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相似套件:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

標籤: 生物學: 核酸, 領域: 生物學, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, 使用者介面: 命令行, 角色: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

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armhf 0.2+dfsg-2+b1 26。6 kB55。0 kB [檔案列表]
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ppc64el 0.2+dfsg-2+b1 27。8 kB83。0 kB [檔案列表]
s390x 0.2+dfsg-2+b1 28。2 kB75。0 kB [檔案列表]