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软件包: apbs (1.3.0-2)

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自适应泊松玻尔兹曼求解程序

APBS 是一个求解泊松-玻尔兹曼方程(PBE)的数值算法软件包,使用最流行的连续模型来 描述盐或者水溶剂中溶质分子间的静电相互作用。连续静电学在生物分子模拟领域中扮演 许多重要角色,包括:

 * 模拟扩散过程来确定蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质结合的动力学,
 * 生物分子的隐式溶剂分子动力学
 * 溶剂化能和绑定能的计算来确定配体-蛋白质,蛋白质-蛋白质平衡绑定常量,以及
辅助合理药物设计,
 * 生物分子滴定研究。

APBS 旨在高效地评估各种不同长度尺度分子的模拟中的静电特性,这使得对于包括几十 直至成千上万的原子的分子的研究成为可能。

标签: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

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