套件：pirs（2.0.2+dfsg-12 以及其他的）

[ 原始碼： pirs  ]

Profile based Illumina pair-end Reads Simulator

The program pIRS can be used for simulating Illumina PE reads, with a series of characters generated by Illumina sequencing platform, such as insert size distribution, sequencing error(substitution, insertion, deletion), quality score and GC content-coverage bias.

The insert size follows a normal distribution, so users should set the mean value and standard deviation. Usually the standard deviation is set as 1/20 of the mean value. The normal distribution by Box-Muller method is simulated.

The program simulates sequencing error, quality score and GC content- coverage bias according to the empirical distribution profile. Some default profiles counted from lots of real sequencing data are provided.

To simulate reads from diploid genome, users should simulate the diploid genome sequence firstly by setting the ratio of heterozygosis SNP, heterozygosis InDel and structure variation.

其他與 pirs 有關的套件

• dep: fonts-liberation

  fonts with the same metrics as Times, Arial and Courier

• dep: gnuplot [x32]

  Command-line driven interactive plotting program.
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• dep: gnuplot-qt [除 x32]

  Command-line driven interactive plotting program. QT-package

  或者 gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]

  套件暫時不可用

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libgzstream0 [x32]

  provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream

  dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg) [除 x32]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 x32]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: pirs-profiles

  profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (profile data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 pirs

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	112。4 kB	424。0 kB	[檔案列表]
amd64	2.0.2+dfsg-12	116。7 kB	390。0 kB	[檔案列表]
arm64	2.0.2+dfsg-12	106。7 kB	422。0 kB	[檔案列表]
armel	2.0.2+dfsg-12	102。8 kB	352。0 kB	[檔案列表]
armhf	2.0.2+dfsg-12	102。6 kB	304。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	115。1 kB	371。0 kB	[檔案列表]
i386	2.0.2+dfsg-12	122。5 kB	392。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	134。5 kB	566。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	113。6 kB	396。0 kB	[檔案列表]
mips64el	2.0.2+dfsg-12	115。4 kB	432。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	118。0 kB	486。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	2.0.2+dfsg-12	117。0 kB	422。0 kB	[檔案列表]
riscv64	2.0.2+dfsg-12+b1	112。9 kB	335。0 kB	[檔案列表]
s390x	2.0.2+dfsg-12	113。8 kB	390。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	127。7 kB	421。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-12	104。6 kB	2，219。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	2.0.2+dfsg-6	110。1 kB	377。0 kB	[檔案列表]