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bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.

The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.

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armel 1.0.11-7+b1 647.5 kB2,405.0 kB [文件列表]
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mips64el 1.0.11-7+b1 715.9 kB4,826.0 kB [文件列表]
mipsel 1.0.11-7+b1 709.6 kB3,701.0 kB [文件列表]
ppc64el 1.0.11-7+b1 844.4 kB4,328.0 kB [文件列表]
s390x 1.0.11-7+b1 740.4 kB3,555.0 kB [文件列表]