套件：probcons（1.12-14 以及其他的）

[ 原始碼： probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 實做語言: implemented-in::c++, interface::commandline, 角色: 程式, 範圍: 實用程式, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, 處理: 需要一個額外的標籤

其他與 probcons 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.27) [除 alpha, ia64, riscv64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [除 armel, armhf, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

下載 probcons

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.12-14	142。6 kB	418。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.12-14	116。4 kB	377。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.12-14	109。1 kB	328。0 kB	[檔案列表]
armel	1.12-14	105。1 kB	347。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.12-14	103。2 kB	255。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.12-14	128。9 kB	366。0 kB	[檔案列表]
i386	1.12-14	102。4 kB	367。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.12-14	191。0 kB	741。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.12-14	96。7 kB	367。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.12-14	129。1 kB	410。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.12-14	134。5 kB	481。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.12-14	136。2 kB	417。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.12-14+b1	131。1 kB	303。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.12-14	99。7 kB	376。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.12-14	131。4 kB	312。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.12-14	117。5 kB	374。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.12-14	122。0 kB	371。0 kB	[檔案列表]