2+b2	116.7 kB	557.0 kB	[list of files]
riscv64	1.1.2-2+b2	114.6 kB	341.0 kB	[list of files]