软件包：tvc（5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 以及其他的）

[ 源代码： tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

其他与 tvc 有关的软件包

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [除 riscv64]

  streamlined C++ linear algebra library

  dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.7+dfsg) [riscv64]

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libblas3 [sparc64]

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  或者 libblas.so.3

  本虚包由这些包填实： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  或者 liblapack.so.3

  本虚包由这些包填实： libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 alpha]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  压缩库 - 运行时

下载 tvc

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,025.9 kB	3,734.0 kB	[文件列表]
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,072.7 kB	3,449.0 kB	[文件列表]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	982.0 kB	3,349.0 kB	[文件列表]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	955.0 kB	3,133.0 kB	[文件列表]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	968.4 kB	2,665.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,014.0 kB	3,227.0 kB	[文件列表]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,102.7 kB	3,496.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,176.5 kB	5,139.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	957.1 kB	3,232.0 kB	[文件列表]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	991.3 kB	3,753.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,054.8 kB	3,935.0 kB	[文件列表]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,065.0 kB	3,733.0 kB	[文件列表]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,040.2 kB	2,937.0 kB	[文件列表]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,049.4 kB	3,500.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,045.5 kB	3,088.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	951.6 kB	5,541.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,058.6 kB	3,323.0 kB	[文件列表]