套件：bppsuite（2.4.1-7）

[ 原始碼： bppsuite  ]

Bio++ program suite

The Bio++ Program Suite is a package of programs using the Bio++ libraries and dedicated to Phylogenetics and Molecular Evolution. All programs are independent, but can be combined to perform rather complex analyses. These programs use the interface helper tools of the libraries, and hence share the same syntax. They also have several options in common, which may also be shared by third-party software.

The following programs are included:

 - BppML for maximum likelihood analysis,
 - BppSeqGen for sequences simulation,
 - BppAncestor for ancestral states reconstruction,
 - BppDist for distance methods,
 - BppPars for parsimony analysis,
 - BppSeqMan for file conversion and sequence manipulation,
 - BppConsense for building consensus tree and computing
   bootstrap values,
 - BppReRoot for tree rerooting.
 - BppTreeDraw for tree drawing.
 - BppAlnScore for comparing alignments and computing alignment scores.
 - BppMixedLikelihoods for computing site per site likelihoods of
   components of mixture models.
 - BppPopGen for population genetics analyses.

其他與 bppsuite 有關的套件

• dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Core library

• dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Phylogenetic library

• dep: libbpp-popgen8t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Population Genetics library

• dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Sequence library

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 alpha]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: bppsuite-examples

  Examples for Bio++ program suite

下載 bppsuite

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	372。9 kB	2，439。0 kB	[檔案列表]
amd64	379。9 kB	2，002。0 kB	[檔案列表]
arm64	354。2 kB	2，422。0 kB	[檔案列表]
armel	321。6 kB	1，606。0 kB	[檔案列表]
armhf	328。6 kB	1，326。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	391。4 kB	2，024。0 kB	[檔案列表]
i386	386。4 kB	1，830。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	386。9 kB	2，965。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	367。7 kB	1，794。0 kB	[檔案列表]
mips64el	346。9 kB	2，606。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	380。2 kB	2，806。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	376。2 kB	2，614。0 kB	[檔案列表]
riscv64	363。1 kB	1，670。0 kB	[檔案列表]
s390x	359。2 kB	1，994。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	402。9 kB	2，166。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	332。2 kB	12，453。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	377。5 kB	1，742。0 kB	[檔案列表]