软件包：grabix（0.1.7-4 以及其他的）

[ 源代码： grabix  ]

wee tool for random access into BGZF files

In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.

grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.

其他与 grabix 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [除 armel, armhf, hppa, m68k]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [除 riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: tabix

  generic indexer for TAB-delimited genome position files

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  压缩库 - 运行时

下载 grabix

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	0.1.7-4	15.0 kB	92.0 kB	[文件列表]
amd64	0.1.7-4	14.4 kB	56.0 kB	[文件列表]
arm64	0.1.7-4	13.9 kB	92.0 kB	[文件列表]
armel	0.1.7-4	15.5 kB	91.0 kB	[文件列表]
armhf	0.1.7-4	14.9 kB	91.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	0.1.7-4	16.4 kB	52.0 kB	[文件列表]
i386	0.1.7-4	15.7 kB	55.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	0.1.7-4	16.9 kB	63.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	0.1.7-4	26.4 kB	108.0 kB	[文件列表]
mips64el	0.1.7-4	14.8 kB	93.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.1.7-4	15.0 kB	92.0 kB	[文件列表]
ppc64el	0.1.7-4	14.7 kB	92.0 kB	[文件列表]
riscv64	0.1.7-4+b1	14.4 kB	49.0 kB	[文件列表]
s390x	0.1.7-4	13.8 kB	52.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	0.1.7-4	27.9 kB	148.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.1.7-4	13.9 kB	1,054.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	0.1.7-4	14.4 kB	51.0 kB	[文件列表]