[ 原始碼: samtools ]
套件:samtools(1.19.2-1 以及其他的)
samtools 的相關連結
Debian 的資源:
下載原始碼套件 samtools:
維護小組:
- Debian Med Packaging Team (QA 頁面, 郵件存檔)
- Charles Plessy (QA 頁面)
- Andreas Tille (QA 頁面)
- Étienne Mollier (QA 頁面)
外部的資源:
- 主頁 [www.htslib.org]
相似套件:
processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.
其他與 samtools 有關的套件
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]
- GNU C 函式庫:共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 函式庫:共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libncurses6 (>= 6)
- shared libraries for terminal handling
-
- dep: libtinfo6 (>= 6)
- shared low-level terminfo library for terminal handling
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [除 armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]
-
- sug: cwltool
- Common Workflow Language reference implementation
下載 samtools
硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
---|---|---|---|---|
alpha (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 626。8 kB | 1,800。0 kB | [檔案列表] |
amd64 | 1.19.2-1+b1 | 630。1 kB | 1,393。0 kB | [檔案列表] |
arm64 | 1.19.2-1+b1 | 602。6 kB | 1,669。0 kB | [檔案列表] |
armel | 1.19.2-1+b1 | 596。5 kB | 1,318。0 kB | [檔案列表] |
armhf | 1.19.2-1+b1 | 599。6 kB | 1,134。0 kB | [檔案列表] |
hppa (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 627。8 kB | 1,355。0 kB | [檔案列表] |
i386 | 1.19.2-1+b1 | 665。6 kB | 1,518。0 kB | [檔案列表] |
ia64 (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 716。1 kB | 2,112。0 kB | [檔案列表] |
m68k (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 607。6 kB | 1,342。0 kB | [檔案列表] |
mips64el | 1.19.2-1+b1 | 609。1 kB | 1,819。0 kB | [檔案列表] |
ppc64 (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 647。0 kB | 1,925。0 kB | [檔案列表] |
ppc64el | 1.19.2-1+b1 | 656。9 kB | 1,925。0 kB | [檔案列表] |
riscv64 | 1.19.2-1+b1 | 640。5 kB | 1,265。0 kB | [檔案列表] |
s390x | 1.19.2-1+b1 | 637。7 kB | 1,469。0 kB | [檔案列表] |
sh4 (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 687。0 kB | 1,600。0 kB | [檔案列表] |
sparc64 (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 596。4 kB | 7,761。0 kB | [檔案列表] |
x32 (非官方移植版) | 1.19.2-1+b1 | 635。4 kB | 1,358。0 kB | [檔案列表] |