Пакет: abyss (2.1.5-7)

[ Източник: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Етикети: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Други пакети, свързани с abyss

• dep: bsdmainutils

  collection of more utilities from FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  GCC support library

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Изтегляне на abyss

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	2 885,5 кБ	8 774,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2 716,8 кБ	8 114,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2 724,5 кБ	6 470,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2 960,8 кБ	9 334,0 кБ	[списък на файловете]