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套件:zalign(0.9.1-4)

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parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

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下載可用於所有硬體架構的
硬體架構 套件大小 安裝後大小 檔案
alpha (非官方移植版) 52。4 kB290。0 kB [檔案列表]
amd64 47。1 kB279。0 kB [檔案列表]
arm64 44。7 kB263。0 kB [檔案列表]
armel 25。3 kB117。0 kB [檔案列表]
armhf 26。1 kB97。0 kB [檔案列表]
hppa (非官方移植版) 50。6 kB329。0 kB [檔案列表]
i386 47。9 kB265。0 kB [檔案列表]
m68k (非官方移植版) 48。3 kB269。0 kB [檔案列表]
mips64el 50。7 kB558。0 kB [檔案列表]
mipsel 49。1 kB318。0 kB [檔案列表]
powerpcspe (非官方移植版) 47。2 kB285。0 kB [檔案列表]
ppc64 (非官方移植版) 50。9 kB415。0 kB [檔案列表]
ppc64el 49。9 kB415。0 kB [檔案列表]
riscv64 (非官方移植版) 45。9 kB241。0 kB [檔案列表]
s390x 46。0 kB295。0 kB [檔案列表]
sh4 (非官方移植版) 47。7 kB237。0 kB [檔案列表]
sparc64 (非官方移植版) 44。1 kB283。0 kB [檔案列表]
x32 (非官方移植版) 48。1 kB249。0 kB [檔案列表]