软件包：hts-nim-tools（0.2.1-1 以及其他的）

[ 源代码： hts-nim-tools  ]

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

其他与 hts-nim-tools 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.29) [除 riscv64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: nim-hts-dev

  wrapper for hts C library

下载 hts-nim-tools

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	0.2.1-1	198.0 kB	864.0 kB	[文件列表]
arm64	0.2.1-1	164.6 kB	844.0 kB	[文件列表]
armel	0.2.1-1	182.9 kB	832.0 kB	[文件列表]
armhf	0.2.1-1	182.9 kB	604.0 kB	[文件列表]
i386	0.2.1-1	186.0 kB	843.0 kB	[文件列表]
mips64el	0.2.1-1	137.8 kB	951.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.2.1-1	155.9 kB	981.0 kB	[文件列表]
ppc64el	0.2.1-1	158.6 kB	916.0 kB	[文件列表]
riscv64	0.2.1-1+b1	158.8 kB	573.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.2.1-1	135.8 kB	944.0 kB	[文件列表]