Пакет: cd-hit (4.8.1-4)

[ Източник: cd-hit  ]

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Други пакети, свързани с cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на cd-hit

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	510,3 кБ	1 411,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	493,8 кБ	1 309,0 кБ	[списък на файловете]
armel	491,0 кБ	1 319,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	487,6 кБ	1 111,0 кБ	[списък на файловете]
i386	511,4 кБ	1 477,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	510,9 кБ	1 588,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	511,2 кБ	1 541,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	508,7 кБ	1 813,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	496,6 кБ	1 429,0 кБ	[списък на файловете]