Пакет: r-bioc-oligo (1.62.2+ds-1)

[ Източник: r-bioc-oligo  ]

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

Други пакети, свързани с r-bioc-oligo

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  виртуален пакет, предлаган от r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  виртуален пакет, предлаган от r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

  Affymetrix File Parsing SDK

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

  BioConductor tools for parsing Affymetrix data files

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

  Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

  BioConductor collection of pre-processing functions

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  GNU R package providing a generic database interface

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-limma

  linear models for microarray data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Изтегляне на r-bioc-oligo

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	898,6 кБ	1 343,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	897,3 кБ	1 355,0 кБ	[списък на файловете]
armel	897,6 кБ	1 334,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	895,5 кБ	1 322,0 кБ	[списък на файловете]
i386	900,4 кБ	1 346,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	896,4 кБ	1 358,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	896,3 кБ	1 357,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	900,7 кБ	1 355,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	897,4 кБ	1 343,0 кБ	[списък на файловете]